New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 1221511 | 117 (1.350) | 3 (0.040) | 3/270 | 8.6 | 2.6% | pseudogene (1911/2648 nt) | ycgH | putative transporter component, N‑terminal fragment |
? | NC_000913 | 1221515 = | 111 (1.310) | pseudogene (1915/2648 nt) | ycgH | putative transporter component, N‑terminal fragment | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCACCT > NC_000913/1221373‑1221650 | tGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCggtg < 1:69335/140‑1 (MQ=255) gTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCggtgg > 2:1289902/1‑140 (MQ=255) gTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCggtgg > 1:778687/1‑140 (MQ=255) tAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCggtggt > 1:1259168/1‑140 (MQ=255) aCTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGttt < 1:514968/140‑1 (MQ=255) tGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTa < 1:172524/140‑1 (MQ=255) tGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTa < 1:1391687/140‑1 (MQ=255) aaCAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTAcc < 2:1370439/140‑1 (MQ=255) aaCAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTAcc > 2:1445147/1‑140 (MQ=255) aaCAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTAcc > 2:1179781/1‑140 (MQ=255) aaCAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTAcc > 2:517851/1‑140 (MQ=255) aCAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCg > 1:474232/1‑140 (MQ=255) cAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTa < 2:1458903/136‑1 (MQ=255) cAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTa > 1:1458903/1‑136 (MQ=255) cAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGa < 2:555100/140‑1 (MQ=255) ggAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATa > 1:895166/1‑140 (MQ=255) ggAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATa > 2:278622/1‑140 (MQ=255) cGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGa > 2:1176878/1‑140 (MQ=255) cGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGa > 2:413288/1‑140 (MQ=255) ttCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACa > 2:160747/1‑140 (MQ=255) ttCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACa > 2:1182535/1‑140 (MQ=255) aaGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGtt > 2:387639/1‑140 (MQ=255) aGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTg < 1:398645/140‑1 (MQ=255) gCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTgg > 1:704205/1‑140 (MQ=255) gCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTgg > 1:1305902/1‑140 (MQ=255) aCTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGtt > 2:1389807/1‑140 (MQ=255) aCTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGtt < 2:617078/140‑1 (MQ=255) aCTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGtt < 1:1289902/140‑1 (MQ=255) tttGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTg < 1:991827/140‑1 (MQ=255) ggCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGa < 1:1389807/140‑1 (MQ=255) cTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGt < 2:138614/140‑1 (MQ=255) tACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTg < 1:1391607/140‑1 (MQ=255) cGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGAt > 1:1147647/1‑140 (MQ=255) cGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGAt > 1:329804/1‑140 (MQ=255) gTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATg < 1:1445147/140‑1 (MQ=255) gTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATg > 1:638910/1‑140 (MQ=255) tCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATgg < 1:413288/140‑1 (MQ=255) tCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATgg < 2:329804/140‑1 (MQ=255) tCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATgg < 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> 1:252951/1‑140 (MQ=255) aTAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCcgc < 1:691015/140‑1 (MQ=255) tGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACt > 2:40039/1‑140 (MQ=255) gCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTa < 1:1417249/140‑1 (MQ=255) gCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTa < 1:445271/140‑1 (MQ=255) tGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACaa > 2:666380/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) cGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCaga > 2:90673/1‑140 (MQ=255) cGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCaga > 2:225498/1‑140 (MQ=255) cGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCaga < 2:1312523/140‑1 (MQ=255) cAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAgg < 1:40039/140‑1 (MQ=255) ttAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCta > 1:508351/1‑140 (MQ=255) ttAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCta < 2:165344/140‑1 (MQ=255) ttAGGGGGCGATCTGATAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGGCAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCta < 2:1337873/140‑1 (MQ=255) aGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGTTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCtata < 1:160747/140‑1 (MQ=255) aGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCtata > 2:30754/1‑140 (MQ=255) ggggCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAgc > 1:1316707/1‑140 (MQ=255) gggCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAgcg < 1:666380/140‑1 (MQ=255) gggCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAgcg < 1:90673/140‑1 (MQ=255) gggCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAgcg < 1:278622/140‑1 (MQ=255) cGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAg < 1:788177/140‑1 (MQ=255) cGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAg > 2:745013/1‑140 (MQ=255) cGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAg > 2:152537/1‑140 (MQ=255) cGATCTGTTAACC‑‑‑GGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGc < 2:574669/140‑1 (MQ=255) tAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTAt < 1:1402977/140‑1 (MQ=255) ggtggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCAc > 1:1341846/1‑140 (MQ=255) ggtggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCAc < 2:1316707/140‑1 (MQ=255) gtggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCAcc > 1:1425371/1‑140 (MQ=255) tggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCACCt > 2:438975/1‑140 (MQ=255) tggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCACCt > 2:745687/1‑140 (MQ=255) tggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCACCt > 2:820130/1‑140 (MQ=255) tggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCACCt > 2:1029234/1‑140 (MQ=255) tggtTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCACCt > 2:1349968/1‑140 (MQ=255) | TGTAACTGAACAGGAGCGTTCAAGCCGACTTTGGCTACGTCAAATTGGCGGGCATAATGCCTGGCGTGACAGCAACGGACAGTTGAGAACGACCTCGCATCGCTACGTCTCGCAGTTAGGGGGCGATCTGTTAACCGGTGGTTTTACCGATAGTGACAGTTGGCGTTTGGGAGTGATGGCTGGTTATGCCCGCGACTACAACTTAACTCATTCCAGCGTGTCGGATTATCGTTCGAAAGGGAGTGTCAGAGGCTATAGCGCAGGGCTGTATGCCACCT > NC_000913/1221373‑1221650 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |