New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4512054 = | 61 (0.740) | 4 (0.050) | 4/256 | 6.6 | 5.2% | coding (361/957 nt) | fecD | ferric citrate ABC transporter membrane subunit FecD |
? | NC_000913 | 4512149 = | 88 (1.160) | coding (266/957 nt) | fecD | ferric citrate ABC transporter membrane subunit FecD | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4512200‑4512054 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACA > NC_000913/4512149‑4512280 TACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGC < 1:423385/140‑1 CAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:1396003/140‑1 CAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 2:684130/140‑1 GGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 1:1213131/1‑140 GGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 2:1190005/1‑140 GGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:921025/140‑1 GATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACTATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 2:777092/140‑1 GATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 2:571642/140‑1 GATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 2:1372888/140‑1 GATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:76035/140‑1 TTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:344307/138‑1 TTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG > 2:344307/1‑138 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCA > 1:817024/1‑140 GGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > 2:90270/1‑136 GGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC < 1:90270/136‑1 TCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACA < 2:817024/140‑1 GGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATA < 1:162405/140‑1 GGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATA > 1:1334305/1‑140 GCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATAC > 1:1184997/1‑140 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTGCATCAATACA < 2:76035/140‑1 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACA > 2:1127552/1‑140 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACA > 1:736748/1‑140 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACA > 1:553263/1‑140 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCA > 2:357281/1‑135 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCA < 1:357281/135‑1 TACAGGGGATTGTGCGCAACCCTCTGGCATCACCGGATATTCTCGGTGTTAACCATGCCGCCAGCCTGGCCTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/4512200‑4512054 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCACGGCGAGGGCTGCACCGACAAACAGTGCCAGCAGCAAGCGCGGCAGTCGGTACTCCATCAATACA > NC_000913/4512149‑4512280 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |