| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 754,867 | C→T | intergenic (‑86/‑310) | ybgU ← / → sdhC | protein YbgU/succinate:quinone oxidoreductase, membrane protein SdhC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 754,867 | 0 | C | T | 99.0% | 344.7 / ‑4.4 | 98 | intergenic (‑86/‑310) | ybgU/sdhC | protein YbgU/succinate:quinone oxidoreductase, membrane protein SdhC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (45/52); total (46/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
GTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTG > NC_000913/754731‑754996 | gTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATtgtg < 2:374426/140‑1 (MQ=255) ttACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGa > 1:994117/1‑140 (MQ=255) ttACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGa > 1:1412512/1‑140 (MQ=255) ttACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGa > 2:285349/1‑140 (MQ=255) tACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGAc < 1:654297/140‑1 (MQ=255) cATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCt > 2:1225299/1‑140 (MQ=255) aTAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTAAATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTg < 1:773839/140‑1 (MQ=255) aGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGAt < 2:1412512/140‑1 (MQ=255) gTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATc > 1:836925/1‑140 (MQ=255) gTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATc > 1:1566597/1‑140 (MQ=255) ttAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCa < 2:913155/140‑1 (MQ=255) ttAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCa < 1:931572/140‑1 (MQ=255) ttAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCa < 1:975343/140‑1 (MQ=255) ttAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCa < 1:541474/140‑1 (MQ=255) ttAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCa < 1:1103781/140‑1 (MQ=255) tAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCAc > 1:1236707/1‑140 (MQ=255) tAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCAc > 1:718607/1‑140 (MQ=255) ttATGTGAAATACCGACTTCATAGCTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTc < 1:276003/140‑1 (MQ=255) ttAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTc < 1:285349/140‑1 (MQ=255) aGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAg > 1:661863/1‑140 (MQ=255) ggTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAgg > 1:1263523/1‑140 (MQ=255) ggTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAgg > 1:860232/1‑140 (MQ=255) ggTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAgg > 1:1183587/1‑140 (MQ=255) ggTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAgg > 1:1030439/1‑140 (MQ=255) ggTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAgg > 1:1553067/1‑140 (MQ=255) gTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGa > 2:232147/1‑140 (MQ=255) aaaTACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATaa > 1:118411/1‑140 (MQ=255) cGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCg > 1:984801/1‑140 (MQ=255) gACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGa > 2:143944/1‑140 (MQ=255) gACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGa < 2:1176934/140‑1 (MQ=255) gACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGa > 1:1254751/1‑140 (MQ=255) aCTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGAc < 1:1593162/140‑1 (MQ=255) cATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAAc < 2:1600922/140‑1 (MQ=255) aTAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACt < 2:661863/140‑1 (MQ=255) ttttACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATg < 2:961730/140‑1 (MQ=255) ttACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAGCTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTa > 1:590907/1‑140 (MQ=255) ttACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTa > 2:1470868/1‑140 (MQ=255) aCGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAgg > 1:559198/1‑140 (MQ=255) cATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAATCCCGACAAACTATATGTAGGTTa < 2:343835/140‑1 (MQ=255) cATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTa < 2:1263523/140‑1 (MQ=255) tataTGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACaaa > 1:1388607/1‑123 (MQ=255) tataTGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACaaa < 2:1388607/123‑1 (MQ=255) atatGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTg < 2:860232/140‑1 (MQ=255) tGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTaa < 2:1089189/140‑1 (MQ=255) ttCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAtt > 2:415315/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGATTGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGGCCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 2:576139/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 2:131758/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt < 1:549395/140‑1 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 2:214400/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 1:963971/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 2:549395/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 2:645589/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 1:1484544/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAttt > 2:1500017/1‑140 (MQ=255) ccTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGAtttt < 1:6947/140‑1 (MQ=255) cTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTtg > 1:1546338/1‑140 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACATCTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 2:695605/140‑1 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACAGCTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 2:590907/140‑1 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 2:1030439/140‑1 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 2:559198/140‑1 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 2:994117/140‑1 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 2:1236707/140‑1 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa < 1:428952/140‑1 (MQ=255) gTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGa > 2:1140538/1‑140 (MQ=255) tAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGaa < 2:1254751/140‑1 (MQ=255) tAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGaa < 1:214400/140‑1 (MQ=255) tAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGaa < 1:645589/140‑1 (MQ=255) aTGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACa < 2:1227629/140‑1 (MQ=255) aTGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACa < 2:984801/140‑1 (MQ=255) gTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGc < 2:1553067/140‑1 (MQ=255) acaacTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACt < 2:1546338/140‑1 (MQ=255) cTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTgccg > 2:1395352/1‑140 (MQ=255) cTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTgccg > 2:1552976/1‑140 (MQ=255) ttgttgAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTgccgcc < 1:375111/140‑1 (MQ=255) gttgAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAg < 1:143944/140‑1 (MQ=255) gttgAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAg < 2:1011257/140‑1 (MQ=255) ttgAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAgg > 2:1420770/1‑140 (MQ=255) tgAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGt < 2:884209/140‑1 (MQ=255) tgAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGt < 2:836925/140‑1 (MQ=255) aaTGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGtc < 2:1102942/139‑1 (MQ=255) aaTGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGtc > 1:1102942/1‑139 (MQ=255) tGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTcc > 1:443170/1‑140 (MQ=255) tCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAaca < 2:718607/140‑1 (MQ=255) tCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAaca < 1:232147/140‑1 (MQ=255) tCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAaca < 2:1183587/140‑1 (MQ=255) aaaTTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACAcc > 1:180945/1‑140 (MQ=255) aaaTTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACAcc < 1:1552976/140‑1 (MQ=255) aaaTTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACAcc > 2:951643/1‑140 (MQ=255) tgatTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATc > 1:1281598/1‑140 (MQ=255) aaaaaTTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAg < 2:118411/140‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAg < 2:463949/140‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAg < 1:1420770/140‑1 (MQ=255) aaaaaTTAAATAAATGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAg < 1:951643/140‑1 (MQ=255) aataaatGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAg > 2:216196/1‑140 (MQ=255) atGTTGTTATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTg > 1:1530290/1‑140 (MQ=255) gttATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCAcc < 2:1300982/127‑1 (MQ=255) gttATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCAcc > 1:1300982/1‑127 (MQ=255) gttATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCg > 1:900199/1‑132 (MQ=255) gttATTGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCg < 2:900199/132‑1 (MQ=255) | GTTACATAAGTTAATCTTAGGTGAAATACCGACTTCATAACTTTTACGCATTATATGCTTTTCCTGGTAATGTTTGTAACAACTTTGTTGAATGATTGTCAAATTAGATGATTAAAAATTAAATAAATGTTGTTATCGTGACCTGGATCACTGTTCAGGATAAAACCCGACAAACTATATGTAGGTTAATTGTAATGATTTTGTGAACAGCCTATACTGCCGCCAGGTCTCCGGAACACCCTGCAATCCCGAGCCACCCAGCGTTG > NC_000913/754731‑754996 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |