| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,231,715 | IS5 (–) +4 bp | intergenic (‑84/+166) | yjbD ← / ← lysC | conserved protein YjbD/aspartate kinase III |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 3652036 = | NA (NA) | 82 (0.870) | 53/276 | 0.4 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4231718 | 0 (0.000) | intergenic (‑87/+166) | yjbD/lysC | conserved protein YjbD/aspartate kinase III | |||||
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
GTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCC > NC_000913/4231577‑4231854 | aaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttcctt < 1:1291769‑M2/2‑1 (MQ=255) atctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTaa < 2:464804‑M2/4‑1 (MQ=255) atctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTaa < 1:839075‑M2/4‑1 (MQ=255) tctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAAc > 1:968385‑M2/136‑140 (MQ=255) 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ccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg > 2:1055177‑M2/63‑140 (MQ=255) ccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg < 2:651161‑M2/78‑1 (MQ=255) ccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg > 2:1045210‑M2/63‑140 (MQ=255) ccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg < 1:910231‑M2/78‑1 (MQ=255) tgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACg < 2:1308806‑M2/78‑1 (MQ=255) tgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTg > 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1:670357‑M2/1‑6 (MQ=255) | GTTCACGCTGCTCGCGTTCAGTCATCTCTTTTTGGGTAATACGGGGGAGTGCCATGATGGTGCCCTCAGTGAGCCAGAGAGTTCAGTGTACGGGAATTCGTTTGCGAGCAGAACTGATAATATTCATTTTGCCTTCTCTTAACTATTTATCTCTTTCGATAATTAATTAGAGATGCAGATAAAAAAATTAAAGGCAATTATTCTCCGATAAAGACGCTGGTTAACAGAGTACAGGCTCGTTTATTGATGAGCATAGTGACAAGAAAATCAATACGGCC > NC_000913/4231577‑4231854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |