Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,275,611 | 0 | A | C | 23.3% | 126.2 / 15.0 | 60 | E110D (GAA→GAC) | garD | galactarate dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/11); new base C (0/14); total (35/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.57e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
AAATTATTCGTTATGGCGAAGTGATTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCAT > NC_000913/3275475‑3275748 | aaaTTATTCGTTATGGCGAAGTGATTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACGCGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAAccc > 1:70392/1‑140 (MQ=255) tattCTTTAGGGCGAAGTGTTTGGTTCCGCCGTGCGTCCAACCCCACGGGAAAGTGGGATCGACAAATAAATGGTTGTACTCCCGGAAGCGCCCCCGTTACACCCGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGACCCCTTAc < 2:1074421/140‑1 (MQ=255) tctttAGGGCGAAGTGTTTGGTTCCCCCGTGCGTGAAACCCCACGGGGAAGTTGGATCGCAAAAAAAATGGTTGTACCCCCGGAAGCCCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACAAAAGCCCCGGACCCCTTAccgc < 2:117640/137‑1 (MQ=255) ggTTATGGGGAGGTGTTTGGTTACGCGGGGCGTCCAACCCCACGCGGAAGTTGGATCAACAAACAAATGTTTGTACCCCGGGAGGCCCCGCCGTTACACCCGCTGCCACTGGCAACCAAAGCCCCGGACCCTTTAccgcc < 2:352580/139‑1 (MQ=255) aTGGCGAAGTGATTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTg > 2:928002/1‑140 (MQ=255) tGGCGAAGTGATTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTgg > 1:696285/1‑140 (MQ=255) gAAGTTTTTGTTTACGCCGTGCGTGCAACCCCACGGGGAGGCGGGACCGCCGAATCAATGGTTGTCCTCCGGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAgg < 2:594557/140‑1 (MQ=255) gtgtTTGGTTCCCCCGTGGGTGCAACCCCACGGGGAAGCGGGACCGAGAAATAAGTGTTTGTACTCCGGGAAGCCCCCCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACAAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATa < 2:1036642/140‑1 (MQ=255) tGATTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCAC‑GGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATaca > 1:240800/1‑140 (MQ=255) tttGGTTCCGCCGGGCGTGCAACCCCCCGGGGAAGCGGGACCGACAAATAAATGGTTGTCCTCCGGGAGGCCCCGCCGTTACCCCCGCTGCCACTGGCAACAAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATacac < 2:280540/139‑1 (MQ=255) aTTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATacac > 2:521782/1‑140 (MQ=255) aTTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATacac > 1:1395305/1‑140 (MQ=255) aTTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATacac > 1:161627/1‑140 (MQ=255) tttccgcgGTGCGTGCAACCCCACGGGGAAGCTGGACCGACAAACCAATGTTTGTCCCCCCGGAAGCCCCGCCGTTACACACGCTGCCAC‑GGCAACCAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTg < 2:240800/136‑1 (MQ=255) cGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAgg > 2:169191/1‑140 (MQ=255) ccGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGc > 2:1336597/1‑140 (MQ=255) gcgtgcAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATc > 1:33387/1‑140 (MQ=255) cgtgcAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCg > 2:601134/1‑140 (MQ=255) cgtgcAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCg > 1:166917/1‑140 (MQ=255) ccccccCGCGGAGGCTGAATCGAAAAACAAAGGTTTTTACTCCGGGAGGCGCCGCCGTTACACCCGCTGCCACTGGCACCCAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGc < 2:835288/138‑1 (MQ=255) aTCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGc > 2:840746/1‑140 (MQ=255) tCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGcc > 2:491635/1‑140 (MQ=255) cccACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCg > 1:891288/1‑140 (MQ=255) aaGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCg > 2:497899/1‑140 (MQ=255) gggATGGAGGAATCAATGGTTGTACTACGGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGACCCTTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTggg < 1:282210/139‑1 (MQ=255) gggATCGACGAATCAATGTTTGTACTCCCGGAGCCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACAAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTggg < 2:33387/139‑1 (MQ=255) gATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCa > 1:760613/1‑140 (MQ=255) ggggTTGTACTCCGGGAGCCCCCGCCGTTACACCCGCGGCCCCTGCCACCAAAAGCCCCGGACCCTTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCt < 2:717378/138‑1 (MQ=255) tGGTTTTACTACCGAAGGCCCCGCCGTTACCCACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTc < 2:891288/140‑1 (MQ=255) gtttGTCCTCCGGGAAGCCCCGCCGTTACACCCGCTGCCACTGGCAACAAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCg < 2:119248/138‑1 (MQ=255) tGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTa > 1:506496/1‑140 (MQ=255) tactacCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATc < 1:406547/140‑1 (MQ=255) ctacCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATcac > 1:1469/1‑140 (MQ=255) ccgggACGCCCCGCCGTTCCACCCGCTGCCACTGCCAACCAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATcacca < 2:702370/137‑1 (MQ=255) acCGGACGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGCCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATcacca < 1:784912/140‑1 (MQ=255) acCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCAGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATcacca < 1:1261575/140‑1 (MQ=255) ccGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATcaccac > 1:740502/1‑140 (MQ=255) ccGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATcaccac > 2:1091686/1‑140 (MQ=255) ccGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATcaccac > 1:306529/1‑140 (MQ=255) cGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCaccacc < 1:497899/140‑1 (MQ=255) cGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCaccacc > 2:410632/1‑140 (MQ=255) cGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCaccacc > 2:1251387/1‑140 (MQ=255) ggAGGCCCCGCCGTTACACCCGCTGCCACGGGCAACCAAAGTCCCGGACCCTTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCAccacca < 2:506496/140‑1 (MQ=255) ggAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCAccacca > 2:1266825/1‑140 (MQ=255) aGCGCCGCCGTTACACACGCCGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCg > 2:515604/1‑140 (MQ=255) cgccgTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCAc > 2:423778/1‑140 (MQ=255) cgccgTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCAc > 2:734780/1‑140 (MQ=255) cggTTCCACACGCGCCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCGTTACCGCCTCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCGATGCCGATGGCAGCGTGGTCACCAAAATCCTGCGCGGTATCACCCCCAGCGTCCACtg < 2:1546420/138‑1 (MQ=255) ccgTAACACACGCTGCCAGTGGAAACAAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACtg < 2:306529/140‑1 (MQ=255) cacGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAg < 2:182140/140‑1 (MQ=255) cacGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAg < 1:840746/140‑1 (MQ=255) agacaggCCACTGGCAACAAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAg < 2:1063000/134‑1 (MQ=255) gCTGCCACTGGCAACCAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCg < 2:1343852/140‑1 (MQ=255) tGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCgtg > 2:681968/1‑140 (MQ=255) cgCCACGGGCAACCAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCgtg < 2:740502/139‑1 (MQ=255) ccACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCgtggt > 2:1248365/1‑140 (MQ=255) cACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCgtggtg < 1:928002/140‑1 (MQ=255) cACTGGAAACAAAAGCCCCGGACCCCTTCCCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCgtggtg < 1:521782/140‑1 (MQ=255) aCTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGtggtgg > 2:603998/1‑140 (MQ=255) cTGGCAACCAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGa < 1:423778/140‑1 (MQ=255) cTGGCAACCAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGa < 1:1091686/140‑1 (MQ=255) cTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGa < 1:601134/140‑1 (MQ=255) cTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGa < 1:681968/140‑1 (MQ=255) cTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGa < 1:1251387/140‑1 (MQ=255) cTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGa < 1:515604/140‑1 (MQ=255) cTGGCAACAAAAGCCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGa < 1:169191/140‑1 (MQ=255) ggCAACAAAAGCCCAGGACCCCTTCCCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACt < 1:1018863/140‑1 (MQ=255) gCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCgtg > 2:1168313/1‑132 (MQ=255) gCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCgtg < 1:1168313/132‑1 (MQ=255) aaCCAAAGTCCCGGACCCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATg < 1:1252042/140‑1 (MQ=255) ccAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGAcctgtct > 1:1063000/1‑134 (MQ=255) cccGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTaaaaa > 1:1025585/1‑140 (MQ=255) ccGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAAt > 2:424153/1‑140 (MQ=255) gAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCAt < 2:1469/140‑1 (MQ=255) | AAATTATTCGTTATGGCGAAGTGATTGGTTACGCCGTGCGTGCAATCCCACGCGGAAGCTGGATCGACGAATCAATGGTTGTACTACCGGAAGCGCCGCCGTTACACACGCTGCCACTGGCAACCAAAGTCCCGGAACCCTTACCGCCGCTGGAAGGATACACCTTTGAGGGCTATCGCAATGCCGATGGCAGCGTGGGCACCAAAAACCTGCTCGGTATCACCACCAGCGTCCACTGTGTGGCAGGCGTGGTGGACTATGTAGTAAAAATCAT > NC_000913/3275475‑3275748 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |