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CAGTCTAAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATG < 1:1251326/126‑1 AGTCTAAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATGCCTCTAAAGGCATGG < 2:654614/140‑1 AGTCTAAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATGCCTCTAAAGGCATGG < 2:1146554/140‑1 TCTAAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATGCCTCTAAAGGCATGGCA < 2:113420/140‑1 TCTAAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATGCCTCTAAAGGCATGGCA > 1:1353606/1‑140 TCTAAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATG < 2:2174582/123‑1 TCTAAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATG > 1:2174582/1‑123 AAAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATGCCTCTAAAGGCATGGCACTT < 2:811242/140‑1 GTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381396‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAACATGTAAAGCCTTGCAAGCCATTGCGAGGCCTTATGTGTCTCAGTTTTGTCCCTCTTTTTTGTACTAAAAAACATAGTAATTGAGGATAAACCTCATGCTATTTTCGCTTATATGCCTCTAAAGGCATGGCACTT < NC_000913/585988‑585850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |