New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3176701 | 76 (0.930) | 3 (0.040) | 3/274 | 7.7 | 3.1% | coding (133/828 nt) | cpdA | cAMP phosphodiesterase |
? | NC_000913 | 3179280 = | 113 (1.390) | coding (1166/1482 nt) | tolC | outer membrane channel TolC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AGCGTCGTGCAGACCGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGATCTGC > NC_000913/3179144‑3179417 | aGCGTCGTGCAGACCGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTAc > 2:343349/1‑140 (MQ=255) aGCGTCGTGCAGACCGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTAc < 1:1170534/140‑1 (MQ=255) tGCAGACCGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCAttgtt > 2:1356280/1‑140 (MQ=255) cAGACCGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGa < 1:731889/140‑1 (MQ=255) cAGACCGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGa > 1:1185160/1‑140 (MQ=255) cGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTATACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATgtgt > 1:366145/1‑140 (MQ=255) cGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTAcgcg > 2:214809/1‑123 (MQ=255) cGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATgtgt < 1:40592/140‑1 (MQ=255) tGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTg > 1:322954/1‑140 (MQ=255) gCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTgg > 1:167923/1‑140 (MQ=255) cctcctTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCg > 1:1371507/1‑140 (MQ=255) cctcctTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCg > 2:330474/1‑140 (MQ=255) ctTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑acca > 2:800495/1‑140 (MQ=255) tCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑accacc < 1:579189/140‑1 (MQ=255) tCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑accacc < 1:1356280/140‑1 (MQ=255) caacaaCATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑Accacca < 1:651890/140‑1 (MQ=255) acaacaTTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACg < 2:916306/140‑1 (MQ=255) aacaTTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGtt > 2:1160443/1‑140 (MQ=255) aacaTTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGtt > 2:438318/1‑140 (MQ=255) caTTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGt > 1:791359/1‑140 (MQ=255) ttAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTAc < 2:1262391/140‑1 (MQ=255) tAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACa > 1:274812/1‑140 (MQ=255) aTGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAAc > 2:341184/1‑140 (MQ=255) cATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGcc > 2:955884/1‑140 (MQ=255) tATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCcaagc < 2:410756/140‑1 (MQ=255) aGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAaga < 1:955884/140‑1 (MQ=255) gTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAagag > 2:490053/1‑140 (MQ=255) tAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACg < 1:545995/128‑1 (MQ=255) tAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACg > 2:545995/1‑128 (MQ=255) tAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGc > 1:7912/1‑140 (MQ=255) tAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGc < 2:934810/140‑1 (MQ=255) gCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTg < 2:728590/140‑1 (MQ=255) cATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTgg > 1:333190/1‑140 (MQ=255) aTTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGc > 1:488532/1‑140 (MQ=255) ttAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCg > 2:456106/1‑140 (MQ=255) tAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGa > 2:148679/1‑140 (MQ=255) cGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATg < 2:333190/140‑1 (MQ=255) cGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATg < 1:1105965/140‑1 (MQ=255) cGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTATTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATg < 1:753628/140‑1 (MQ=255) gCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATgc < 1:242785/140‑1 (MQ=255) gCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATg > 2:1145144/1‑139 (MQ=255) gCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATg < 1:1145144/139‑1 (MQ=255) ccTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATgcg < 1:280074/140‑1 (MQ=255) tACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGcgcg < 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caaacaaGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATg < 1:297169/134‑1 (MQ=255) caaacaaGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATg > 2:297169/1‑134 (MQ=255) aacaaGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTtat < 2:167923/140‑1 (MQ=255) caaGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATaa < 1:341184/140‑1 (MQ=255) aaGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAAc < 2:1185160/140‑1 (MQ=255) gCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTa < 2:635497/140‑1 (MQ=255) gCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTa < 2:791359/140‑1 (MQ=255) gCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTa > 1:508546/1‑140 (MQ=255) gCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTa > 2:1207702/1‑140 (MQ=255) ccGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGTAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTAc > 1:487975/1‑140 (MQ=255) cGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTAcc < 1:722500/140‑1 (MQ=255) gTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCGACCACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCt < 2:562680/140‑1 (MQ=255) ttCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTa > 1:450932/1‑140 (MQ=255) gCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCa > 1:663471/1‑140 (MQ=255) tCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGc > 2:275187/1‑140 (MQ=255) aaaGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTg < 2:450932/140‑1 (MQ=255) aaaGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTg < 1:1160443/140‑1 (MQ=255) aaGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCt > 2:1003869/1‑126 (MQ=255) aaGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCt < 1:1003869/126‑1 (MQ=255) tCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAatat < 2:1340123/140‑1 (MQ=255) tAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAg < 1:275187/140‑1 (MQ=255) ataCGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGt < 2:366145/138‑1 (MQ=255) aGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGt < 2:449034/140‑1 (MQ=255) aGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGt < 1:310861/140‑1 (MQ=255) aGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGt < 2:207194/140‑1 (MQ=255) gcgATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGc > 1:395055/1‑140 (MQ=255) gcgATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGc < 1:793506/140‑1 (MQ=255) gcgATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGc > 1:492894/1‑140 (MQ=255) aTGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGt > 2:1322080/1‑133 (MQ=255) aTGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGt < 1:1322080/133‑1 (MQ=255) aTGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGctct > 1:128890/1‑140 (MQ=255) ggAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTgg < 1:780272/140‑1 (MQ=255) gCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTAc > 2:280040/1‑140 (MQ=255) ggCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGtt > 2:447539/1‑140 (MQ=255) ggCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGtt > 2:876852/1‑140 (MQ=255) ggCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGATGTACTACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTCCCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGCCAGCTCTGGGTACgct > 2:1002212/1‑138 (MQ=255) ggCTACTCGGTCGGTACACGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGtt > 2:473894/1‑140 (MQ=255) cTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGa > 2:802113/1‑140 (MQ=255) tACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGaa < 1:1051820/140‑1 (MQ=255) tACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGaa < 1:456106/140‑1 (MQ=255) cTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACg < 1:280040/140‑1 (MQ=255) cggtcggtACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAg < 2:663471/140‑1 (MQ=255) cggtACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAgg > 1:875728/1‑140 (MQ=255) ggtACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGa < 1:187270/140‑1 (MQ=255) ggtACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGa < 1:995188/140‑1 (MQ=255) tACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTGCCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGATc < 1:556843/140‑1 (MQ=255) aCGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGAtat > 1:1375200/1‑138 (MQ=255) gcgTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGATctgc < 1:330474/140‑1 (MQ=255) gcgTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGATctgc < 2:322954/140‑1 (MQ=255) gcgTACCAGTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGATctgc < 1:1153779/140‑1 (MQ=255) acgTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGATctgc < 1:473894/139‑1 (MQ=255) | AGCGTCGTGCAGACCGTGCGTTCCTCCTTCAACAACATTAATGCATCTATCAGTAGCATTAACGCCTACAAACAAGCCGTAGTTTCCGCTCAAAGCTCATTAGACGCGATGGAAGCGGGCTACTCGGTCGGTACGCGTACCATTGTTGATGTGTTGGATGCG‑‑‑ACCACCACGTTGTACAACGCCAAGCAAGAGCTGGCGAATGCGCGTTATAACTACCTGATTAATCAGCTGAATATTAAGTCAGCTCTGGGTACGTTGAACGAGCAGGATCTGC > NC_000913/3179144‑3179417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |