Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,240,985 | 0 | T | G | 23.7% | 119.3 / 12.6 | 59 | S348A (TCT→GCT) | sstT | serine/threonine:Na(+) symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (9/36); new base G (14/0); total (23/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.14e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTC > NC_000913/3240846‑3241112 | gggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGt < 1:979261/140‑1 (MQ=255) gggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGt < 1:363401/140‑1 (MQ=255) gggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGt < 1:547179/140‑1 (MQ=255) gggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGt < 1:890592/140‑1 (MQ=255) gggcgCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGt < 1:1123121/140‑1 (MQ=255) cagcaATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTctg < 1:1374854/140‑1 (MQ=255) ttACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 2:557155/140‑1 (MQ=255) ttACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa > 2:1293639/1‑140 (MQ=255) ttACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 1:870229/140‑1 (MQ=255) ttACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCa < 1:1100522/140‑1 (MQ=255) ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCCGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGa < 2:677032/132‑1 (MQ=255) ccGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCCGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGa > 1:677032/1‑132 (MQ=255) cGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTgg > 1:947861/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCCTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTgg < 2:819793/140‑1 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGcc < 1:390193/140‑1 (MQ=255) tgtTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑‑GGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 1:996009/140‑1 (MQ=255) cttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTTTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCt < 1:1029860/139‑1 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTctgctgct > 1:217288/1‑125 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTctgctgct < 2:217288/125‑1 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg > 2:861156/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg > 2:733570/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGcccg > 2:1020241/1‑138 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTg > 1:1194915/1‑140 (MQ=255) ttGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGAATTCCGGTGGATCTGCCCACGTCCCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGGTCTGCTGCTGCTCCCACTGGCCtt > 2:1029860/1‑139 (MQ=255) gACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGa < 2:731537/125‑1 (MQ=255) gACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGa > 1:731537/1‑125 (MQ=255) cGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAat < 2:1194915/140‑1 (MQ=255) ctggctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAatat > 1:519194/1‑140 (MQ=255) ggctgCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGt > 1:1126524/1‑140 (MQ=255) aTACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg < 1:204175/140‑1 (MQ=255) aTACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCATGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGTGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCg > 1:658786/1‑140 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGata > 1:1297648/1‑140 (MQ=255) gggTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGata < 1:1009343/140‑1 (MQ=255) ttCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGcc < 2:947861/140‑1 (MQ=255) tCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTTGAACGATATCGccc > 2:877325/1‑139 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATTTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg < 1:1389665/140‑1 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCg < 2:468711/132‑1 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 1:225473/1‑140 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 1:325430/1‑140 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAg > 1:406170/1‑140 (MQ=255) tCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAACGATATCg > 1:468711/1‑132 (MQ=255) cGATCTGCCCACGGCTCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACCGGCCTGTAATATTTTTGGGATTTTTAACGATATCCCCCTGCCgg > 2:972202/1‑140 (MQ=255) cTGCCCACGGCGCTACTGTGGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTGTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAggtggt < 2:851607/140‑1 (MQ=255) cACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg < 1:1365476/140‑1 (MQ=255) cACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg < 1:1266929/140‑1 (MQ=255) cACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCg < 2:225473/140‑1 (MQ=255) tgctgTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCttt > 1:94733/1‑140 (MQ=255) ttGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTatcat < 1:616528/140‑1 (MQ=255) gAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGGTATCGCCATGCAGGGGGGTGCCGTCGGCTTTATCATCg > 2:181005/1‑140 (MQ=255) gAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGGTGCCGTCGGCTTTatcatcc > 2:417848/1‑139 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg > 1:1349772/1‑140 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:1293639/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:972202/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:798175/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:733570/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 2:94733/140‑1 (MQ=255) cGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:861156/140‑1 (MQ=255) tggtggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGTGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTa < 2:658786/140‑1 (MQ=255) gacaggCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTa < 1:369733/136‑1 (MQ=255) tctcTGTGTGCCTGTGGCGCATCCTGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg > 2:52478/1‑131 (MQ=255) tctcTGTGTGCCTGTGGCGCATCCTGCGTGGCGGGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCg < 1:52478/131‑1 (MQ=255) tgCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGGATTTCGAAAGATATCGCCCTGCAGGGGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGGATTGCAGGACTCCTgtc > 2:369733/1‑138 (MQ=255) tgtgGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAAAATGTTTGGGATTTTGAACGGTATCGCCATGCGGGGGGGTGCCGGCGGCTTTTTCATCGGCGTATTGCAGGGCTCTTGCGAAAc > 2:648528/1‑140 (MQ=255) gtgGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAAcc < 1:1370591/140‑1 (MQ=255) gcgcATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACcgcg < 2:1297648/140‑1 (MQ=255) gcgcATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGGCTCTGCTGCTGATCCCCCTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTTGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATTATCGGCGTATTGCAGGGCTCTTGCGAAACcccg > 2:219564/1‑140 (MQ=255) aTCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGa < 2:384415/140‑1 (MQ=255) ggCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAActc < 1:648528/140‑1 (MQ=255) gTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTc < 2:1349772/140‑1 (MQ=255) | GGGCGCAGCAATCACTATTACCGTGTTGACGCTGGCTGCGGTTAATACGCTGGGTATTCCGGTCGATCTGCCCACGGCGCTGCTGTTGAGCGTGGTGGCTTCTCTGTGTGCCTGTGGCGCATCCGGCGTGGC‑GGGGGGGTCTCTGCTGCTGATCCCACTGGCCTGTAATATGTTCGGTATTTCGAACGATATCGCCATGCAGGTGGTTGCCGTCGGCTTTATCATCGGCGTATTGCAGGACTCTTGCGAAACCGCGCTGAACTCTTC > NC_000913/3240846‑3241112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |