| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,453,709 | G→A | intergenic (‑67/‑218) | paaZ ← / → paaA | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,453,709 | 0 | G | A | 100.0% | 245.2 / NA | 67 | intergenic (‑67/‑218) | paaZ/paaA | oxepin‑CoA hydrolase/3‑oxo‑5,6‑dehydrosuberyl‑CoA semialdehyde dehydrogenase/phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, monooxygenase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (26/41); total (26/41) | |||||||||||
GTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACT > NC_000913/1453574‑1453844 | gtgAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCt > 2:249639/1‑140 (MQ=255) tgAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCtt > 2:73016/1‑140 (MQ=255) cAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAAc > 2:818098/1‑140 (MQ=255) cAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAAc < 1:73016/140‑1 (MQ=255) 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tACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt > 1:356905/1‑127 (MQ=255) tACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGAt < 2:356905/127‑1 (MQ=255) ggATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCgg < 2:263104/140‑1 (MQ=255) aTAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGaa < 2:362462/140‑1 (MQ=255) aaGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGaaaa < 2:521622/140‑1 (MQ=255) gAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACa > 2:558489/1‑140 (MQ=255) 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2:162614/1‑140 (MQ=255) aaaaaGCAAAGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGa < 1:699297/140‑1 (MQ=255) gCAAAGAATCCTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTa < 1:63949/140‑1 (MQ=255) aaaGAATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACt > 1:146520/1‑140 (MQ=255) | GTGAATCAAACGGCTACGGCCCCGGCCAGACTGCCAGGTACCGGATAAGAAACTGGCTAACTGCTGCATCGCTACTCTCCAGATGTTTCACATTTCTGTTGCTAATAGTTAAATCGCGAATCATAAAAAGCAAAGGATCTTTTAACGAAATGTTAACTATGCGATCTGTATAGCAACTGCGGAAAACATTAATGCACTGATAAATAATGATTTATAAAAATAGGGTGCGAAATCCGTCACAGTTCAAACATACAAAATTTGTGATTTTACT > NC_000913/1453574‑1453844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |