| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,387,243 | Δ2 bp | coding (524‑525/1542 nt) | tyrR → | DNA‑binding transcriptional dual regulator TyrR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,387,243 | 0 | T | . | 100.0% | 209.1 / NA | 49 | coding (524/1542 nt) | tyrR | DNA‑binding transcriptional dual regulator TyrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (25/24); total (25/24) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 1,387,244 | 0 | G | . | 100.0% | 209.1 / NA | 49 | coding (525/1542 nt) | tyrR | DNA‑binding transcriptional dual regulator TyrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (25/24); total (25/24) | |||||||||||
GCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGAACA > NC_000913/1387111‑1387375 || gCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACcggtgc < 2:468690/140‑1 (MQ=255) tAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACcggtgcggtg > 2:1036794/1‑140 (MQ=255) aaTTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCggtgg < 2:792839/140‑1 (MQ=255) ttttttACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGgtggtg < 1:868299/140‑1 (MQ=255) tttACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATg < 1:438165/140‑1 (MQ=255) gTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCg < 2:1165821/140‑1 (MQ=255) tGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGAt < 1:760323/140‑1 (MQ=255) gCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCa > 1:1133164/1‑140 (MQ=255) cTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCaa < 1:377820/140‑1 (MQ=255) gAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGa < 1:866536/140‑1 (MQ=255) gAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTa > 1:1020607/1‑140 (MQ=255) cAAGATTCGCATAACGAGCATGTTGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGgcc < 2:218770/140‑1 (MQ=255) gAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATg > 2:706959/1‑140 (MQ=255) cATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTcg < 1:1036794/140‑1 (MQ=255) cATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTcg < 2:692559/140‑1 (MQ=255) cATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTcg < 2:1133164/140‑1 (MQ=255) tGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTcgcc > 1:49093/1‑140 (MQ=255) attaATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAgg > 1:1200448/1‑140 (MQ=255) attaATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTAAGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAgg > 1:647284/1‑140 (MQ=255) gggCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCa > 2:323826/1‑140 (MQ=255) ggCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAg < 2:1366702/140‑1 (MQ=255) cAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAgcg > 1:1153666/1‑140 (MQ=255) cAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAg > 1:931842/1‑138 (MQ=255) cAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAg < 2:931842/138‑1 (MQ=255) aaTTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCt > 1:964547/1‑140 (MQ=255) aTTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCg > 2:384340/1‑140 (MQ=255) 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2:855568/1‑140 (MQ=255) tttATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGccc > 2:1235634/1‑140 (MQ=255) tttATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGccc > 1:1391919/1‑140 (MQ=255) tttATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGccc > 2:1239466/1‑140 (MQ=255) tttATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGccc > 2:1205231/1‑140 (MQ=255) tttATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGccc > 1:938377/1‑140 (MQ=255) tCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGaaa > 2:1111179/1‑140 (MQ=255) tCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATg < 1:706959/140‑1 (MQ=255) tCAGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATg < 1:1216048/140‑1 (MQ=255) aGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGaa > 2:293888/1‑140 (MQ=255) aGGATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGaa > 1:516718/1‑140 (MQ=255) gATGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGc < 1:384340/140‑1 (MQ=255) aTGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCa < 2:964547/140‑1 (MQ=255) aTGAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTAAGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGGAAATGAAGCa < 2:647284/140‑1 (MQ=255) gAAAATGATCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCAtg < 1:524923/140‑1 (MQ=255) aTCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGa > 1:176350/1‑140 (MQ=255) tCAACACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGaa < 2:1200448/140‑1 (MQ=255) aaCACGTCC‑‑ACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGAACa < 1:323826/140‑1 (MQ=255) || GCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGATCAACACGTCCTGACCGGTGCGGTGGTGATGTTGCGATCAACGATTCGTATGGGCCGCCAGTTGCAAAATGTCGCCGCCCAGGACGTCAGCGCCTTCAGTCAAATTGTCGCCGTCAGCCCGAAAATGAAGCATGTTGTCGAACA > NC_000913/1387111‑1387375 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |