| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1287449 = | 75 (0.920) | 83 (1.090) | 53/258 | 0.2 | 54.2% | intergenic (‑121/+89) | tyrV/tyrT | tRNA‑Tyr/tRNA‑Tyr |
| ? | NC_000913 | = 1287555 | 70 (0.920) | noncoding (68/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTA > NC_000913/1287311‑1287587 | ccGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCtcgaatc > 2:725145/1‑140 (MQ=255) cTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCtcgaatcgaa > 2:203370/1‑140 (MQ=255) cTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCtcgaatcgaa > 2:338536/1‑140 (MQ=255) cTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCtcgaatcgaa > 1:731353/1‑140 (MQ=255) caacgttctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCt < 1:122911‑M1/8‑1 (MQ=255) aaCCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAg < 1:1383272/140‑1 (MQ=255) ctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGa > 1:356136‑M1/126‑140 (MQ=255) ctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGa > 2:733827‑M1/126‑140 (MQ=255) ctctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGa > 1:861594‑M1/126‑140 (MQ=255) ccaccaGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGa < 1:1320728/140‑1 (MQ=255) tctcgctttcgctcgaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGaa > 1:210749‑M1/125‑140 (MQ=255) gctcgaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCAcc > 2:180685‑M1/115‑140 (MQ=255) gctcgaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCAcc > 1:1100545‑M1/115‑140 (MQ=255) aaTTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCAcc > 2:459862/1‑140 (MQ=255) tCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCtt > 1:1115473/1‑140 (MQ=255) tCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCtt > 2:1286205/1‑140 (MQ=255) gaatcgaaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTc < 1:1307156‑M1/30‑1 (MQ=255) aTTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTcccc > 1:973158/1‑140 (MQ=255) ttGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGAt < 1:673101/140‑1 (MQ=255) aaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGAt > 2:1185781‑M1/105‑140 (MQ=255) aaccttagtcgaaggttctcacccttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGAt > 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ggtggGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAAtctt < 2:94956/140‑2 (MQ=255) cttccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCa > 1:566417‑M1/82‑140 (MQ=255) gtccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCAc > 1:583838‑M1/81‑140 (MQ=255) tccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCAcc < 2:1262848‑M1/61‑1 (MQ=255) tccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCAcc > 2:1354223‑M1/80‑140 (MQ=255) tccccgatgagtgcaaactttcacaatctcaccgaagttaccacatcgctgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCAcc < 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(MQ=255) tGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGa > 1:962179/1‑140 (MQ=255) tGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGa > 1:1360854/1‑140 (MQ=255) tgtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCg < 2:936158‑M1/110‑1 (MQ=255) gtggtgaattatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa > 1:711730‑M1/30‑140 (MQ=255) attatggtggtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg > 1:936158‑M1/23‑140 (MQ=255) tctcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATtcgaaccttagtcgaa > 1:210749‑M2/1‑124 (MQ=255) gtgggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATg < 2:272270‑M1/127‑1 (MQ=255) gggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 1:1128451‑M1/129‑1 (MQ=255) gggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 1:476629‑M1/12‑140 (MQ=255) gggggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 1:945291‑M1/129‑1 (MQ=255) tCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATtcgaaccttagtcgaaggttctca > 2:156913‑M2/1‑116 (MQ=255) tCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATtcgaaccttagtcgaaggttctca > 2:1103542‑M2/1‑116 (MQ=255) gggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg > 2:652246‑M1/10‑140 (MQ=255) ggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAg < 1:511464‑M1/121‑1 (MQ=255) ggaaggatTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAg > 2:511464‑M1/9‑129 (MQ=255) gCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATtcgaaccttagtcgaaggttctcacc > 1:1137446‑M2/1‑114 (MQ=255) gCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATtcgaaccttagtcgaaggttctcacc > 1:485029‑M2/1‑114 (MQ=255) atTCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGAttt < 1:1008051‑M1/138‑1 (MQ=255) | CCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTA > NC_000913/1287311‑1287587 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |