| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,628,649 | 0 | A | C | 25.0% | 136.0 / 15.2 | 64 | intergenic (+102/+206) | nadR/ettA | DNA‑binding transcriptional repressor/NMN adenylyltransferase NadR/energy‑dependent translational throttle protein EttA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/13); new base C (0/16); total (35/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.39e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACTGGTGCGGGAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAG > NC_000913/4628514‑4628781 | aCTGGTGCGGGAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTg < 1:563880/140‑1 (MQ=255)aCTGGTGCGGGAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTg < 1:106552/140‑1 (MQ=255)aCTGGTGCGGGAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTg < 1:1590141/140‑1 (MQ=255) gTGCGGGAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑g > 2:676389/1‑140 (MQ=255) cGGGAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGt < 2:1696203/140‑1 (MQ=255) ggAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGa > 1:5799/1‑140 (MQ=255) ggAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGa > 1:1576196/1‑140 (MQ=255) ggAGATGAT‑GGGGAGCAGAGATAACCGGGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGGTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGGGAc > 2:537180/1‑140 (MQ=255) gatgGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGcc > 1:421376/1‑140 (MQ=255) cAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGa > 1:1218694/1‑140 (MQ=255) agagATACCCGTGATAAAACTCCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGATTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGGTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTCACCCGCCACGAAATTGAg < 2:1050576/140‑1 (MQ=255) agagATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTAAAAA‑CCTCTCTGGAAGGGGCTGTCGAGATAAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAg < 2:220309/140‑1 (MQ=255) agagATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTAAAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAg < 1:600570/140‑1 (MQ=255) gagaTAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCCCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAgg < 1:134572/140‑1 (MQ=255) acccGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCt < 2:1378366/138‑1 (MQ=255) acccGTGATGAAACTGCTAAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCt < 1:354627/138‑1 (MQ=255) aCCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTa > 1:437515/1‑140 (MQ=255) gTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGATTTTTTTTGATGAGTTAAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAgg < 2:262675/140‑1 (MQ=255) gTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATAAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAgg < 1:189771/140‑1 (MQ=255) gTGATAAACCTGCCCAAAGGCGGGGTATAAAAGTAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCTCTTTGGAAGAGGTTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAC‑CCTGCGC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAgg < 1:1316089/140‑1 (MQ=255) gTGATAAAACTGCTCAAAGGCGAGGTAAAAAATGATTTTTTTTGATGAGTTGAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAAATAAAACAAGTTTTGAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAgg < 2:480803/140‑1 (MQ=255) gTGATAAAACTGCACAAGGGGGAGGTATAAAATGATTTTTTTTGATGAGTTAAAAC‑CCTCTCGGAAAGGGGCTTTCGAGATAAAACAGGTTTAAAAAAAA‑CCTGCAG‑GGGGGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAgg < 2:1218694/140‑1 (MQ=255) tgaAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCtgt > 1:1079550/1‑140 (MQ=255) cTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAg < 1:1197478/140‑1 (MQ=255) cTGCTAAAAGGGGAGGTAAAAAATGATTTTTTTTGATGAGTTAAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATAAAACAAGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAg < 2:1743665/140‑1 (MQ=255) cTGCTAAAAGGCGAGGTATAAAATGATTTTTTTTGATGAGTTAAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATAAAACAAGTTTTAAAAAAC‑CCTGCAG‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAg < 2:1079550/140‑1 (MQ=255) tGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGa > 1:1438246/1‑140 (MQ=255) cTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAg > 2:939427/1‑137 (MQ=255) cTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAg < 1:939427/137‑1 (MQ=255) cTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGAcc > 1:480803/1‑140 (MQ=255) cTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGAcc > 1:746731/1‑140 (MQ=255) aaaGGGGAGGTAAAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTAAAAC‑CCTCTCTGGAAGGGGCTGTCGAGATAAAACAAGGTTTAAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGa < 2:558050/140‑1 (MQ=255) aGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGaaa > 1:902996/1‑140 (MQ=255) gCGAGGTAAAAAATGATTTTTTTTGATGA‑TTGAAAACCCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATAAAACAAGGTTTAAAAAAC‑CCGGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACg < 2:1532511/140‑1 (MQ=255) aGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGgtg > 1:485645/1‑140 (MQ=255) aGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGgtg > 2:1560046/1‑140 (MQ=255) aGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGAGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGgtg > 1:55076/1‑140 (MQ=255) ttataAAATGATTTTTTTTGATGAGTTAAAAC‑CCTCTCGGGAAGGGGCTGTCGAGATAAAACAGGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAG‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGtt < 2:463005/139‑1 (MQ=255) aaTGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCAcgcc > 1:543431/1‑140 (MQ=255) tGATTTTTTTTGATGATTAAAAAC‑CCTCTCGGGAAGGGGCTGTCGAAATAAAACAGGTTTTAAAAAAC‑CCTGCGG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCAcgccgc < 2:434790/140‑1 (MQ=255) aGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCAt > 1:463005/1‑140 (MQ=255) aGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCAt > 1:434790/1‑140 (MQ=255) gTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATc > 1:892030/1‑140 (MQ=255) ttttttGAGGAGTTAAAAC‑CCTCTGTGAAGGAGGGTGTCGAGATAAAAAAAGGTTGAAAAAAA‑CCGGCAG‑GGGGGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCg < 2:421376/140‑1 (MQ=255) ttttGATGAGTTAAAAC‑CCTTTCGGGAAGGGGCTGGC‑AAAATAAAAAAGGTTTAAAAAAACCCTGCAG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGc < 2:1353518/140‑1 (MQ=255) tttGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCa > 1:456840/1‑140 (MQ=255) ggatgaGTTAAAAC‑CCTCTAGGGAAGGGGCTGCGGAAATAAAACAAGTTTAAAAAAAC‑CCCCCAG‑GGGGGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCAtt < 2:1341471/139‑1 (MQ=255) atgaGTTAAAAC‑CCTCTCGGGAGGGGGCTGTCGAGATAAAACAAGTTTTAAAAAAC‑CCTGCGG‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCg < 2:1576196/140‑1 (MQ=255) tgaGTTGAAAC‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCgg < 1:745223/140‑1 (MQ=255) ggaGTTAAAAT‑CCTTTCAGAAGGAGGCTATAGAAATAAAACAAGTTTTAAAAAAA‑CATGCGC‑GGGCGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCgg < 2:55076/139‑1 (MQ=255) ggaGTTAAAAC‑CCTCTCTGGAAGGGGCTGTCGAAATAAAACAGGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCgg < 2:485645/139‑1 (MQ=255) taaaac‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATAAAACAAGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTc < 1:1677786/138‑1 (MQ=255) gacagctGGAAGAGGTTGTGGAAATTAAACAAGGTTTAAAAAAC‑CCGGCGC‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGcc < 2:1182812/135‑1 (MQ=255) ccTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATAAAACAAGTTTTGAAAAAA‑CCTGCAG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGcc < 1:676389/140‑1 (MQ=255) ccTCTCGGGAAGAGGCTGTCGAAATAAAACAGGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGcc < 2:902996/140‑1 (MQ=255) ctctGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGa > 1:13500/1‑140 (MQ=255) ctctGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGa > 2:924410/1‑140 (MQ=255) gagGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGc > 1:1251101/1‑140 (MQ=255) gagGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGc > 2:1248556/1‑140 (MQ=255) gagGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGc > 1:428651/1‑140 (MQ=255) gCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTa > 1:1706819/1‑140 (MQ=255) tGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGcctgtc > 1:1182812/1‑135 (MQ=255) tGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTAcc > 1:1244716/1‑140 (MQ=255) tGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTAcc > 1:1452775/1‑140 (MQ=255) tCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACcgc > 1:1348443/1‑140 (MQ=255) cGAAATAAAACAGGTTTTAAAAAAC‑CCGGCGG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACcgcg < 2:1522956/140‑1 (MQ=37) gagaTAAAAAAAGGTTAAAAAAAC‑CCTGCAG‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGt < 2:13500/140‑1 (MQ=38) aaaataaaaCAGGTTTTAAAAAAC‑CCTGCCG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGt < 2:1251101/134‑1 (MQ=37) gaaatAAACCAGGTTTTAAAAAACCCTGCAG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGt < 2:762186/136‑1 (MQ=38) aaaagagggTTTAAAAAAG‑CGTGCCG‑GGGGGGCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTAt < 2:456840/133‑1 (MQ=25) aaaaCAATGTTTAAAAAAC‑CCGGCCC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTAt < 2:1706819/139‑1 (MQ=38) aaaaCAAGTTTTGAAAAAC‑CCGGCGG‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGTGACGCTTACCGCGTCTTAt < 2:5799/139‑1 (MQ=38) aaaCAAGGTTTAAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATc < 1:1248556/140‑1 (MQ=255) aaaaaGGTTTTAAAAAA‑CCCGGACGGGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATc < 2:746731/137‑1 (MQ=37) aCAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAg > 1:762186/1‑140 (MQ=255) aGGTTTAAAAAAC‑CCTGCCG‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGcc < 2:1438246/140‑1 (MQ=37) gTTTGAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:958865/140‑1 (MQ=255) gTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:1545177/1‑140 (MQ=255) gTTTAAAAAAC‑CCTGCAC‑GGGTGCCCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:518073/140‑1 (MQ=255) ttGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACa > 2:350484/1‑140 (MQ=255) tGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAg > 1:637201/1‑140 (MQ=255) | ACTGGTGCGGGAGATGATGGGGGAGCAGAGATAACCGTGATGAAACTGCTCAAAGGCGAGGTATAAAATGAGTTTTTTTGATGAGTTGAAAA‑CCTCTCTGGAAGAGGCTGTCGAGATTAAACAAGGTTTGAAAAAA‑CCTGCAC‑GGGTGACCCGCCACGAAATTGAGGATGCTAAGGCTGTTGTAGACCGGAAACGGTGTTCACGCCGCATCCGGCATTCGGTGCTCAATGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAGGCCTACAG > NC_000913/4628514‑4628781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |