Predicted mutation | ||||||
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MC JC | NC_000913 | 2,341,362 | Δ18 bp | coding (2791‑2808/3753 nt) | yfaL ← | putative autotransporter adhesin YfaL |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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* | * | ÷ | NC_000913 | 2341362 | 2341379 | 18 | 79 [0] | [0] 83 | yfaL | putative autotransporter adhesin YfaL |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 2341361 | 0 (0.000) | 74 (0.870) | 54/254 | 0.2 | 100% | coding (2809/3753 nt) | yfaL | putative autotransporter adhesin YfaL |
? | NC_000913 | 2341380 = | 0 (0.000) | coding (2790/3753 nt) | yfaL | putative autotransporter adhesin YfaL |
CGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCGCTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGCCAACTTTGGCATTCAACACCGGCTGGTAAGCAGGCGTAGGTTCCGGGTCGGGTGTTGGATCAGGATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2341212‑2341361 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggatcaggatcGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGCCAGACTGAACTGCGCA > NC_000913/2341380‑2341518 CGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCGCTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGCCAACTTTGGCATTCAACACCGGCTGGTAAGCAGGCGTAGGTTCCGGGTCGGGTGTTG > 1:1009562/1‑140 CGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCGCTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGCCAACTTTGGCATTCAACACCGGCTGGTAAGCAGGCGTAGGTTCCGGGTCGGGTGTTG > 1:855270/1‑140 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GGGTCGGGTGTTGGATCAGGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCTTACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCT < 2:292037/140‑1 GGGTCGGGTGTTGGATCAGGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCT < 1:1563213/140‑1 GGGTGTTGGATCAGGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTG > 1:760986/1‑140 GGGTGTTGGATCAGGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTG > 2:115303/1‑140 GGGTGTTGGATCAGGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTG < 2:179795/140‑1 GGTGTTGGATCAGGATCTGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGC > 2:701930/1‑140 CAGGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGCCAGACTGAAC > 2:1407605/1‑140 AGGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGCCAGACTGAACT > 1:1528335/1‑140 GGATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGCCAGACTGAACTG > 1:523325/1‑140 GATCGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGCCAGACTGAACTGC > 2:1271105/1‑140 CGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGCCAGACTGAACTGCGCA < 1:1487663/140‑1 CGTCTGACCATCGCCACCTGCGTGATCGCGTCGCTCCATCATAAACGCCTGATTTGCCGCCCGCAGGTTATTAAGATAACCGCCAACTTTGGCATTCAACACCGGCTGGTAAGCAGGCGTAGGTTCCGGGTCGGGTGTTGGATCAGGATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2341212‑2341361 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggatcaggatcGGGAGTCGGGTCTGGATCAGGTGGCGATGGCGGCGTTACTTCTTGCGATCGCAGATACCAGTCGTTGTTATCTTCCACCAGCGTGTAGTCATACGCTCCCATATTGACGTAGCCGCTGCCTGCCAGACTGAACTGCGCA > NC_000913/2341380‑2341518 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |