| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 377351 = | NA (NA) | noncoding (16/37 nt) | other | REP32a | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
TGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTA > NC_000913/377212‑377490 | gCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATg < 2:1970415/140‑1 (MQ=255) gCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATg < 1:1891905/140‑1 (MQ=255) agcagTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcgc < 2:2170212/140‑1 (MQ=255) taGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt < 2:2585298/140‑1 (MQ=255) taGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt < 2:2783995/140‑1 (MQ=255) aGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCa > 1:3025328/1‑140 (MQ=255) tgtTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg < 2:2178761/140‑1 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc < 2:1923977/140‑1 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:64475/1‑140 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGAcc > 2:1487460/1‑140 (MQ=255) tGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 2:247671/1‑140 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGt > 1:1202628/1‑127 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt < 2:2105506/132‑1 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:2880644/140‑1 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:1338919/1‑140 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:2833677/1‑140 (MQ=255) 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tGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAg < 2:1820771/140‑1 (MQ=255) gcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGcc > 1:1555335/1‑140 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt < 2:561737/130‑1 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 1:561737/1‑130 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 1:532044/1‑140 (MQ=255) cTGATGCGACGCTATGCCCGTCTTATCAGGCCTCG‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGCTAAGGCGTCCACGCCGCCTCCGGCAGTCGTGCGCCATG‑CTGATGCGACGCTTTGCGCGCCTTATCAGGACTACGGCTTa < 2:3297054/140‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 1:1790654/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGTGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:473247/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTAcaaattcc < 2:983147/140‑8 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:389945/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:999107/140‑1 (MQ=255) tGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACgg < 1:1459499/140‑1 (MQ=255) cGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GTGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGc < 2:2988690/140‑1 (MQ=255) cGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGc > 1:2631223/1‑140 (MQ=255) gACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 2:289181/140‑1 (MQ=255) gACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 2:1899857/140‑1 (MQ=255) gACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 2:1772746/140‑1 (MQ=255) gACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 1:965361/140‑1 (MQ=255) gACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 1:901905/140‑1 (MQ=255) aCGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:2103066/1‑126 (MQ=255) aCGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGa > 2:1384903/1‑140 (MQ=255) tATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAgtg < 1:231011/140‑1 (MQ=255) | TGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTA > NC_000913/377212‑377490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |