| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,429,984 | 0 | T | G | 23.7% | 126.8 / 10.5 | 59 | L41V (TTG→GTG) | cycA | serine/alanine/glycine/cycloserine:H(+)symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/36); new base G (14/0); total (23/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.14e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGTACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCTTT > NC_000913/4429845‑4430123 | ggTACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGgt < 2:759287/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGgt < 2:61560/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGgt < 2:120261/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGgt > 1:120261/1‑140 (MQ=255) tACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGgttg > 1:1053985/1‑140 (MQ=255) tACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGgttg > 2:76928/1‑140 (MQ=255) aCAGGAAGAAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGggtg > 2:752784/1‑140 (MQ=255) aGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGttt > 1:1307792/1‑140 (MQ=255) ggAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTa < 2:805719/140‑1 (MQ=255) gaag‑aaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTAt < 1:1020709/140‑1 (MQ=255) aag‑aaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATg < 1:796639/140‑1 (MQ=255) ag‑aaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCCTTGGTA‑CGGGGTTGGTTTTgg > 1:417363/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATgggg > 2:1204137/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTATgggg > 2:1147252/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGGA‑AGGGGGTGTTTATgggg > 2:1110860/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaCATGGAAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGGCCTTGGGA‑CGGGGGTGTTTTTtggg > 2:462136/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGgt < 2:611692/128‑1 (MQ=255) aaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGt < 1:895422/140‑1 (MQ=255) aaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAGCAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCt < 2:311283/140‑1 (MQ=255) cATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCa < 2:1244219/140‑1 (MQ=255) ggTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTTGCaaaa > 1:761140/1‑140 (MQ=255) gATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGAt < 1:1123441/140‑1 (MQ=255) aTCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTTTGGGGGCTGGCAAAACGAtt > 2:38320/1‑140 (MQ=255) cAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAg < 2:203089/140‑1 (MQ=255) gTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCt > 1:1218941/1‑140 (MQ=255) aGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCg > 2:1123709/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCCTTGGGA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCg > 1:1143311/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCCTTGGGA‑CGGGGGTGTTTATTGGGGGTTGGAAAACGATTAGCCTTGCCGGGGCg > 2:474021/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCg > 1:1163160/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTTTGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGGCg > 2:266557/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCg > 2:850020/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGACGCAATCTCACAACCCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGTCCTTCGCAGCGGGGTTG‑TTATCGGGGGCGGCAAAACAGTGAGCCCTGCCGGGCCg > 2:470556/1‑140 (MQ=255) atCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAtt < 2:1163160/140‑1 (MQ=255) tCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTCCGGCCAAATCTCACAAACCGTCATATTCACCTTATTGCCATTGGTCGTTCCATTGATC‑CTGGGTTGTTTATAGGGGCTTGCAAATCGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAttt < 2:1373362/140‑1 (MQ=255) tCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAttt < 1:1380495/140‑1 (MQ=255) cAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAtttt < 1:1110860/140‑1 (MQ=255) aGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTc < 1:1147252/140‑1 (MQ=255) ggCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCg < 1:462136/140‑1 (MQ=255) ggCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCg > 1:11489/1‑140 (MQ=255) cTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTTTGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGGCGGCGGTCATTTTTGtt > 2:579954/1‑140 (MQ=255) cGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtat < 1:850020/140‑1 (MQ=255) cGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtat < 2:272351/140‑1 (MQ=255) ggCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCCTTTGGG‑CGGGGGTGTTTTTTGGGGCTGGCAAAAAGATTAGCCTTTCCGGGCCGGCGATCATTTTTGtttttt > 2:1380495/1‑137 (MQ=255) ggCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtata < 1:1204137/140‑1 (MQ=255) ggCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtata < 1:628638/140‑1 (MQ=255) ggCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtat < 2:354895/139‑1 (MQ=255) ggCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtat > 1:354895/1‑139 (MQ=255) gCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTatat < 1:464230/140‑1 (MQ=255) gAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGAt < 2:1053985/140‑1 (MQ=255) aaCAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCCTTTGTA‑CGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCCGGGCGTCGGTCATTTTCGTTTATATGATc > 1:594186/1‑140 (MQ=255) aaCAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCCTTGGTA‑CGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTTCCGGGGCGTCGGTCATTTTTGTTTTTATGAtt > 2:492912/1‑139 (MQ=255) aaCAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTTTGGGGGCTGGCAAAAAGATTAGCCTTGCCGGGGCGTCGATCATTTTCGTTTATATGAtt > 2:433931/1‑139 (MQ=255) tCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAtttt > 1:1116239/1‑122 (MQ=255) tCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAtttt < 2:1116239/122‑1 (MQ=255) aCGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCCTTGGTA‑CGGGGGTGTTTTTTGGGGCTGGCCAAAAGATTAGCCTTTCCGGGCCGTCGATCCTTTTCGTTTTTATGATCATTGGttttt > 2:494684/1‑139 (MQ=255) cgcAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGct < 1:76928/140‑1 (MQ=255) tctcACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTTTTGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCtttt > 2:1345114/1‑140 (MQ=255) acaAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTTTGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGTCGGGGCGGCGGTCATTTTCGTTTATATGATCATTGGGTTTATGCTCTTTTTTGt > 2:238294/1‑140 (MQ=255) ccGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGc < 2:301246/140‑1 (MQ=255) cGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCg < 2:939622/140‑1 (MQ=255) tatTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGTCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCaa < 2:1250846/140‑1 (MQ=255) tCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATgg < 2:11489/140‑1 (MQ=255) cAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATggg < 2:1253755/140‑1 (MQ=255) cTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGGCGATCATTTTTGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTTGTGATGCGGGGAATgggggg > 2:407771/1‑139 (MQ=255) ttGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATtg < 1:474021/140‑1 (MQ=255) ttGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATtg < 2:594186/140‑1 (MQ=255) tGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTTGTTTATATGATCATTTGGTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATtgc > 1:429370/1‑140 (MQ=255) tGCCATTGGCGGTGCCATTGGGA‑CGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAAAGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATtgc > 2:223522/1‑140 (MQ=255) cGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGa < 1:244108/140‑1 (MQ=255) gTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGTGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAAt < 1:564596/140‑1 (MQ=255) ccATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTg < 2:417363/140‑1 (MQ=255) ccATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTg < 2:1218941/140‑1 (MQ=255) cATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTgg < 2:227891/140‑1 (MQ=255) tGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAAt > 2:982149/1‑140 (MQ=255) tA‑CGGGGTTGTTTAT‑GGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACaa < 2:1361873/140‑1 (MQ=255) a‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACaa > 1:377296/1‑140 (MQ=255) ggggTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAAt < 2:218149/140‑1 (MQ=255) ggggTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAAt > 1:372282/1‑140 (MQ=255) ttgttTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCttt > 2:821406/1‑140 (MQ=255) | GGTACAGGAAG‑AAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGCCATTGGTA‑CGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCTTT > NC_000913/4429845‑4430123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |