| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 225500 = | 30 (0.310) | 46 (0.600) +GTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAA |
13/216 | 3.1 | 74.1% | noncoding (1/76 nt) | alaV | tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | = 4037217 | 11 (0.110) | noncoding (77/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/225577‑225500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAA < NC_000913/4037217‑4037145 |||||||||||||||||||||||||||||| acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACC > 1:428542/6‑140acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCA > 2:352936/6‑134acaaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCA < 1:352936/129‑1 aaaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTC < 1:274851/137‑1 aaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA < 2:960176/138‑1 aaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA < 2:428542/138‑1 aaTGGAGCCAAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA < 1:860142/138‑1 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTA > 1:686216/6‑140 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTA > 1:587770/6‑140 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTA > 1:57909/6‑140 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTA > 1:350776/6‑140 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA > 2:386739/6‑134 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA < 1:386739/129‑1 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGAC > 2:749481/6‑130 gccaaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGAC < 1:749481/125‑1 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 1:426620/3‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 1:294899/3‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 2:204844/3‑140 aaGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCA > 1:763803/3‑140 aGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGAGTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAG > 2:880680/2‑140 aGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAG > 2:442242/2‑140 aGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAG > 2:373958/2‑140 aGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 1:399191/131‑1 aGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC > 2:399191/2‑132 GCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA > 2:623325/1‑129 GCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCA < 1:623325/129‑1 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCGGGGGT < 1:363415/140‑1 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 2:455475/140‑1 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 2:496229/140‑1 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 1:892202/140‑1 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 2:920159/140‑1 GGATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGT < 1:379264/140‑1 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTG > 2:102978/1‑140 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC < 2:656664/127‑1 GATCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACC > 1:656664/1‑127 TCGAACCGCTGACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCG > 1:305171/1‑140 GACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAg > 1:104331/1‑139 GACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAg > 1:451816/1‑139 ACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAgc < 2:451816/140‑3 ACCTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAgc < 2:104331/140‑3 CTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTG < 2:632978/140‑1 CTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTG < 2:686216/140‑1 CTCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTG > 1:480631/1‑140 ctTGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTAa > 1:774656/3‑139 TGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTAaag > 1:284402/1‑137 TGCAAGGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATGGCCCCGTATTGGGATCAACACTCATGTGTTGATAATGGTGGGCCTTAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCAGCTGAGCTAaag > 2:122252/1‑137 |||||||||||||||||||||||||||||| GATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/225577‑225500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTAGGCCTGAGTGGACTTGAACCACCGACCTCACCCTTATCAGGGGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACAA < NC_000913/4037217‑4037145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |