| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 29,496 | 0 | T | A | 33.3% | 119.4 / 32.8 | 63 | intergenic (+301/‑155) | dapB/carA | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/3); new base A (0/21); total (39/24) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.33e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAAT > NC_000913/29362‑29633 | aCCTTTTGGTCCTCTTTTTTCTGCTCGTTTTTTTTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATATaaaaa < 2:209413/140‑1 (MQ=255) ttGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATc‑cc > 1:1418923/1‑140 (MQ=255) cttttttttCTGCTTTTTTTTTTTTCATGCATTCTTCTT‑GCTGCGCAAGCTTTTCCCAAAACAGTTTAGATTATTTTTTTGTCGCTTAATCCCTAAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAACC‑CCGCCAtt < 2:1248781/137‑1 (MQ=255) ttttttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAg > 1:1212588/1‑140 (MQ=255) ttttttCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAg > 2:703818/1‑140 (MQ=255) cTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACtttt > 1:1171525/1‑140 (MQ=255) tctttttttttTCATGCATTTTTCTT‑GCTGCGCAGGCTTTTCCAAGAACAGTTTAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAAGGCCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTa < 2:269453/137‑1 (MQ=255) ttttttttTCAT‑CAATTTTTTTGGCGGCGAAAGCTTTTCCAAAAACAGGTAAGATATTTTTTTTGTCGTTTAATGCCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcg < 2:220951/140‑1 (MQ=255) tttttATTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCCCCATTAAGTTGACTTTTAgcg < 2:186926/140‑1 (MQ=255) ttttCTTCCAATCTTCTT‑GCTGCAAAAGCTTTTTCAAAAACGGTTAAAATATTTTTTTTGTCGTTTAGTCCCTTAAAAACTTGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat < 2:1212588/139‑1 (MQ=255) ttttCATGCAATTTTCTT‑GCTGCGCAGGTTTTTTCAAGAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGTTTAATGCCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCat < 2:963582/139‑1 (MQ=255) tGCAATCTTCTT‑GCTGTGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 2:586230/1‑140 (MQ=255) tGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 2:1081796/1‑140 (MQ=255) tGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 1:664076/1‑140 (MQ=255) tGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 1:485858/1‑140 (MQ=255) tGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 1:1124372/1‑140 (MQ=255) tGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCACTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 2:72342/1‑140 (MQ=255) ttttt‑gttgCGAAAGCTTTTCCCAAAACAGTTTAGATTATTTTTTTGTCGTTTAACCCCTAAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgc < 2:57480/137‑1 (MQ=255) tt‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATgccgc > 1:998319/1‑140 (MQ=255) gctgcGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGccgccg > 2:671005/1‑140 (MQ=255) ggcgaAAGCTTTTCCAAGAAAAGGTTAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAATGCCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGtt < 2:1104656/139‑1 (MQ=255) gcgcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGttt > 2:848130/1‑140 (MQ=255) gcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGc > 2:1431381/1‑140 (MQ=255) gcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGc > 1:979267/1‑140 (MQ=255) cAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 1:1434495/1‑140 (MQ=255) cAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGcc > 1:541038/1‑140 (MQ=255) gCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGa > 1:1069080/1‑140 (MQ=255) aaaagtcccAGAAAAGGTTAGATTATTTTTTTGTCGCTTATTGCCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGa < 2:641103/133‑1 (MQ=255) ccaaaaaCAGGTTAGATGTTCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcg < 1:443610/135‑1 (MQ=255) gtttAGATGTTTTTTTTGTCGTTTAATCCCT‑AAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCATCGGTAAGCa < 2:1219777/138‑1 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGtctgtc > 1:641103/1‑135 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 2:1286416/1‑140 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 1:555634/1‑140 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 1:601121/1‑140 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 1:1461044/1‑140 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 1:890352/1‑140 (MQ=255) atgatTTTTTTGTCGCTTAATGCCTGAAAAACATGCAGGACCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAttt < 1:100954/140‑1 (MQ=255) ttttttttttCCGTTTAATGCTTAAAAAACATGCATGACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACC‑CCGCCACTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc < 1:72342/136‑1 (MQ=255) ttttttttGTCTCTTAATGCCTGAAAAACTTGCATGACCAAAAAAAAAATAAAAAAACTC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCa < 1:703818/137‑1 (MQ=255) ttttttttGTCGTTTAATCCCTAAAAAACATGCATGACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCa < 2:601121/137‑1 (MQ=255) ttttttttGTCGTTAAATGCCTAAAAAACATGCATGAGCAAAAAAATAATAAAAAAAAGC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAATCAGATTTGCa < 2:541038/137‑1 (MQ=255) cTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt > 1:989034/1‑140 (MQ=255) cTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt > 1:216668/1‑140 (MQ=255) cTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt > 2:1242065/1‑140 (MQ=255) ttttGTCGCTTAATGCTTAAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGa < 2:890352/140‑1 (MQ=255) tttgGTCGTTTAATGCGTAAAAAACATGCAGGACCCAAAAAAAAATAAAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGa < 1:108752/140‑1 (MQ=255) aaTGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatc > 1:1155717/1‑140 (MQ=255) aaTGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatc > 1:1146466/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 2:932431/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 1:1019484/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 2:1272370/1‑140 (MQ=255) aaCATGCAGGA‑CCAAAAAAAAATAAAAAAAAACTCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTa < 2:410241/140‑1 (MQ=255) atgcatgACCCCAAAAAAAATATAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 2:1111919/140‑1 (MQ=255) atgcatgACCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 1:907656/140‑1 (MQ=255) atgcatgACCCAAAAAAAAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 2:979267/140‑1 (MQ=255) tgcatgAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAatat > 1:1122919/1‑140 (MQ=255) tgcatgAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAatat > 1:78900/1‑140 (MQ=255) gcatgACCCAAAAAATAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg < 1:464807/140‑1 (MQ=255) atgAGCCAAAAAATAATATAAAAACTC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCa < 2:685597/140‑1 (MQ=255) aGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAAt > 1:139836/1‑140 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2:205034/136‑1 (MQ=255) aaaaaaaaATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag < 2:425217/138‑1 (MQ=255) aaaaTAATAAAAAAATCC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg < 2:216668/140‑1 (MQ=255) aaaaTAATAAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg < 2:858180/140‑1 (MQ=255) aataatATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 1:290186/140‑1 (MQ=255) aataatAAAAAAACTC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 1:581219/140‑1 (MQ=255) aaaataAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgggt < 1:1289445/138‑1 (MQ=255) aataTAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAgtgagtga < 2:1461044/140‑1 (MQ=255) aataAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAgtgagtga < 1:325676/140‑1 (MQ=255) aataAAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAgtgagtga < 1:1116902/140‑1 (MQ=255) aataAAAAAAACC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAgtgagtga < 2:483291/140‑1 (MQ=255) tataAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat > 1:1372258/1‑140 (MQ=255) tataAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat > 1:6744/1‑140 (MQ=255) tataAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat > 2:1238065/1‑140 (MQ=255) | ACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTT‑GCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAATC‑CCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAAT > NC_000913/29362‑29633 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |