New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1619397 = | 23 (0.280) | 79 (0.980) | 51/272 | 0.3 | 72.3% | coding (278/435 nt) | marR | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
? | NC_000913 | = 1619460 | 38 (0.470) | coding (341/435 nt) | marR | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
AAGCAAATACTCAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1619536‑1619397 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTC < NC_000913/1619460‑1619325 AAGCAAATACTCAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCT < 1:31563/140‑1 AGCAAATACTCAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTA < 2:618787/140‑1 ATACTCAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGA > 1:340321/1‑140 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 2:106373/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 2:156294/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 1:469130/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 1:428550/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 1:620014/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 1:955210/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 2:604071/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 2:1223696/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 1:1253323/140‑1 CAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 2:81056/140‑1 AAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCGGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCAT < 2:498198/140‑1 AAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCAT < 2:340321/140‑1 AAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA > 1:1366954/1‑139 AAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCA < 2:1366954/139‑1 GTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTT > 1:1016120/1‑140 GCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCAC > 2:730015/1‑140 GCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATG > 2:1061185/1‑129 GCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATG < 1:1061185/129‑1 CCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACA > 1:1381878/1‑140 TTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATT > 1:420497/1‑140 CGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGC < 1:980055/140‑1 CGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGC < 2:275775/140‑1 GTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGC < 2:1307463/140‑1 TCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCC < 1:603376/140‑1 TTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGG < 1:128450/140‑1 TTTTTGTTAGTTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCTGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGT < 2:338795/140‑1 TGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCGGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGT < 2:878883/140‑1 TGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGT > 1:861024/1‑140 AATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTA > 1:137886/1‑140 GTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACG > 2:139140/1‑140 CAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCG < 2:1381878/140‑1 AGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGC > 2:54742/1‑140 GTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGC > 1:1050820/1‑140 TCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCT < 2:238459/140‑1 ACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCG > 1:7961/1‑140 ACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCG > 1:160912/1‑140 ACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCG > 2:1085147/1‑140 CTAATTGATGGCATTGTTCGCATATTGCCGCGCTGCCGGTGGTAAGGTTTCCCAGTCCGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGG < 2:861024/140‑1 CTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGG > 1:905133/1‑140 CTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGG < 1:1229855/140‑1 CTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCCCCGGACGTAACATTTACTAGAACGCCGCGCTCGTCATTCGG > 2:948272/1‑140 GGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAA < 2:40397/140‑1 GGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAA < 2:160912/140‑1 GCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAAC > 1:1302422/1‑140 TTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTT > 1:233736/1‑140 CACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCAC < 1:409887/140‑1 CACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCAC < 1:54742/140‑1 ACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACC < 2:1302422/140‑1 TATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAG < 1:921659/140‑1 TTGCCGCGCCACCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAA < 2:516489/125‑1 TTGCCGCGCCACCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAA > 1:516489/1‑125 GCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACCTATTTCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGCACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTT > 2:774651/1‑140 GCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTT > 1:1234893/1‑140 GCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTT > 2:769912/1‑140 GCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGC < 1:4110/137‑1 GCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGC > 2:4110/1‑137 CCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTT > 1:330193/1‑140 CGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAACCTTTACA > 1:940210/1‑140 CCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTTGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGA < 2:271656/140‑1 CCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGA > 2:494841/1‑140 CCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCA > 1:98465/1‑140 GGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGG < 1:494841/140‑1 TAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATC < 2:338682/140‑1 TAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATC < 2:487994/140‑1 AGTTTTACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCA < 1:1085147/140‑1 TACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATA > 2:368240/1‑140 TACCAGTACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATA < 2:233736/140‑1 ACGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCA > 2:247413/1‑140 CGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG < 1:1308209/140‑1 CGCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG < 2:1050820/140‑1 GCCGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGT < 2:1016120/140‑1 CGCGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGC > 2:1060249/1‑140 CGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTC < 1:351899/140‑1 CGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG < 1:336979/135‑1 CGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG > 2:336979/1‑135 CGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG < 2:1153509/135‑1 CGCTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAG > 1:1153509/1‑135 AAGCAAATACTCAAGTGTTGCCACTTCGTCCGCCGTCAGGTTTTTTGTTAATTCTTGGTGCAGGTCCTGGCCAACTAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1619536‑1619397 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctAATTGATGGCATTGTTCACATATTGCCGCGCCGCCGGTGGTAAGTTTTACCAGTACGCCGCGCTTGTCATTCGGGTTCGGCAACCTTTCCACCCAGCCTTTACAGACCAGGCGATCCAGCATACGGGTCAGTGCTC < NC_000913/1619460‑1619325 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |