New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4597304 = | 41 (0.730) | 3 (0.060) | 3/260 | 5.7 | 7.1% | coding (2138/2292 nt) | opgB | phosphoglycerol transferase I |
? | NC_000913 | = 4597300 | 40 (0.760) | coding (2142/2292 nt) | opgB | phosphoglycerol transferase I | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGTCAAATTTCTTCGGCAGCGGATG > NC_000913/4597168‑4597434 | cACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTgtggtgg < 1:50264/140‑1 (MQ=255) cTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTgtggtggtg > 1:183292/1‑140 (MQ=255) ttAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTggtggtggt > 2:907051/1‑140 (MQ=255) ttAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTggtggtggt < 2:836677/140‑1 (MQ=255) aTGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGGGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTGCCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGcc < 2:226324/140‑1 (MQ=255) aTGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGcc < 2:894394/140‑1 (MQ=255) aTGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGcc < 2:183292/140‑1 (MQ=255) ccGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAg < 1:916792/140‑1 (MQ=255) aTCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGcac > 1:478003/1‑140 (MQ=255) aTCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGcac > 2:625555/1‑140 (MQ=255) tCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGcaca < 2:317194/140‑1 (MQ=255) tCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACCTCATTGCCCAGcaca < 2:910326/140‑1 (MQ=255) aGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGcaca < 1:301361/135‑1 (MQ=255) aGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGcaca > 2:301361/1‑135 (MQ=255) ttACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTg < 1:907051/140‑1 (MQ=255) tACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGt > 1:814209/1‑140 (MQ=255) tACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGt < 2:814209/140‑1 (MQ=255) tACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGt < 2:478003/140‑1 (MQ=255) cgcgGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGttc > 2:759102/1‑140 (MQ=255) cgAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCAt > 2:599841/1‑140 (MQ=255) cgAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCAt < 2:24351/140‑1 (MQ=255) cGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTAcg < 2:567451/140‑1 (MQ=255) ggATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGt < 1:599841/140‑1 (MQ=255) tatTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTAcc > 1:64680/1‑140 (MQ=255) cGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGa > 2:656523/1‑140 (MQ=255) tggttgAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACgg > 1:94705/1‑140 (MQ=255) gaCAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGt < 1:759102/140‑1 (MQ=255) aCAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGtt > 1:168288/1‑140 (MQ=255) cAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTa < 1:915131/140‑1 (MQ=255) cacaATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCtt < 2:212558/140‑1 (MQ=255) cacaATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCtt < 1:656523/140‑1 (MQ=255) aaTTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTgg < 1:625555/140‑1 (MQ=255) gtgtCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCA‑‑GTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCa > 2:596590/1‑140 (MQ=255) tgtCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCAcc > 1:218659/1‑140 (MQ=255) gtCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTgg > 2:301373/1‑128 (MQ=255) gtCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTgg < 1:301373/128‑1 (MQ=255) tCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGT‑‑‑GTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTgg < 2:618935/124‑1 (MQ=255) tCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGT‑‑‑GTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTgg > 1:618935/1‑124 (MQ=255) cATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGt > 2:191621/1‑138 (MQ=255) cATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGt < 1:191621/138‑1 (MQ=255) tCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGTCaaa > 1:471905/1‑140 (MQ=255) aTCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGTCAAATTTCTTCGGCa < 2:218659/140‑1 (MQ=255) aaTGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGTCAAATTTCTTCGGCAGCGGa < 2:298627/140‑1 (MQ=255) tGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGTCAAATTTCTTCGGCAGCGGATg > 1:16235/1‑140 (MQ=255) | CACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGCGGCGAGTGTCCGAGGATATTCCCTTCGTTGGTTGAGACAGGTTCCGGCGGCACAATTACCAGTGTGTCGGCATCGGTTGGGTTATCGAAATGCAGTGTGGTGGTGGTCACTTCATTGCCCAGCACAAGAGTTTGTTCTTCATTGCCTACGCGTACCGGAATAGGACGGCTGGCGTTATTGCCGTATGCTTTGGCGGTAATCACCAGGTCAAATTTCTTCGGCAGCGGATG > NC_000913/4597168‑4597434 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |