| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,296,381 | +GC | intergenic (+587/+55) | gltP → / ← yjcO | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP/Sel1 repeat‑containing protein YjcO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 1 | . | C | 98.6% | 256.9 / ‑3.3 | 69 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP/Sel1 repeat‑containing protein YjcO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (30/38); total (31/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
| * | NC_000913 | 4,296,380 | 2 | . | G | 98.6% | 255.2 / ‑3.3 | 69 | intergenic (+586/+56) | gltP/yjcO | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP/Sel1 repeat‑containing protein YjcO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (30/38); total (31/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
AACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTA‑‑C‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGT > NC_000913/4296303‑4296509 || aaCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAAc > 2:2190774/1‑140 (MQ=0) aTCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTaa > 2:2437434/1‑140 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 2:1936989/1‑140 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 1:1179798/1‑140 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 2:1402157/1‑140 (MQ=255) gCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAAttttt > 1:2555510/1‑140 (MQ=255) ccTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTc > 2:1474171/1‑140 (MQ=255) cTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa > 1:1121559/1‑140 (MQ=255) cTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCa > 2:1231372/1‑140 (MQ=255) tACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaa < 1:1051071/140‑1 (MQ=255) tACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaa < 2:1368168/140‑1 (MQ=255) tACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaa > 2:1251092/1‑140 (MQ=255) aCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 1:1024104/140‑1 (MQ=255) aCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 2:1923351/140‑1 (MQ=255) aCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa < 2:2138561/140‑1 (MQ=255) aCGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATACGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa > 2:1748405/1‑140 (MQ=255) cGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAAc > 1:1845618/1‑140 (MQ=255) gCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTA‑‑CGCCGCGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCaaa > 1:1559031/1‑140 (MQ=14) aGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCtt > 1:2571492/1‑140 (MQ=255) gACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTc > 1:2107793/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTca > 2:1341003/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTca < 1:2124064/140‑1 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGGTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCacac > 2:2154883/1‑140 (MQ=17) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc > 2:2620265/1‑140 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc > 1:1367583/1‑140 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc < 1:1503416/140‑1 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc > 1:1143945/1‑140 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc < 1:2412523/140‑1 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc > 1:1111827/1‑140 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc > 1:1989336/1‑140 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc > 1:1831941/1‑140 (MQ=255) cgcAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACAcc > 1:1666309/1‑140 (MQ=255) cAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCg < 1:2242198/140‑1 (MQ=255) cAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCg < 1:1884574/140‑1 (MQ=255) tAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTa < 1:2243577/140‑1 (MQ=255) aGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTAt > 2:2500089/1‑140 (MQ=255) ccTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCa > 2:2185006/1‑140 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:2059780/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:2305808/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:2461239/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa > 2:1904890/1‑140 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:1831941/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:1457401/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 1:1615134/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 2:1456091/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 1:1874215/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 1:2150953/140‑1 (MQ=255) tGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCaaa < 1:2382608/140‑1 (MQ=255) aTTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAcc > 1:2373762/1‑140 (MQ=255) tttAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAAccc > 1:2218670/1‑140 (MQ=255) tAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCtt < 1:2102242/140‑1 (MQ=255) tGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATa < 2:1801188/140‑1 (MQ=255) gATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATAc < 1:2141457/140‑1 (MQ=255) aTTTTGTAGGTCTGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACa > 2:1575339/1‑140 (MQ=255) 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ggTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 1:2437434/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 1:2549843/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 2:1367583/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 2:1551775/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 2:2555510/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 1:1341003/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 1:1474171/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGTCTATGC‑‑‑‑TGCATCGGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGGCGC‑GTTTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGt < 2:2459917/140‑1 (MQ=38) tCGGATAATGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCTTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACGCCCGGTATCAATCCCTTCCATACAGCTCAGGTTc < 1:1553731/140‑1 (MQ=25) gATAAGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAAc < 2:1932779/140‑1 (MQ=255) aGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGt < 2:1121559/140‑1 (MQ=255) aGGCGTTTACGC‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGt < 2:1529055/140‑1 (MQ=255) || AACGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTTA‑‑C‑‑‑‑CGCATCCGACATCAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGC‑GTCTTATCAGGCCTATCTTAACCGTTGGTTAATTTTTCAAACTCTTCACACCCGGTATCAAACCCTTCCATACAGCTCAGGTTCAACCAGT > NC_000913/4296303‑4296509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |