| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,745,397 | 0 | A | C | 23.2% | 152.5 / 13.9 | 82 | L198F (TTA→TTC) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/30); new base C (0/19); total (33/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTT > NC_000913/3745260‑3745532 | tCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTTATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTAcc > 2:1806526/1‑140 (MQ=255)tCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTAcc > 1:1025919/1‑140 (MQ=255) ttCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGc < 1:258795/140‑1 (MQ=255) cGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTTCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAg > 1:1308550/1‑140 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCa < 2:195552/140‑1 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCa < 2:22765/140‑1 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTTCCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCAGCa > 2:258795/1‑140 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGACA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCa > 2:798727/1‑140 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGAGTATCC‑TCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGGACTTGCCGCT‑GCTGGATTGTGGGGGCGAGGCTGACGCTTCGCCCGGGGTGGCCGGCGAAGCGCCCAAATTTAGCCCGCCATCaagaaatgagcc > 2:1691520/1‑133 (MQ=255) ggCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTTCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTTCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGAt > 2:1227085/1‑140 (MQ=255) ggCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑ATGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGAt > 1:992275/1‑140 (MQ=255) cGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTTCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCCGCAAAAAGCAACGATGc > 2:1581008/1‑140 (MQ=255) gTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCa < 1:1581008/140‑1 (MQ=255) ttCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTTCCTGGGGGGGGCAGGCCAGTCGCCCTAATTTACCCCCCCCGCAAAAAACAACGATGCAgg > 2:95390/1‑140 (MQ=255) ggATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTg < 2:757873/140‑1 (MQ=255) ttATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCa < 1:1420471/140‑1 (MQ=255) ttATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCa < 1:1744090/140‑1 (MQ=255) cagtCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCActct < 1:1086765/137‑1 (MQ=255) aTCAGTAAGCTGTTTATGGCGGACA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCttt < 1:798727/140‑1 (MQ=255) tCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCTTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCtttt < 2:1594024/140‑1 (MQ=255) tCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCtttt < 1:979535/140‑1 (MQ=255) ccgTAAGCTGTTTCGGGCGGGCA‑TTCCCACGGGCTCAATGTTGGGCGCACCCCTGATGTTCCCCTGGGGGGGGAGGGCGAGTCGCTTAATTTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTg < 2:156650/138‑1 (MQ=255) cAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTg < 2:992275/140‑1 (MQ=255) cAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTg > 1:1203188/1‑140 (MQ=255) tAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGGGGGAGGCCAGTCGCCTTTATTTTCCCCGCCCGCAAAAAACAACGAAGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGtct > 2:118946/1‑140 (MQ=255) aaGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGtctc < 1:1064602/140‑1 (MQ=255) aaGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGtctc < 1:587365/140‑1 (MQ=255) aGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTcc > 2:665034/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTTCCCCCCCCGCAAAAAACAACGATGCAGGAAAACTGGCACCCTTTTGTCTcc > 2:951779/1‑140 (MQ=255) gCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCg > 1:437119/1‑140 (MQ=255) tttATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGGGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGGGGGAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAACAAAGATGCAGGGAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:507396/1‑140 (MQ=255) tttATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:1196911/1‑140 (MQ=255) tttATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 2:1420932/1‑140 (MQ=255) tttATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt < 1:1610827/140‑1 (MQ=255) tttATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:1479943/1‑140 (MQ=255) tttATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:351183/1‑140 (MQ=255) tttATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGAGGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGGGGGAGGCCAGGCGCCCTAATTTTCCCCCCCAGCAAAAAGCAACGAAGCAGGAAATCTGGCACCCTTTTTTCTcccgctg > 2:1086765/1‑135 (MQ=255) tATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCt < 2:1203188/140‑1 (MQ=255) aTGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTg < 1:455699/140‑1 (MQ=255) ggggCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 2:722339/139‑1 (MQ=255) cGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 1:1083998/1‑140 (MQ=255) cGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 2:1083998/140‑1 (MQ=255) cGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGGGGGAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg > 1:307035/1‑140 (MQ=255) ggCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTTGGCGCt < 2:44102/140‑1 (MQ=255) ggCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCt < 1:118946/140‑1 (MQ=255) ggCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCt < 1:95390/140‑1 (MQ=255) gCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTttct < 1:1420932/140‑1 (MQ=255) ccccTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTttctt > 2:957804/1‑140 (MQ=255) cTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCa < 2:1490156/140‑1 (MQ=255) cTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCa < 1:957804/140‑1 (MQ=255) gatgatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGt < 1:677036/135‑1 (MQ=255) gatgatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGt > 2:677036/1‑135 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTcatcat > 1:77262/1‑140 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTcatcat > 1:483979/1‑140 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTcatcat > 2:877352/1‑140 (MQ=255) gatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCatta < 1:1497693/140‑1 (MQ=255) gatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCatta < 2:351183/140‑1 (MQ=255) tgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCattatt > 1:720659/1‑140 (MQ=255) gggCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTg > 1:836435/1‑140 (MQ=255) gggCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTg > 1:138238/1‑140 (MQ=255) aCGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGtt < 1:432987/140‑1 (MQ=255) aCGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGtt < 1:951779/140‑1 (MQ=255) cGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGttt > 2:1368901/1‑140 (MQ=255) cGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGttt > 1:459351/1‑140 (MQ=255) tGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGgttttc > 2:1640581/1‑137 (MQ=255) gATGCTTCCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCTTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCt < 2:507396/140‑1 (MQ=255) gCTTCCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCg < 2:949038/140‑1 (MQ=255) gCTTACGTGGTGGTGGCAGGCCGGTCGCCTTAATTCACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCg < 1:312826/140‑1 (MQ=255) cTTCCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCTTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 2:1308550/140‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 2:1025919/140‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 2:77262/140‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 2:483979/140‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTCTCTcccg > 2:462076/1‑138 (MQ=255) ttcccTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 2:1196911/137‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTATTTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 2:1681362/140‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 2:459351/140‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCAGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 1:665034/140‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 1:1215990/140‑1 (MQ=255) tACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGcc > 2:1726822/1‑140 (MQ=255) tACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGcc > 1:1661043/1‑140 (MQ=255) tACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCCGcc > 2:88591/1‑140 (MQ=255) aCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCt > 1:197889/1‑140 (MQ=255) cTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGt < 1:1227085/140‑1 (MQ=255) tggtggtggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGtt < 1:1806526/140‑1 (MQ=255) ggtggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCCGTTTTcc > 1:852021/1‑140 (MQ=255) ggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCt > 1:609549/1‑140 (MQ=255) ggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTCTCTCCGGCCTGTTTTccccc > 2:504887/1‑139 (MQ=255) gCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTTGCTCCGGGCTGTTTTCCCCTACCGa > 1:14511/1‑140 (MQ=255) gTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGtt < 2:1604205/124‑1 (MQ=255) gTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGtt > 1:1604205/1‑124 (MQ=255) tAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCg < 1:504887/140‑1 (MQ=255) tAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGGACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCg < 2:138238/140‑1 (MQ=255) tAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCg < 2:197889/140‑1 (MQ=255) aTTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGtt < 1:213801/140‑1 (MQ=255) | TCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCA‑TTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTT > NC_000913/3745260‑3745532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |