| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3027249 = | 96 (1.050) | coding (129/1368 nt) | ghxQ | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGG > NC_000913/3027103‑3027373 | ccTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGAc > 1:260273/1‑140 (MQ=255) cGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCtt < 1:309672/140‑1 (MQ=255) gTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCttt > 2:1105410/1‑140 (MQ=255) gTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCttt > 2:1367150/1‑140 (MQ=255) gAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCt < 1:1367150/140‑1 (MQ=255) gAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCt < 2:1084061/140‑1 (MQ=255) aCATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGcc < 2:260273/140‑1 (MQ=255) aCATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGcc < 1:971812/140‑1 (MQ=255) catcatTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCa < 2:725447/140‑1 (MQ=255) atcatTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGcc < 1:1310140/138‑1 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> 1:389466/1‑140 (MQ=255) aaGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTg < 1:1165879/140‑1 (MQ=255) aaGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTg < 2:752279/140‑1 (MQ=255) aGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGa < 2:668985/140‑1 (MQ=255) tACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATg < 1:1301063/140‑1 (MQ=255) tggctggcTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGa > 1:496546/1‑140 (MQ=255) ctggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTa > 1:729075/1‑140 (MQ=255) tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 2:620491/1‑140 (MQ=255) tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 2:155581/1‑140 (MQ=255) tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 2:1463587/1‑140 (MQ=255) tggctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTAt > 2:1440000/1‑140 (MQ=255) gctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATgg < 1:1325518/140‑1 (MQ=255) ctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATggg > 1:422452/1‑140 (MQ=255) ctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATggg < 2:729075/140‑1 (MQ=255) ctTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATggg > 1:1536059/1‑140 (MQ=255) | CCTCGTGAGGACATCATTATGTCTGGAGACATCCTACAAACACCGGACGCACCAAAGCCACAGGGCGCGCTGGATAATTATTTTAAAATTACCGCTCGTGGCAGTACCGTTCGTCAGGAAGTACTGGCTGGCTTAACGACCTTTCTGGCCATGGTTTATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGG > NC_000913/3027103‑3027373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |