New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3361888 | 64 (1.360) | 3 (0.070) | 3/270 | 4.9 | 4.5% | coding (713/765 nt) | gltF | periplasmic protein GltF |
? | NC_000913 | 3361892 = | 64 (1.390) | coding (717/765 nt) | gltF | periplasmic protein GltF | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AGTTGCTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCT > NC_000913/3361758‑3362024 | aGTTGCTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGAt > 1:158501/1‑140 (MQ=255) ttGCTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCa > 1:77910/1‑140 (MQ=255) gCTCAGCAATCGAGCGCTGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCaaa < 2:581323/140‑1 (MQ=255) gCTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGATAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCaaa < 1:272264/140‑1 (MQ=255) cTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAAc > 1:110540/1‑140 (MQ=255) cAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTg > 2:117084/1‑140 (MQ=255) aGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTgg < 1:729110/140‑1 (MQ=255) aGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTgg < 1:748899/140‑1 (MQ=255) gCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGa < 2:77910/140‑1 (MQ=255) tCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGt < 2:343752/140‑1 (MQ=255) cGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTTGATGGTa < 2:767207/140‑1 (MQ=255) aGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAAc < 2:671374/140‑1 (MQ=255) cgcgGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGt < 1:416227/140‑1 (MQ=255) ggTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCAc < 2:25934/140‑1 (MQ=255) gTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACTGCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTGCTTATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTC‑‑‑TGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATc < 2:594668/140‑1 (MQ=255) ttATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTa > 2:119051/1‑140 (MQ=255) ttATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTa > 2:761950/1‑140 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAGCGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGtt < 1:547654/140‑1 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTTGATGGTAACGt > 2:242094/1‑127 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTTGATGGTAACGt < 1:242094/127‑1 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGtt > 2:547654/1‑140 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGtt < 2:331203/140‑1 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGtt < 2:760061/140‑1 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGtt > 2:54740/1‑140 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGtt < 1:245122/140‑1 (MQ=255) ttGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGtt < 1:119051/140‑1 (MQ=255) tGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTc < 1:670451/140‑1 (MQ=255) gCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCa < 2:604436/140‑1 (MQ=255) aaaaCAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTa < 1:54740/140‑1 (MQ=255) gAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGa < 1:669447/140‑1 (MQ=255) cTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAAc > 1:134927/1‑132 (MQ=255) cTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAAc < 2:134927/132‑1 (MQ=255) gTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACa > 1:58845/1‑140 (MQ=255) ttGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAg > 2:519688/1‑140 (MQ=255) cGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGGCAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGtttttattttta > 2:748040/1‑140 (MQ=255) gTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACg > 1:445395/1‑140 (MQ=255) gTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACg > 1:32356/1‑140 (MQ=255) aCCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCAt > 1:742919/1‑140 (MQ=255) ccTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCAtt < 1:117084/140‑1 (MQ=255) gTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGt < 2:173553/140‑1 (MQ=255) gTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGt < 1:216755/140‑1 (MQ=255) aCTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAg > 2:492638/1‑140 (MQ=255) attgatGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCtat > 1:678698/1‑140 (MQ=255) ttgatGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCtata > 2:791867/1‑140 (MQ=255) gatGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAAc > 1:28080/1‑140 (MQ=255) tgctgcGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTc > 2:88918/1‑140 (MQ=255) tgcGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACT‑GATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGAc < 2:35789/140‑1 (MQ=255) gcGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGAc < 1:491907/140‑1 (MQ=255) cGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGt < 1:705633/123‑1 (MQ=255) cGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGt > 2:705633/1‑123 (MQ=255) cGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTC‑‑‑TGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGAt > 2:164300/1‑140 (MQ=255) gTAAATGACAATACTATTCTTGGTTC‑‑‑TGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTa < 1:164300/140‑1 (MQ=255) aaTGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTa < 1:519688/140‑1 (MQ=255) tATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGAc > 1:544120/1‑140 (MQ=255) tATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGAc < 2:742919/140‑1 (MQ=255) ttCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGcc > 1:523986/1‑131 (MQ=255) ttCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGcc < 2:523986/131‑1 (MQ=255) ttCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACAt > 1:367913/1‑140 (MQ=255) ttCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACAt > 2:123430/1‑140 (MQ=255) ttGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGgt < 1:492638/140‑1 (MQ=255) ttGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGgt > 2:388722/1‑140 (MQ=255) ttGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGgt < 1:74300/140‑1 (MQ=255) ggTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTAt > 2:12285/1‑123 (MQ=255) ggTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTAt < 1:12285/123‑1 (MQ=255) ggTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGcc > 1:161197/1‑126 (MQ=255) ggTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGcc < 2:161197/126‑1 (MQ=255) cTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGgtctgtct < 2:678698/140‑1 (MQ=255) | AGTTGCTCAGCAATCGAGCGCGGTTATTCTGTTGCAAAAACAGGGGAACTGACACCTGTTGCTATTACAGCGGTCACCTTCCCGTTACTGATTGATGCTGCGGTAAATGACAATACTATTCTTGGTTCTGATGAAACGATCAAACTGGATGGTAACGTCACTATCAGCGTTCAGTATTTATAAGAACTTGTAATACAGTTTTTATTTTTACGCATTAACCAGTTAGCTATAACTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCT > NC_000913/3361758‑3362024 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |