New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3402429 = | 98 (1.130) | 3 (0.040) | 3/252 | 8.3 | 3.2% | coding (904/1941 nt) | csrD | regulator of CsrB and CsrC decay |
? | NC_000913 | 3402750 = | 90 (1.130) | coding (583/1941 nt) | csrD | regulator of CsrB and CsrC decay | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGATCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGATCCCG > NC_000913/3402291‑3402568 | ggATCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGcc > 1:1031931/1‑140 (MQ=255) ggATCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGcc > 1:1125571/1‑140 (MQ=255) ggATCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGcc < 2:1125571/140‑1 (MQ=255) gATCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCca > 2:861254/1‑140 (MQ=255) aTCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCcag > 2:222005/1‑140 (MQ=255) aTCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCcag > 1:1169201/1‑140 (MQ=255) aTCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGAAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGcc < 2:597509/138‑1 (MQ=255) aTCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGAAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGcc > 1:597509/1‑138 (MQ=255) cATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACATCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCcagca > 1:1295769/1‑140 (MQ=255) atCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTg > 2:630947/1‑140 (MQ=255) atCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTg < 1:508711/140‑1 (MQ=255) atCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTg > 1:1062094/1‑140 (MQ=255) atCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTg > 1:1162003/1‑140 (MQ=255) gATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAggg < 1:806820/140‑1 (MQ=255) aTCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCcagcag < 2:1066158/129‑1 (MQ=255) aTCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCcagcag > 2:919666/1‑129 (MQ=255) aTCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCcagcag > 1:1066158/1‑129 (MQ=255) aTCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCcagcag < 1:919666/129‑1 (MQ=255) aTCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGt > 2:614692/1‑140 (MQ=255) aGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAgcg < 1:1355926/140‑1 (MQ=255) aGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAgcg < 2:1062094/140‑1 (MQ=255) ttCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGt < 1:1172101/140‑1 (MQ=255) ttCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGt < 1:761495/140‑1 (MQ=255) cGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCg > 2:565293/1‑140 (MQ=255) ggCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGa > 2:1196534/1‑140 (MQ=255) cAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGAca < 2:1169201/140‑1 (MQ=255) tATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGa < 2:737507/140‑1 (MQ=255) tATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGa > 1:775085/1‑140 (MQ=255) aCGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGt > 1:804004/1‑140 (MQ=255) aCGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGt > 2:784912/1‑140 (MQ=255) ggCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCa < 1:1368737/140‑1 (MQ=255) cTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCaga > 1:652869/1‑140 (MQ=255) cTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCaga > 2:792761/1‑140 (MQ=255) tttGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCagag > 1:182881/1‑140 (MQ=255) tttGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCagag > 1:849575/1‑140 (MQ=255) tGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTg > 1:1348346/1‑140 (MQ=255) tGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTg < 1:629585/140‑1 (MQ=255) aTTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTgaa < 2:545183/140‑1 (MQ=255) ttAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTgaag < 1:1200259/140‑1 (MQ=255) cTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACt < 1:1200958/140‑1 (MQ=255) aCCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTgaa < 1:611471/132‑1 (MQ=255) aCCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTgaa > 2:611471/1‑132 (MQ=255) aCCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGtt > 2:659421/1‑140 (MQ=255) aCCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGtt > 1:1246596/1‑140 (MQ=255) ccGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGttc < 2:484269/140‑1 (MQ=255) cGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGttct > 1:934642/1‑140 (MQ=255) cGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGttct > 2:735394/1‑140 (MQ=255) aTGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAAc < 2:466955/140‑1 (MQ=255) tctctGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTgg < 1:508774/140‑1 (MQ=255) ctctGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGc < 2:278152/140‑1 (MQ=255) tctGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCt < 2:1031931/140‑1 (MQ=255) ctGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtg < 1:565293/140‑1 (MQ=255) ctGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtg < 1:1320305/140‑1 (MQ=255) tGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtgt > 2:304748/1‑140 (MQ=255) tGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtgt > 2:1411257/1‑140 (MQ=255) gCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtgtg < 1:861254/140‑1 (MQ=255) gCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtgtg < 1:800226/140‑1 (MQ=255) gCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtgtg < 2:618093/140‑1 (MQ=255) ctctTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGcc < 1:792761/140‑1 (MQ=255) tctTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGccc > 2:1236538/1‑140 (MQ=255) ctTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGcccc < 2:652869/140‑1 (MQ=255) ctTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTAAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtgtg < 1:897096/136‑1 (MQ=255) ctTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTAAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCtgtg > 2:897096/1‑136 (MQ=255) tttAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCa > 1:526144/1‑140 (MQ=255) tAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAgg < 2:526144/140‑1 (MQ=255) tAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAgg < 2:934642/140‑1 (MQ=255) tAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAgg < 1:1236538/140‑1 (MQ=255) tCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCg < 1:1196534/140‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGCGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGc > 1:404512/1‑140 (MQ=255) cGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt < 2:1295769/140‑1 (MQ=255) cGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt < 1:544198/140‑1 (MQ=255) cGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt < 1:659421/140‑1 (MQ=255) cGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt > 2:464567/1‑140 (MQ=255) cGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt < 1:11499/140‑1 (MQ=255) gTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt > 1:884740/1‑138 (MQ=255) gTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt < 2:884740/138‑1 (MQ=255) gTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCa > 1:9902/1‑140 (MQ=255) cGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACa < 2:1141508/140‑1 (MQ=255) cGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACa < 2:219753/140‑1 (MQ=255) gTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACata > 1:329093/1‑140 (MQ=255) gcgcAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt > 2:44419/1‑127 (MQ=255) gcgcAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCt < 1:44419/127‑1 (MQ=255) gcgcAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGaaa > 2:872091/1‑140 (MQ=255) gcgcAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGaaa > 1:863870/1‑140 (MQ=255) cagcaAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATcc > 1:32052/1‑140 (MQ=255) cagcaAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATcc > 1:1159195/1‑140 (MQ=255) aaaaTCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCa < 2:1162003/140‑1 (MQ=255) tCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACg < 1:614692/140‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAat < 1:222224/140‑1 (MQ=255) gCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAatca > 2:1005464/1‑140 (MQ=255) cGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAatcat > 1:502103/1‑140 (MQ=255) cGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAatcat > 1:725699/1‑140 (MQ=255) ggtggtAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAatcatc < 2:1408442/140‑1 (MQ=255) tggtAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAatcatcat < 2:1348346/140‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTACCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGa > 1:1091916/1‑140 (MQ=255) cgcgCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGAt < 2:804004/140‑1 (MQ=255) cgcgCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGAt < 1:734227/140‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGATc > 1:1290949/1‑140 (MQ=255) ccAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGATCCCg < 2:32052/140‑1 (MQ=255) ccAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGATCCCg < 1:1005464/140‑1 (MQ=255) | GGATCATATCGTCGCGATCGAGCATTTTATTGTTCGGCAAGGTATCAACGGCTTTGATTAACTGACCGGCGATGCTCTCTGCCTCTTTTAACGTCCGGTGCGGTAACAGCGCAGCAAAATCACTGCGGTGGTAACGCGCCAGCAGTGCGCCAGGGTAGCGCATCATAAATGTCGACAGCAGATTCGTCAGAGTGAAGAACTGTTCTTCAACCTGGCTGTGCCCCCAGGTATCGCTCAACATATTGAAATCCGGCAGACGAATCATCATCACGATCCCG > NC_000913/3402291‑3402568 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |