New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 0 (0.000) | 81 (0.770) +GAAGAAACAATC |
40/252 | 1.1 | 62.0% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 109 (0.950) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B |
TCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTG > NC_000913/696774‑696998 | ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCg > 2:270601‑M1/90‑127 (MQ=255) ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCg < 1:270601‑M1/38‑1 (MQ=255) ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAc < 2:991951‑M1/49‑1 (MQ=255) ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAc > 1:991951‑M1/90‑138 (MQ=255) ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCg < 1:970813‑M1/51‑1 (MQ=255) ggtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCg < 2:1307098‑M1/51‑1 (MQ=255) gtggctacgacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCgg > 1:866617‑M1/89‑140 (MQ=255) gagacagattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTa > 2:1768871‑M1/82‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:577856‑M1/77‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:455732‑M1/77‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 1:836105‑M1/77‑140 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCt > 2:664842‑M1/77‑140 (MQ=255) gattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCtt < 1:1026046‑M1/65‑1 (MQ=255) ttcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTgg < 2:650340‑M1/67‑1 (MQ=255) aacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGAt > 1:1307098‑M1/70‑140 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 1:498927‑M1/68‑140 (MQ=255) cctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAc > 2:198032‑M1/68‑140 (MQ=255) tgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctatgtagccagattgtttcttcGGTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 2:1920908‑M1/75‑1 (MQ=255) tgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAccc < 2:1365754‑M1/75‑1 (MQ=255) gtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAcccc < 1:870779‑M1/76‑1 (MQ=255) tgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCa < 1:1578318‑M1/77‑1 (MQ=255) tgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCa > 2:1026046‑M1/64‑140 (MQ=255) tgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCAGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCa < 2:853480‑M1/77‑1 (MQ=255) gaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAt > 2:870779‑M1/63‑140 (MQ=255) accccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATc < 2:1657229‑M1/79‑1 (MQ=255) cccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCg < 2:1066301‑M1/81‑1 (MQ=255) atcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGACTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTAc < 1:1485536‑M1/84‑1 (MQ=255) atcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcAATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATCCCGGCATCAAAAACCGGTGCCTTAACGCATGGCGACACCCCATCCGTAc < 1:1218477‑M1/84‑1 (MQ=255) tcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACa < 2:1359693‑M1/85‑1 (MQ=255) tcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttctacGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACa > 2:1250266‑M1/56‑140 (MQ=255) tatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGc < 1:823608‑M1/89‑1 (MQ=255) atgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCt > 1:1657229‑M1/51‑140 (MQ=255) gagtcatgtgctctaacgaaccgagttacgtagcaagattgtttctacAATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCttt > 2:877461‑M1/49‑140 (MQ=255) agtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTc < 2:1645340‑M1/93‑1 (MQ=255) agtgatgtgccctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTc < 1:1210692‑M1/93‑1 (MQ=255) gtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCt > 1:1283469‑M1/47‑140 (MQ=255) tgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTg < 1:1678864‑M1/95‑1 (MQ=255) 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tgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGACTTTGGTACCTGGGTTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGCACATCGATTTCTGGTg < 2:666464‑M1/98‑1 (MQ=255) gtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGa > 2:970813‑M1/42‑140 (MQ=255) gtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGa < 2:1890800‑M1/99‑1 (MQ=255) gctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt > 1:1365754‑M1/40‑140 (MQ=255) gctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAAt < 1:1864750‑M1/101‑1 (MQ=255) ctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATg < 2:663450‑M1/102‑1 (MQ=255) tctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATgg < 2:773326‑M1/103‑1 (MQ=255) taaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTg > 1:1645340‑M1/36‑140 (MQ=255) accaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATTGCTGGGGCACCTGGATGCGACCCAGGGAATGCCGGTATCAAGAACCGGTGCCTTACCTCTTGCTGATACCCCATCCTTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg < 2:917334‑M1/107‑1 (MQ=255) accaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg > 1:162139‑M1/34‑140 (MQ=255) accaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg < 2:166929‑M1/107‑1 (MQ=255) accaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTGACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCg > 2:1485536‑M1/34‑140 (MQ=255) ctgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 2:783421‑M1/112‑1 (MQ=255) ctgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 2:418792‑M1/112‑1 (MQ=255) ctgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAgg < 2:785981‑M1/112‑1 (MQ=255) tgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc < 1:1196236‑M1/113‑1 (MQ=255) tgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 1:166929‑M1/28‑140 (MQ=255) tgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCAGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 1:853480‑M1/28‑140 (MQ=255) gagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCg < 1:1486900‑M1/114‑1 (MQ=255) agctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 2:1727397‑M1/26‑138 (MQ=255) agctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc < 1:1727397‑M1/113‑1 (MQ=255) agctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCga < 1:1943339‑M1/115‑1 (MQ=255) 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2:729549‑M1/22‑140 (MQ=255) cgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACtt < 1:1913551‑M1/120‑1 (MQ=255) gtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 1:1359693‑M1/20‑140 (MQ=255) gtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 1:1327558‑M1/20‑140 (MQ=255) gtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTg > 1:783421‑M1/20‑140 (MQ=255) tagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGa > 2:1678864‑M1/19‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) tcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCtt < 1:607481‑M1/135‑1 (MQ=255) cttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTg > 2:1913551‑M1/5‑140 (MQ=255) | TCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTG > NC_000913/696774‑696998 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |