Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,745,397 | 0 | A | C | 28.0% | 124.9 / 10.8 | 75 | L198F (TTA→TTC) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/27); new base C (0/21); total (27/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGC > NC_000913/3745259‑3745534 | ttCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTAc > 2:1372926/1‑140 (MQ=255) ttCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑TCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTAc > 2:139580/1‑140 (MQ=255) tCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTAcc > 1:365132/1‑140 (MQ=255) cGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGTTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCACCGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAg < 1:1261954/140‑1 (MQ=255) cGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACCCCGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGGCGCCTTAATTTACcccccccc > 2:1052263/1‑138 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTTCCCCTGGGGTGAAGATGGGAGCAACGCTGAT‑GCTTACCTTGTGGTGGCAGGGCCCACGCCTTAATTTACCCCCCCAACa > 2:1261954/1‑140 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCCTGGTGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCCGCa > 1:1389593/1‑140 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGCTGATGGGCGCAACCCTGAT‑GCTTACCCCGGGGGGGCAGGCCAGCCGCCTTTATTTACCCCCCCCGCa > 2:1533205/1‑140 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCa < 2:365132/140‑1 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCCGCATGATGGTGGGGGGAACGCTGAT‑GATTAACTCGTGGTGGCAGGCCCGTAGCCTTAATTTACCCCGCCAGCa > 2:1160346/1‑140 (MQ=255) tattatCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGGGGGGGCCGGGCAGGCGCCCTAATTTACCCCCCCCGCaaa > 2:244381/1‑140 (MQ=255) ttCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAAc < 1:1765641/140‑1 (MQ=255) ttCGGCGTTTCCAGCGGATTATCAATCAGTAAGCGGTTTATGGC‑GGGCTTTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCACCGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAAc < 1:2003691/140‑1 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGGGATTG‑CCCTGGCCTGCTGATGGGCGCAACACTTAG‑TCTTACCTGGTGGGGGGGGGGCGGACGTCTTAATTTACCCCCCCAGCAAAAAACAACg > 2:2081777/1‑140 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGGATTGTCCCCGGCGTGATGATGGGCGGCAAGCTTGT‑GCTTTCCTGGTGGGGGCAGGGCAGTCGCCTTTATTTACCCCCCCAGCAAAAAGCAACg > 2:1100967/1‑140 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTTTCCCTGGCATGCTGAGGGGGGCCACCCTGAT‑GTTTTCCCCGGGGGGGCCGGTCCGGCTCCTTTATTTTCCCCCCCCTCCAAAACCAAca > 2:778300/1‑139 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGTCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGGAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCCGCAAAAAACAACg > 2:583450/1‑140 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGGGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCCGTCGCCCTAATTTACCCCGCCCGCAAAAAGCAACg > 2:1929430/1‑140 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCCGCAAAAaacaacc > 2:1648775/1‑139 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGGGCCACGCTGAT‑GCTTTCCTGGTGGTGGCAGGGCCGTCGCCTTAATTTTCCCCCCCCGCAAAAAGCAACg > 2:738944/1‑140 (MQ=255) ggCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCaa < 2:1042992/136‑1 (MQ=255) ggCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCaa > 1:1042992/1‑136 (MQ=255) gTTTCCAGGGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCa < 1:1648775/140‑1 (MQ=255) gTTTCCAGCGGATTTTCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCa < 1:778300/140‑1 (MQ=255) ttCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTTCCCCCGGCCTGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTTCCTGGTGGTGGGAGGGCAGTCGCCTTTATTTACCCCCCCAGCCAAAAACAACGATGCAgg > 2:641221/1‑140 (MQ=255) ccAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑aa < 1:1477728/140‑1 (MQ=255) aTTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCCTGATGATGGGCGCAAAGCTGAT‑GCTTACCCGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCCTAATTTACCCCCCCCGCAAAAAACAACGATGCAGG‑AAAACTGGc > 2:1658330/1‑140 (MQ=255) aTTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGc < 1:139580/140‑1 (MQ=255) tATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCAc < 2:190963/140‑1 (MQ=255) tATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCAc < 1:1627818/140‑1 (MQ=255) cATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCtt < 1:1658330/140‑1 (MQ=255) tCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTCCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCtttt < 1:1469852/140‑1 (MQ=255) cAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTg < 1:1302975/140‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTATGGG‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGAGGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTATTTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGtctc < 2:138985/140‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGtctc < 2:100297/140‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGtctc < 1:1929430/140‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGtctc < 2:1658585/140‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGtctc < 2:816265/140‑1 (MQ=255) aGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCCTGATGGTGGGCGCCGCGCCGAT‑GCTTACCCGGTGGGGGGCGGGCAGTCGCCTTTATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAAGGACGCAGG‑AAATCTTGCACTCTTTTTTTTcc > 2:1244034/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGGGCAACGCTGAT‑GCTTTCCTGGTGGTGGGAGGCCAGGCGCCTTAATTTTCCCCCCCCGCAAAAAACAACGATGCAGG‑GAATCTGGCACTCTTTTTTCTcc > 2:1989174/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGGGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCAGCAAAAAACAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTcc > 2:1156388/1‑140 (MQ=255) tGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGGGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGGAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCCGCAAAAAACAACGATGCAGG‑AAATCTGGGACTCTTTTTTCTCCggg > 2:541109/1‑139 (MQ=255) tttATGGC‑GGGCATTTCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTTCCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTTATTTACCCCCCCCGCAAAAAACAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTTTCTCCGGGAt > 2:1158179/1‑140 (MQ=255) tttATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 2:908112/1‑140 (MQ=255) tttATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:1740350/1‑140 (MQ=255) tttATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:1458918/1‑140 (MQ=255) tttATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:2192493/1‑140 (MQ=255) tATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCACCGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCt < 2:1389593/140‑1 (MQ=255) tATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCt < 1:1533205/140‑1 (MQ=255) tATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCt < 1:2026316/140‑1 (MQ=255) ggC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGGGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCCGCAAAAAACAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTTTCTCCGGGATCTggg > 2:262132/1‑140 (MQ=255) gC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgc < 1:541109/140‑1 (MQ=255) gC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgc < 1:1936393/140‑1 (MQ=255) c‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 1:1158179/140‑1 (MQ=255) c‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 1:1031737/140‑1 (MQ=255) ggggCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GTTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 1:2124427/139‑1 (MQ=255) ggggCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 1:583450/139‑1 (MQ=255) ggCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCt < 1:1372926/140‑1 (MQ=255) ggCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCt < 2:1557838/140‑1 (MQ=255) gccttGCCCCCGGCGTGATGAGGGGCGCCACGCCGATGGCTTCCCTGG‑GGTGGGAGGCCAGTCGCCTTAATTTAACCCCCCAGGAAAAAGCAACGAAGCCGGAAAAACTGG‑ACTCTTTTGTCTTCGGGATCTGGGCGCTg > 2:537381/4‑140 (MQ=255) gCATTTCCCCCTGCATGAAGGCGGGCGCAACGCCGAG‑GATTTCCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGGCTTAATTTTTCCCGCCAGCAAAAAGCAACAATGCAGG‑AAAACTGGCACTCTTTTTTCTCCGGCATCTTGGCGCTg > 2:1353616/1‑140 (MQ=255) gCATTTCCCCCGGGATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGGGGGAGGCCCGCCGCCTTAATTTTCCCCGCCAGCAAAAAAAAACGATGCAGG‑AAAAATGGCACTCTTTTGTCTCCGGGATCTTGGCGCTg > 2:2124427/1‑140 (MQ=255) gCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTg < 2:689370/140‑1 (MQ=255) gCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGACAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCt < 1:1784973/139‑1 (MQ=255) gCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGACAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCt > 2:1784973/1‑139 (MQ=255) gCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCCACGCTGGT‑GCTTACCTGGGGGTGGGAGGCCAGGCGCCTTAATTTTCCCCCCCCGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTTTTTCCCGTATTTGGGCGCTg > 2:1031737/1‑140 (MQ=255) tGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 1:1722234/1‑133 (MQ=255) tGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 2:1722234/133‑1 (MQ=255) gCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCATG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTttct < 1:1160346/140‑1 (MQ=255) cTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCa < 2:2012551/140‑1 (MQ=255) gCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGtc < 1:908112/140‑1 (MQ=255) gatgatgGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGtt > 2:1436773/1‑126 (MQ=255) gatgatgGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGtt < 1:1436773/126‑1 (MQ=255) gatgatgGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGtcatca > 1:479084/1‑140 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGtcatc < 2:1302617/138‑1 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGtcatc > 1:1302617/1‑138 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTcatcat > 2:1297531/1‑140 (MQ=255) ggCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTgg > 2:1878083/1‑140 (MQ=255) ggCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTgg > 1:509424/1‑140 (MQ=255) cAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCggg > 1:1350299/1‑140 (MQ=255) aaCGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGt > 1:1857188/1‑140 (MQ=255) gAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCCCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCt < 2:1152582/140‑1 (MQ=255) gAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGCCCAGTCGCTTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCt < 1:2081777/140‑1 (MQ=255) gttACCTGGTGGGGGCGGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 2:851974/139‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 2:479084/140‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 1:738944/140‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTGGCAGGCCAGCCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 1:537381/140‑1 (MQ=255) tACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGcc > 1:1689671/1‑140 (MQ=255) aCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTCGCTCCCGCCt > 2:1732401/1‑140 (MQ=255) ggtggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTCGCTCCGGCCCGTTTTcc > 2:1793832/1‑140 (MQ=255) gtggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTAccc > 1:281275/1‑140 (MQ=255) tggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTTGCTCCTGCCTGTTTTcccc > 1:851974/1‑140 (MQ=255) ggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 2:537511/128‑1 (MQ=255) ggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc > 1:537511/1‑128 (MQ=255) gCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTTGCTCCGGCCCGTTTAcccccc > 2:1163527/1‑138 (MQ=255) aGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTAcc < 2:1350299/140‑1 (MQ=255) gCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTTGCTCCGGCCTGTTTACCCCTAccca > 1:1788736/1‑138 (MQ=255) gCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTCGCTCCCGCCTGTTTTCCCCAAcccg > 2:264060/1‑138 (MQ=255) tCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTTGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCCAAGccc > 1:155314/1‑139 (MQ=255) ttACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTtgc < 2:1689671/140‑1 (MQ=255) | TTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGC‑GGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGAT‑GCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGG‑AAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGC > NC_000913/3745259‑3745534 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |