| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 376,401 | 0 | T | G | 23.4% | 131.8 / 13.3 | 64 | L315V (TTG→GTG) | mhpT | 3‑hydroxyphenylpropionate/3‑ hydroxycinnamate:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/32); new base G (15/0); total (32/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.09e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGGCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTGGC > NC_000913/376268‑376534 | gggCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTg > 2:534178/1‑140 (MQ=255) ggCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTTGCGGGGGTGttttc > 2:672209/1‑138 (MQ=255) ggCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGgttgtt > 1:161912/1‑137 (MQ=255) ggCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGgttgtt < 2:161912/137‑1 (MQ=255) ggCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGc > 1:49606/1‑140 (MQ=255) ggCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGc > 1:133469/1‑140 (MQ=255) cgcATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGa > 1:714104/1‑140 (MQ=255) aTTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAg > 2:1300212/1‑140 (MQ=255) tGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTTCGACAggg > 2:314098/1‑139 (MQ=255) tGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGt < 1:314098/140‑1 (MQ=255) aTAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCaa < 1:66479/140‑1 (MQ=255) tAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCaaa < 1:991051/140‑1 (MQ=255) tAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCaaa < 1:28225/140‑1 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTGTTGCGGGGGTGTTTTCGGCAGGTGGGGAAAACg > 2:895457/1‑140 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTTCGACAGGGGGGGAAAggg > 2:1220999/1‑138 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCg < 1:837187/140‑1 (MQ=255) gCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGGGGGGAAAGCg > 2:837187/1‑140 (MQ=255) tGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGtt > 1:765923/1‑140 (MQ=255) tGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGtt < 1:1220999/140‑1 (MQ=255) tCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGGAAAGCGTTTTGt > 1:1174989/1‑140 (MQ=255) tCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGt > 1:876909/1‑140 (MQ=255) tCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGGGGGCAAAGCGTTTTGt > 1:1213350/1‑140 (MQ=255) ccAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTa < 2:568450/140‑1 (MQ=255) aGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTGCGGCAGGTGGGGAAAGCGTTTTGTATg > 2:231193/1‑140 (MQ=255) aGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATg < 2:876909/140‑1 (MQ=255) cATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTgg < 2:1174989/140‑1 (MQ=255) aTGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTTCGACAAGGGGGGAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGc > 2:1221467/1‑140 (MQ=255) tGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCa > 1:1306961/1‑140 (MQ=255) gTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCAc < 2:133469/140‑1 (MQ=255) cGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCg < 2:49606/140‑1 (MQ=255) gCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTTGCGGGGCTGTTTGCGACCGGTGGGGAAAAAGTTTTGTATGCCCCTGCACCgt > 2:890245/1‑140 (MQ=255) aCTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCgttgt > 1:239177/1‑140 (MQ=255) aCTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCggtgt > 1:1185514/1‑140 (MQ=255) tGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGttt < 2:1240183/140‑1 (MQ=255) aTTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTGTCGCGGGGGTGGTTGCGACAAGGGGGGAAAGGGGTTTGTATGCCCCTGCCCCGTTGgtttt > 2:1343026/1‑139 (MQ=255) ttATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACa < 2:599441/140‑1 (MQ=255) ttATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGGAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACa > 1:461884/1‑140 (MQ=255) ataGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGGTTTTTCGCGGGGGTGTTTTCGACAGGGGGGGAAAACGTTTTTTATTCCCTTGCACCGTTGTTTTTCAGt > 2:325973/1‑140 (MQ=255) gCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTTCGACAGGTGGGGAAAGCGGTTTGTTTGCCCCGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAg > 2:923704/1‑140 (MQ=255) aTGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGAt < 1:1213309/140‑1 (MQ=255) tGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATc < 1:231193/140‑1 (MQ=255) ttAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGTTTTGTCGCGGGGGTGGTTTCGGCAAGCGGGGAAAACGTTTTGTATGGCCTGGGAGCCTTGTTTTTCAGTCCGCAGAACcg > 2:581643/1‑140 (MQ=255) tAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTTACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTTGCGGGGTTGGTTTCGGCAGGGGGGGCAAGCGGTTTTTTTTGCCTGGGCCCGTTGTTTTACATTTTGCAGATCcgc > 2:236587/1‑140 (MQ=255) tAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGGGGGGAAAGCGGTTTTTATTCCCTGGCAACGTTGTTTTTCAGTTCGCAGGACcgc > 2:312151/1‑140 (MQ=255) gCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTTTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGGGGGCAAAGCGTTTTGTATGGCCTGGCACCGTTGTTTTTCAGTTCGCAGATCCccgc > 2:698763/1‑140 (MQ=255) ttCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCaa < 1:312151/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCaa < 1:236587/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCaa < 1:890245/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAAc > 2:840319/1‑140 (MQ=255) tCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAAc > 1:175634/1‑140 (MQ=255) cGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACa < 1:1300212/140‑1 (MQ=255) gctgctGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAg > 2:852872/1‑140 (MQ=255) gctgctGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGGTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAg > 2:767873/1‑140 (MQ=255) ctgctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAgg > 1:487231/1‑140 (MQ=255) ctgctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAgg > 1:314446/1‑140 (MQ=255) tgctgGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGGGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAggg > 1:1016778/1‑139 (MQ=255) gcgcTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTggg < 1:672209/140‑1 (MQ=255) gcTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGaa < 2:714104/140‑1 (MQ=255) tGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAg > 1:784471/1‑140 (MQ=255) ggAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGc < 1:982969/140‑1 (MQ=255) gtcgtcATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCgg < 1:895457/140‑1 (MQ=255) gtcgtcATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGGTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGGGTGGGAACAGCCGTGGCgg > 2:1070257/1‑140 (MQ=255) tcATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAgg < 1:325973/140‑1 (MQ=255) tAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTc < 2:314446/140‑1 (MQ=255) tAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTc < 1:923704/140‑1 (MQ=255) aaCGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCt < 2:487231/140‑1 (MQ=255) aCGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTg < 1:1105992/140‑1 (MQ=255) tATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTggggg > 1:396447/1‑140 (MQ=255) tATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTggggg > 1:888351/1‑140 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTAGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCt > 1:1095454/1‑140 (MQ=255) tGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGGTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGGACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGGGGCTggggggg > 2:400347/1‑138 (MQ=255) tGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATg < 2:784471/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAg > 1:1138270/1‑140 (MQ=255) cTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGGAGGGCGGCTGGGGGGTATTAg > 2:1037351/1‑140 (MQ=255) tGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGc < 1:581643/140‑1 (MQ=255) gCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCgg > 2:147097/1‑140 (MQ=255) cGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGt < 2:765923/140‑1 (MQ=255) gcgGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTGGc < 1:852872/140‑1 (MQ=255) | GGGCGCATTGATGGATAAGCTGCGTCCAGTAACCATGTCGCTACTGATTTATAGCGGCATGTTAGCTTCGCTGCTGGCGCTTGGAACGGTGTCGTCATTTAACGGTATGTTGCTGGCGGGATTTGTCGCGGGGTTGTTTGCGACAGGTGGGCAAAGCGTTTTGTATGCCCTGGCACCGTTGTTTTACAGTTCGCAGATCCGCGCAACAGGTGTGGGAACAGCCGTGGCGGTAGGGCGTCTGGGGGCTATGAGCGGTCCGTTACTGGC > NC_000913/376268‑376534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |