New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4309123 = | 52 (1.100) | 54 (1.150) | 40/274 | 0.1 | 56.1% | coding (347/981 nt) | alsC | D‑allose ABC transporter membrane subunit |
? | NC_000913 | = 4309833 | 33 (0.700) | coding (1148/1533 nt) | alsA | D‑allose ABC transporter ATP binding subunit |
AGTTTTTCGCTATCCTGGTCGCTGGTATCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4309261‑4309123 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGCTGTTGCCCGG < NC_000913/4309833‑4309696 AGTTTTTCGCTATCCTGGTCGCTGGTATCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGT > 1:404047/1‑140 GTCGCTGGTATCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCG > 2:211019/1‑140 TGGTATCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAA > 2:259854/1‑140 TGGTATCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAA > 2:755077/1‑140 TGGTATCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAA > 2:387064/1‑140 TCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCA > 1:149852/1‑140 ACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACG < 1:462681/140‑1 ACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCCGAAAATCAACG > 1:523647/1‑140 CTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCG < 1:387064/140‑1 CTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAA < 1:704549/140‑1 TCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAAC > 1:769653/1‑140 GTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTAGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGC < 2:540262/140‑1 TTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCT < 2:404047/140‑1 TTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCT < 1:211019/140‑1 TGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTG < 2:769653/140‑1 GGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGG < 1:441928/140‑1 CGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCG < 2:434518/140‑1 CGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCG < 1:80879/140‑1 ATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGA > 2:734660/1‑140 TTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAA < 1:734660/140‑1 TCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAA > 1:272401/1‑140 CGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCA < 1:231422/140‑1 CCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGT < 2:647008/140‑1 CGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTA < 2:136320/140‑1 TATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAAC < 1:711193/140‑1 GTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGA > 1:344863/1‑140 TGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAA > 2:552478/1‑140 TGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAAC > 1:23720/1‑135 TGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAAC < 2:23720/135‑1 CCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATAT > 2:370637/1‑140 CGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATC > 1:478855/1‑140 CGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATC > 2:522858/1‑140 CGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATC > 2:429150/1‑140 CGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATC > 1:662876/1‑140 CGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTA < 1:782403/128‑1 CGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTA > 2:782403/1‑128 GCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATA < 2:116612/137‑1 GCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATA > 1:116612/1‑137 AAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCG < 1:522858/140‑1 AAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCG < 1:711416/140‑1 TGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTC < 2:478855/140‑1 ACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCA > 1:720002/1‑140 CCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGA < 1:259854/140‑1 CGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTG > 2:170933/1‑140 CAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGAT < 1:370637/140‑1 TGATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAA > 2:361509/1‑140 GATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAA < 2:620392/140‑1 GATTGGCGGTGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAA < 2:662876/140‑1 TGTACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGC > 2:107601/1‑140 TACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGCTG > 2:368312/1‑140 TACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGCTG > 1:745386/1‑140 TACTGGTTGGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGCTG < 1:170933/140‑1 GGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGCTGTTGCCCGG < 2:272401/140‑1 GGTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGCTGTTGCCCGG > 1:574800/1‑140 AGTTTTTCGCTATCCTGGTCGCTGGTATCGACCTCTCGGTTGGCGCGATTCTGGCGCTTTCCGGTATGGTGACCGCCAAACTGATGTTGGCAGGTGTTGACCCGTTTCTCGCAGCGATGATTGGCGGTGTACTGGTTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4309261‑4309123 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTTGACGAGCAACGTACCGCTGAAAATCAACGCGAACTGCTGGCGCTGAAATGTCATTCGGTAAACCAGAATATCACCGAACTCTCCGGGGGAAATCAGCAGAAAGTCCTGATCTCCAAATGGCTGTGCTGTTGCCCGG < NC_000913/4309833‑4309696 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |