New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4292118 | 39 (0.410) | 3 (0.030) | 3/270 | 7.7 | 7.5% | coding (607/1659 nt) | nrfE | putative cytochrome c‑type biogenesis protein NrfE |
? | NC_000913 | 4292122 = | 36 (0.390) | coding (611/1659 nt) | nrfE | putative cytochrome c‑type biogenesis protein NrfE | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTCCCT > NC_000913/4291980‑4292251 | ccGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGGAGCGGGGAGCGGGGGGCTGGCGGATTTAATGCGCGGCGCGGTTGGTTGTGCCTGGGCCCGAATTTGCTAGCGCTGGGCGTTATCTGGGGGGAGGGCGTTTAcagc > 2:344666/1‑140 (MQ=255) ccGCTGCTTCACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGGGTTTGATGGGGCCCGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGGGTGGATTAAcggc > 2:82692/1‑140 (MQ=255) cGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAAcggcg < 1:1026134/140‑1 (MQ=255) cGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGGGGCGCTGGGGCGTCTACTGGGCGGGGGGGTTGATGGGGCCTGCGCCCGGATTTGCTGGCGCTGGGCGGTACCTGGCTGGGGTGGATTAAcgggg > 2:1147216/1‑138 (MQ=255) ctgctTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCggg > 1:430120/1‑140 (MQ=255) ctTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGGTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCgggggg > 1:292461/1‑138 (MQ=255) ctTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGGAGCGGCGGGCGTGGCGCTGGCGGGTCTACTGCGCGGGGGGTTTGATGGGGCCCGCGCCCGAATTTTGTGGCGCTGGGGGGTTCCTGGCTGGGGGGGATTTACGGCgggggg > 2:42748/1‑138 (MQ=255) tttACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGatc < 2:757238/140‑1 (MQ=255) ccTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGGGTTTGATGGGGCCTGCGCCCGGATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGGGGGCATTTACGGCgggggggggcc > 2:1205047/1‑133 (MQ=255) gCTATGGCGGGTTGATGGTAGCGGGGGGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGt < 2:1503435/140‑1 (MQ=255) gCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCtgg < 1:1321004/140‑1 (MQ=255) ttGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGCGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGc < 2:1139551/140‑1 (MQ=255) cggcgAGCGTGGCGCTGGCGGGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGGCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTCCCTGGCTAGCGCGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCGACTTCGaa < 2:787947/140‑1 (MQ=255) cggcgAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGaa < 1:1147216/140‑1 (MQ=255) cggcgAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGaa < 1:280809/140‑1 (MQ=255) cggcgAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGaa < 1:111642/140‑1 (MQ=255) cggcgAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGaa < 1:66021/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTgggg < 1:525485/140‑1 (MQ=255) ggCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑t < 2:192739/140‑1 (MQ=255) cGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑tgg < 1:1029591/140‑1 (MQ=255) cGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑tgg < 2:910084/140‑1 (MQ=255) gAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGGTCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGGCCACTGCGGACCCGGCTGGGGGGGG‑tggg > 2:90373/1‑139 (MQ=255) aGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑tggtg < 2:430120/140‑1 (MQ=255) tCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGGTCA‑TCCTCGGGTCCTTGGGGGGCCCCTGCGGACTCCGCTGGGGGGGG‑tgggggg > 1:695863/1‑139 (MQ=255) gcggcgAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGAt < 1:753057/140‑1 (MQ=255) gcggcgAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGAt < 2:1285906/140‑1 (MQ=255) gcggcgAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGAt < 1:111771/140‑1 (MQ=255) cggcgAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATc < 1:723889/140‑1 (MQ=255) caggTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAAc < 1:112500/138‑1 (MQ=255) tGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGACTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCct < 1:1466380/140‑1 (MQ=255) ccTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCctct < 1:1517449/140‑1 (MQ=255) ccTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAA‑‑‑CGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCct > 2:1168118/1‑135 (MQ=255) ccTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAA‑‑‑CGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCct < 1:1168118/135‑1 (MQ=255) cgcCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTttat < 2:288705/140‑1 (MQ=255) cgcCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTttat < 2:718809/140‑1 (MQ=255) cGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGGGCA‑TTCCCCGTTCCTTGGGGGGCTACTTCGGACTCGGCGGGGGGGGG‑GGGGGGGGCTGGGGTGCGGGGGGGAAAGCCCCttttttttt > 2:112500/1‑137 (MQ=255) tGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGGGGATTCCTCGGTT‑CTGGTGGGGGCCCTCGGCACTCGGCGGGGGGGGCGGGGGGGTTTTGGGTCCGGGGGGAAAAGCCCTCTTTTTTTccccgcattt > 2:266751/1‑133 (MQ=255) ggCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTg < 1:661254/140‑1 (MQ=255) ggctggAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGca < 1:1047273/140‑1 (MQ=255) gCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTc < 1:1236812/140‑1 (MQ=255) gCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTc < 1:1385693/140‑1 (MQ=255) ttAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCTTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTCCCt < 1:1291612/140‑1 (MQ=255) | CCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGCGGCGAGCGTGGCGCTGGCGAGTCTACTGCGCGGCGAGTTTGATGGTGCCTGCGCCCGAATTTGCTGGCGCTGGGCGTTACCTGGCTGGAGTGCATTAACGGCGGGGATCA‑TCCTCGGTTCCTGGTGGGCCTACTGCGAACTCGGCTGGGGCGGC‑TGGTGGTTCTGGGATCCGGTGGAAAACGCCTCTTTATTACCCTGGCTTTCTGCCACTGCGCTGCTGCACAGTTTGTCCCT > NC_000913/4291980‑4292251 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |