| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 376,401 | 0 | T | G | 22.2% | 147.7 / 13.7 | 72 | L315V (TTG→GTG) | mhpT | 3‑hydroxyphenylpropionate/3‑ hydroxycinnamate:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (19/37); new base G (16/0); total (35/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.86e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGTTGGGCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTGGCCGGGA > NC_000913/376264‑376539 | tGTTGGGCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTTGCGCGGGggtg > 2:548969/1‑140 (MQ=255)tGTTGGGCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGgttg > 2:283898/1‑140 (MQ=255) gTTGGGCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGgttgt < 2:96649/140‑1 (MQ=255) gggCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTGTCGCGGGGGTGtttt > 2:1131198/1‑139 (MQ=255) gcgcATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCg > 1:451756/1‑140 (MQ=255) cgcATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGa < 1:1108320/140‑1 (MQ=255) cgcATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGa > 1:339569/1‑140 (MQ=255) gcATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTGCggc > 2:565790/1‑138 (MQ=255) aTTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAg > 1:264165/1‑140 (MQ=255) aTTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAg > 1:582525/1‑140 (MQ=255) tGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGTTTGGAGCGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGt < 2:245239/140‑1 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGc < 2:906090/139‑1 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCg < 1:1271839/140‑1 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCg < 2:824520/140‑1 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGc > 1:906090/1‑139 (MQ=255) tGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTTTCGCGGGGGTGTTTGCGGCAGGGGGGGAAAGCggt > 2:699493/1‑138 (MQ=255) tGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTGTCGCGGGGGTGTTTTCGACAGGGGGGGAAAGCggt > 2:868717/1‑138 (MQ=255) cGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGGTTGCGACAGGGGGGCAAAGCGtttt > 2:177100/1‑140 (MQ=255) tCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGt > 1:403452/1‑140 (MQ=255) ccAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTa < 2:339569/140‑1 (MQ=255) ccAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTa < 2:1070306/140‑1 (MQ=255) ccAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTa < 1:548969/140‑1 (MQ=255) ccAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTa < 1:1131198/140‑1 (MQ=255) ccAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTa < 1:283898/140‑1 (MQ=255) tAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGGCAGGGGGGGAAAGCGGTTTTTATGcc > 2:1211721/1‑140 (MQ=255) tAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGcc < 2:403452/140‑1 (MQ=255) aaCCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGccc < 2:206478/140‑1 (MQ=255) ccATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTg < 1:177100/140‑1 (MQ=255) aTGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTTCGACAGGGGGGGAAAGCGGTTTGTATGCCCCggg > 2:588865/1‑139 (MQ=255) tGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGGGGGCCAAGCGGTTTTTTTGCCCTGGcc > 2:430616/1‑139 (MQ=255) cGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCg < 2:264165/140‑1 (MQ=255) cGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCg < 2:582525/140‑1 (MQ=255) cGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCg < 1:140467/140‑1 (MQ=255) cTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGGAAAGCGGTTTGTATGCCCTGGCACCgttgtt > 2:720575/1‑140 (MQ=255) aTTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGttttt > 1:1211781/1‑139 (MQ=255) aTTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTa < 1:430616/140‑1 (MQ=255) aTTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTa < 1:565790/140‑1 (MQ=255) aTTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTa < 1:941305/140‑1 (MQ=255) tttATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGGCAGGGGGGCAAAGCGGTTTGTATGCCCTGGCCCCGGTGTTTTAc > 2:491001/1‑140 (MQ=255) ttATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACa < 1:619343/140‑1 (MQ=255) ttATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTGTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACa < 1:217812/140‑1 (MQ=255) cgacaccgCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAg > 1:568207/8‑140 (MQ=255) gCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTGCGGCAGGTGGGGAAAGCGTTTTGTATGGCCTGGGACCGGTGTTTTTCAGTTCg > 2:747823/1‑140 (MQ=255) gCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGGGGGCAAAACGGTTTTTATGCCCCGGGACCGTTGTTTTTCAGTTCGCAg > 2:58286/1‑140 (MQ=255) gCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGCTTTTTCCCGGGGGTGTTTGCGACCGGGGGGCCAAGCGGTTTTTATGCCCCGGCCCCGCTGTTTTTCAGTTCGccg > 2:20675/1‑138 (MQ=255) gCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACa < 2:1247426/132‑1 (MQ=255) gCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAg < 1:720575/140‑1 (MQ=255) gCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACa > 1:1247426/1‑132 (MQ=255) gCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAACGGTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTTCAGTTCGCAg > 2:619343/1‑140 (MQ=255) tGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATc < 1:499664/140‑1 (MQ=255) tGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATc < 1:58286/140‑1 (MQ=255) gTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATcc > 1:1039974/1‑140 (MQ=255) tCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAAc > 1:406144/1‑140 (MQ=255) ctgctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAAc > 2:943276/1‑137 (MQ=255) ctgctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAAc < 1:943276/137‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAgg > 1:988666/1‑140 (MQ=255) tgctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAggg > 1:48214/1‑139 (MQ=255) gctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGgtg < 2:968302/140‑1 (MQ=255) ttGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACa > 1:931693/1‑140 (MQ=255) gtcgtcATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCgg > 1:863432/1‑140 (MQ=255) cATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAggg < 2:988666/140‑1 (MQ=255) cATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAggg < 2:1039974/140‑1 (MQ=255) aTTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGGGTGGGAACAGCCGTGGCGGGAgggg > 1:1180314/1‑139 (MQ=255) tAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTc < 2:1211781/140‑1 (MQ=255) tAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTc < 2:568207/140‑1 (MQ=255) tAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTc > 2:1207009/1‑140 (MQ=255) aCGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGGGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGGAGGGGGGCTg > 2:186097/1‑140 (MQ=255) tATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTggggg > 1:329623/1‑140 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTg < 2:697290/134‑1 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTg > 1:697290/1‑134 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCt > 2:683791/1‑140 (MQ=255) cTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTgggg > 1:311194/1‑132 (MQ=255) cTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTgggg < 2:311194/132‑1 (MQ=255) tGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTG‑TTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCg < 2:702251/140‑1 (MQ=255) gCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTg < 1:975156/126‑1 (MQ=255) gCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTg > 2:975156/1‑126 (MQ=255) gCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAg > 1:706013/1‑137 (MQ=255) gCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAg < 2:706013/137‑1 (MQ=255) gCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCgg > 1:1253689/1‑140 (MQ=255) gggATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTc > 1:673771/1‑140 (MQ=255) gggATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGGGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGGGGCGGGAGGGCGGCTGGGGGCCATTAGCGGTc > 2:1112027/1‑140 (MQ=255) tCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTg > 2:252215/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTGGCCggg < 1:1112027/140‑1 (MQ=255) gttgttTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTGGCCGGGa < 1:487374/140‑1 (MQ=255) | TGTTGGGCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTGGCCGGGA > NC_000913/376264‑376539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |