Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,395,845 | C→G | M26I (ATG→ATC) | ynaI ← | small conductance mechanosensitive channel YnaI |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,395,845 | 0 | C | G | 98.9% | 352.6 / ‑4.3 | 90 | M26I (ATG→ATC) | ynaI | small conductance mechanosensitive channel YnaI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (44/45); minor base T (1/0); total (45/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.10e-01 |
ATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTCATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGAAACCCCTGGCGG > NC_000913/1395709‑1395975 | aTTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCtgatc < 1:1126643/140‑1 (MQ=255) aTTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCtgatc < 2:1119301/140‑1 (MQ=255) aTTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCtgatc < 2:317444/140‑1 (MQ=255) aTTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCtgatc < 1:1432282/140‑1 (MQ=255) gTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATc > 1:244292/1‑140 (MQ=255) gTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATc > 1:1464794/1‑140 (MQ=255) gTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAAtgctg < 1:541044/140‑1 (MQ=255) tttCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTgcg > 1:337336/1‑140 (MQ=255) ttCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTgcgc > 2:481286/1‑140 (MQ=255) ttCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTgcgc > 1:313325/1‑140 (MQ=255) cTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAg < 1:1797537/140‑1 (MQ=255) cATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCg > 2:1532592/1‑140 (MQ=255) cATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCg > 2:58251/1‑140 (MQ=255) aTAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGa < 1:617865/140‑1 (MQ=255) taataaTGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGCTTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAaata < 1:481286/140‑1 (MQ=255) aatGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTCTTACGATTTCCACGGCAAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGa < 2:355941/140‑1 (MQ=255) atGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGAc > 1:391074/1‑140 (MQ=255) tACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGa > 2:664619/1‑140 (MQ=255) tACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGa > 1:814702/1‑140 (MQ=255) aCAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAg > 2:834853/1‑140 (MQ=255) aGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAgcg > 2:1290607/1‑140 (MQ=255) cACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCa > 2:1626985/1‑140 (MQ=255) cACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCa > 2:507278/1‑140 (MQ=255) cACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCa > 1:909446/1‑140 (MQ=255) cACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCa > 1:1389600/1‑140 (MQ=255) aCTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTTCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCat < 2:1671213/140‑1 (MQ=255) aCTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCat < 2:1631336/140‑1 (MQ=255) aCTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCat < 1:1266811/140‑1 (MQ=255) aCTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCat < 2:337336/140‑1 (MQ=255) aCTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCat < 2:814702/140‑1 (MQ=255) tGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCatta > 1:1237436/1‑140 (MQ=255) aTAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCattatt > 1:319948/1‑140 (MQ=255) aTAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCattatt > 2:296209/1‑140 (MQ=255) aTAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCat > 1:1608177/1‑136 (MQ=255) aTAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCat < 2:1608177/136‑1 (MQ=255) tATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaa > 1:1002314/1‑140 (MQ=255) tATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaa > 1:663124/1‑140 (MQ=255) tATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaa < 2:981476/140‑1 (MQ=255) aTGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaaa < 2:1389600/140‑1 (MQ=255) aTGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaaa < 2:138271/140‑1 (MQ=255) aTGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaaa < 1:834853/140‑1 (MQ=255) aTGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaaa < 2:663124/140‑1 (MQ=255) aTGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTaaa < 1:115741/140‑1 (MQ=255) tgtAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACTGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGt < 1:842929/140‑1 (MQ=255) tgtAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACTGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGt > 2:842929/1‑140 (MQ=255) tgtAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGt > 1:373511/1‑140 (MQ=255) tgtAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGt > 2:1360509/1‑140 (MQ=255) tAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTc > 2:1948759/1‑140 (MQ=255) tAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTc > 1:254517/1‑140 (MQ=255) tAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTc < 2:727522/140‑1 (MQ=255) gATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAg < 2:319948/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATc < 1:1290607/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATc > 2:344474/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATc > 2:1347631/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATc < 1:344474/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGCACCGCACGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATc > 2:577674/1‑140 (MQ=255) cACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGttt > 1:756872/1‑140 (MQ=255) cACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGttt > 1:1000324/1‑140 (MQ=255) cACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGttt > 1:128425/1‑140 (MQ=255) cGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTAt > 2:1201489/1‑140 (MQ=255) cGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTAt < 2:571968/140‑1 (MQ=255) cGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTAt < 2:313325/140‑1 (MQ=255) cATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCa > 1:1833282/1‑140 (MQ=255) tGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAgg < 2:1854741/140‑1 (MQ=255) tGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAgg < 1:1532592/140‑1 (MQ=255) tGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAgg < 2:20197/140‑1 (MQ=255) tGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAgg < 1:178512/140‑1 (MQ=255) ggAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGc < 1:1201489/140‑1 (MQ=255) gAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGct < 2:148938/140‑1 (MQ=255) aaTAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTAt < 2:419122/133‑1 (MQ=255) aaTAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTAt > 1:419122/1‑133 (MQ=255) aaTAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGctc < 1:1218087/140‑1 (MQ=255) aaTAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGctc < 2:1913902/140‑1 (MQ=255) aTAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGctcc < 1:1948759/140‑1 (MQ=255) aaaaaTCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGctcctc < 2:1464794/140‑1 (MQ=255) cttttcttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAgg > 1:434477/1‑127 (MQ=255) cttttcttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAgg < 2:434477/127‑1 (MQ=255) cttttcttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATaa > 1:993240/1‑140 (MQ=255) cttttcttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATaa > 1:1515840/1‑140 (MQ=255) tttcttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAAtt > 1:900642/1‑140 (MQ=255) tcttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTgt > 2:1008871/1‑140 (MQ=255) ttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCa < 2:559010/129‑1 (MQ=255) ttttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCa > 1:559010/1‑129 (MQ=255) tttACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTgtcgt < 1:1626985/140‑1 (MQ=255) tACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCa < 2:993240/140‑1 (MQ=255) aCGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCAt < 2:1833282/140‑1 (MQ=255) tCCACGGCGAAACCAAAAGCTTATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGa > 2:1569108/1‑140 (MQ=255) tCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGa < 1:928421/140‑1 (MQ=255) tCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGa > 2:95802/1‑140 (MQ=255) tCCACGGCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGa < 1:1008871/140‑1 (MQ=255) gCGAAACCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGAAAcccc > 1:535868/1‑140 (MQ=255) aaaCCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGAAACCCCTgg < 1:664619/140‑1 (MQ=255) aaCCAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGAAACCCCTGGc < 1:95802/140‑1 (MQ=255) ccAAAAGCTGATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGAAACCCCTGGCgg < 2:736282/140‑1 (MQ=255) | ATTTGAGTTTATAGTTTTCTATAACATAATTAATAATGCTACCAACAGCACTGATAATTATGGTGTAGATTAAAAATTGCACCGCATGGAATAAAAATCCTTTTCTTTTACGATTTCCACGGCGAAACCAAAAGCTCATCAGAATCAATGCTGCGCAGCTACCGAAAATAATGACCAGATTAAGCGCATTATTTGTAAACAGTTCAGCGATCATTGTTTTATCAGGCTCCTCCAGATAATTGTCGTCATGCCGGAAACCCCTGGCGG > NC_000913/1395709‑1395975 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |