Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,111,747 | 0 | G | T | 32.8% | 124.0 / 35.7 | 58 | N156K (AAC→AAA) | yiiQ | DUF1454 domain‑containing protein YiiQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/6); new base T (0/19); total (33/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-10 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGAT > NC_000913/4111608‑4111884 | ctttTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACgtttg > 2:1163406/1‑140 (MQ=255) ttttGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACgtttgtt < 2:29276/140‑1 (MQ=255) ttGTCTTTTATTAAACCCTCCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGTTTAATCGTTTA‑AACAGCGAAGGCCCCCCCCTTTC‑CGCCGTT‑GCCCGCAAAAACATAC‑CGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAAAAACTtttttttt < 2:1889140/140‑1 (MQ=255) ttATTCAACCCTTCAAGCGATTAAGATACCCCCATTTTAATCGTTTA‑AACAGCGAGGGCCACCCCTTTTC‑CGCCTTT‑GCCCGCAAAAACATAC‑CGCAGTCCCCTTTCTGTCTCGGTGTAATACCTTTTTTTTTCCCccgc < 2:2397533/140‑1 (MQ=255) tCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGa > 1:627507/1‑140 (MQ=255) tCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGa > 1:1852194/1‑140 (MQ=255) cAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGAc > 1:1896000/1‑140 (MQ=255) gtttCAGATAGCGCCAGTTTAATCGGTAA‑AACAGGGAGGGTCACCCCTTTTC‑CGCCGTT‑GTCCGAAAAAAAAAAA‑CGCGGGCCCCTTTTTGTCTGGGTATAATACTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAg < 2:2296345/138‑1 (MQ=255) gATTCAGATGGCGCCAGCTTAATGGGTTC‑AACAGCGAGGGTCCCCCCTTTTC‑CGCCGTT‑GCCCGCAACAACATAA‑CGCGGTCCCCCTCCTGTCTGGGTGTAATAACTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAg < 2:1198930/140‑1 (MQ=255) ttgaGATAGCGCCATCTTAACGGGTTC‑AACGGCGAGGGCCCCCCCCTTTC‑GCCCGTT‑GTCGCCGACAACATAA‑GGCGGCGCACTTTCTGTCTCGGTTTAATAGTGTTTGTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt < 2:1913928/137‑1 (MQ=255) ttCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt > 1:1435040/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGc > 1:1694898/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGc > 1:2222709/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 2:22624/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 1:1798439/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 1:1715062/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 1:2224366/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 2:816146/1‑140 (MQ=255) ccaagattAACCGCTCC‑AACGGCGAGGCTCCCCCCTTTTT‑CGGCGTT‑GCCCTCCACAACAAAC‑CGCAGCGCCCCTTCTGTCTCGGTGTAATAGGTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt < 2:1039005/134‑1 (MQ=255) cTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgtg > 1:2270087/1‑140 (MQ=255) tAATCGTTTC‑AACAGCGAGGGCCCCCCCTTTTC‑CGCTGTT‑GCCCGCGACAAAATAC‑CGCAGTCCCCCTCCTGCCTGGGTGTAATATTTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGtt < 2:1852194/140‑1 (MQ=255) tAATCGGTAA‑AACGGCGAGGGTCACCCCTTTTT‑CGCCGTT‑CCCCGCGACAACAAAA‑CGCGGTCCCCCTTCTGTCTGGGTTTAATAATTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGtt < 2:763181/140‑1 (MQ=255) taacGGTTCAAACAGCGAAGGTCCCCCCCTTTT‑C‑CCGTTGGCCCGAAAAAACAACA‑CGCCGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATACCGTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGtt < 2:2310192/137‑1 (MQ=255) actCGGTCC‑AACAGCGAGGGTCACCCCTTTTC‑CGCCGTT‑GCCCGCAACAACATAA‑CGCAGTCCACTTTCTGTCTCGGTGTAATATTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGttt < 2:952118/138‑1 (MQ=255) tCGGTTA‑AACAGGGAAGGTCACCCCTTTTC‑CGCCGTT‑GCCCGCGAAAAAATAC‑CGCAGTGCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATAATTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTg < 2:1081115/140‑1 (MQ=255) ggTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTCAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGt < 1:552813/140‑1 (MQ=255) ggtcaaaCAGCGAAGGCCCCCCCTTTTT‑CGCTGTT‑GTCCGCGAAAACATAC‑CGCAGTGCCCCTTCTGTTGCGGTATAATATCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGt < 2:2406929/135‑1 (MQ=255) ttC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCa > 1:1171485/1‑140 (MQ=255) ttaaaCAGCGAGGGTCACCCCTTTTT‑CGCCGTT‑GCCCGCAAAAACATAA‑CGCAGTGCTCTTTCTGTCTGGGTTTAATACTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCa < 2:1953524/137‑1 (MQ=255) c‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCAtt > 1:700879/1‑140 (MQ=255) c‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCAtt > 1:9501/1‑140 (MQ=255) aaCAGCGAAGGTCACCCCTTTTC‑CGCGGTT‑GCCCGCAAAAAAATAC‑CGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAATTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTa < 2:386418/140‑1 (MQ=255) aCAGGGAGGGTCCCCCCTTTTT‑CGCCGTT‑GCCCGCAACAAAATAA‑CGCGGTGCACTTTCTGTCTGGGTGTAATATGTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTaa < 2:2056384/140‑1 (MQ=255) ggAAGGTCCCCCTTTTTC‑CCCCGTT‑GTCCGC‑AAAAAATAACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAGTGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATggg < 2:1171485/139‑1 (MQ=255) agggcccgCCCTTTTT‑CGCCGTT‑GCCCGCAACAACATAA‑CGCAGTCCACTTTCTGTCTGGGTAAAATAATTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1694898/133‑1 (MQ=255) agggTCACCCCTTTTT‑CGCCTTT‑GTCCGCGACAAAATAA‑CGCAGTGCACTTTCTGTCTGGGTGTAATATTTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1048090/138‑1 (MQ=255) aaGGTCTCCCCTTTTC‑CGCGGTT‑GTCCCCGACAACATAA‑CGCGGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATACCTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1798439/140‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 1:1953524/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 2:1404739/1‑140 (MQ=255) agggcccccccTTTTCCGCCGTT‑GCCCGCAAAAAAATAC‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTGGGTGTAATACTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1285866/133‑1 (MQ=255) agggccaccccTTTTCCGCCGTT‑GCCCGCGAAAACATAA‑CGCGGTGCCCTTTCTGTCTGGGTGTAATAGCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1516571/133‑1 (MQ=255) ggTCACCCCTTTTC‑CGCTGTT‑GCCCGCTACAAAATAG‑CGCGGTCCACCTTGTTTCTGGTTTTAATAGTTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGa < 2:1715062/140‑1 (MQ=255) ccccTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGAAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGc > 1:1176349/1‑140 (MQ=255) t‑CGCCGTT‑GTCCGCAACAACATAA‑CGCAGTGCACTTTCTGTCTGGGTGTAATATTTTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCAc < 2:1454691/140‑1 (MQ=255) cGCCTTT‑GTCCGCAACAACATAC‑CGCAGTCCCCCTTCTGTCTTGGTTTAATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCAcc < 1:1277652/140‑1 (MQ=255) gTT‑GCCCGCAAAAAAAAAC‑CGCAGTGCCCTTTCTGTCTGGGTGTATTATTTTTTGTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTg < 2:700879/140‑1 (MQ=255) t‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGcc > 1:2210538/1‑140 (MQ=255) tccccGCAAAAAAATAC‑CGCAGTCCCCCTTTTGTCTGGTTTAAATATCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGcc < 2:331128/137‑1 (MQ=255) caacaTAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTcc > 1:575925/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:747985/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:72118/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 2:2101293/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:1921707/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 2:2291560/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 2:2303313/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:1313141/1‑140 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:555995/1‑140 (MQ=255) cTTCTGCCTGGGTGTAATACCGTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTcgcg < 1:2021808/140‑1 (MQ=255) tggttgtAATATCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTg < 2:9501/136‑1 (MQ=255) gtgtAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc > 2:565016/1‑140 (MQ=255) ttaaatagCTTTTGTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct < 1:2231302/137‑1 (MQ=255) tgtAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct > 1:107710/1‑140 (MQ=255) tgtAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct > 1:1971196/1‑140 (MQ=255) taataaCGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTgg > 1:1512430/1‑140 (MQ=255) ataaCGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGcc > 1:1439544/1‑140 (MQ=255) ataaCGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGcc < 1:37007/140‑1 (MQ=255) ttttttttttCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg < 2:1971196/138‑1 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:390872/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:1341307/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:856409/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:970557/1‑140 (MQ=255) ttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGAt < 1:2291560/140‑1 (MQ=255) | CTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTCAAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTC‑AACAGCGAAGGTCAGCCCCTTTT‑CGCCGTT‑GTCCGCGACAACATAA‑CGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGAT > NC_000913/4111608‑4111884 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |