New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 225496 = | 28 (0.290) | 20 (0.250) +TGGGATCAACACTCATGTGTTGATAA |
7/224 | 4.8 | 55.8% | intergenic (+39/‑4) | ileV/alaV | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala |
? | NC_000913 | = 4037217 | 11 (0.110) | noncoding (77/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
AGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/225578‑225496 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACA < NC_000913/4037217‑4037146 |||||||||||||||||||||||||| aacaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGAC > 1:61941/7‑140 acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACC < 1:11577/135‑1 acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACC < 2:138247/135‑1 acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCAC < 2:372419/130‑1 acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCAC > 1:372419/6‑135 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:926107/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:967054/140‑1 TGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 1:477525/140‑1 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 1:964075/3‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 1:967768/3‑140 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 1:560708/140‑1 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 2:566105/140‑1 TCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG < 2:967768/140‑1 TCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG < 2:964075/140‑1 GAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCT < 2:61941/140‑1 AACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTC > 1:268560/1‑140 CCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAgct < 1:12275/140‑4 CCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAgct < 2:807002/140‑4 gctTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTA > 2:117134/4‑140 tTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCTTAATGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTAaa < 1:249999/139‑3 |||||||||||||||||||||||||| AGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/225578‑225496 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACA < NC_000913/4037217‑4037146 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |