Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 753,125 | 0 | T | A | 23.1% | 194.0 / 28.6 | 78 | intergenic (‑330/+60) | ybgD/gltA | putative fimbrial protein YbgD/citrate synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/5); new base A (0/18); total (55/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.58e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCGT > NC_000913/752989‑753264 | ttATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATaaa > 1:1370110/1‑140 (MQ=255) tataAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATaaaa > 1:34710/1‑140 (MQ=255) tataAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATaaaa > 1:1374679/1‑140 (MQ=255) ataAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATaaaaa > 2:1152146/1‑140 (MQ=255) taAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAAt > 1:95758/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:1019576/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:978089/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:325936/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:1296719/1‑140 (MQ=255) gCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAcc > 2:1280007/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 1:1216511/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 1:92986/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 1:1268608/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 2:964770/1‑140 (MQ=255) cGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAAccc > 2:481696/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 2:859098/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 2:745847/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 2:1187969/1‑140 (MQ=255) gACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCg > 2:127723/1‑140 (MQ=255) tGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGa > 1:264894/1‑140 (MQ=255) tcaattaaaGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGt > 1:1125705/7‑140 (MQ=255) tAATTAAAAGTTTTGGGTTGCTAATATTTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTATATAGGTTTTTTAATGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGt < 2:1370110/140‑1 (MQ=255) tttttGGTTTGCTGATAATTTGAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATATTTATATAGGTTTTTTAATGGTTTTTATTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAACCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATAtt < 2:703590/137‑1 (MQ=255) tttGGGTTGCTGATAATTTGAGTTGTTTTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGTTTTTATTTTTACATTTTTTTGTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTa < 1:233145/139‑1 (MQ=255) tGGTTTGCTGATATTTTGATCTTTTTTTTTTTTTTAAAATTTCTATATAGGTCTTTTAATGTTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAAACACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACa < 2:1374679/140‑1 (MQ=255) ggTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑Ac > 1:289179/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGc > 1:788680/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGc > 2:126691/1‑140 (MQ=255) cTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGc > 2:1199161/1‑140 (MQ=255) aTAATTTGAGTTTTTCTTTTTTTTTAAAATATCTATTTAGGTTTTTTAATGTTTTTTATTTTTAAATTTTTTTTTTTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAAt < 2:1324981/140‑1 (MQ=255) gattttttCTATTCTTTTAAAATATCTATATGGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTAAATTTTTTTGTGTTTAGGAATATAAAAAACACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCAt < 1:374676/134‑1 (MQ=255) aGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTTTTTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCAtt < 1:496342/140‑1 (MQ=255) gCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTa < 2:179981/140‑1 (MQ=255) cTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTaa > 1:129450/1‑140 (MQ=255) ttCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGc > 1:42130/1‑140 (MQ=255) tttttaAAATATTTTTAAAGGTTTTTAAATGGATTTTTTTTTTATATTTTTTTTTGTTTAGGAATAAAAAATTCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGatat < 2:1396706/139‑1 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc > 1:1287821/1‑140 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGc > 2:1040627/1‑140 (MQ=255) tttAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAAACAACCATTAACGCATGATATTGc > 1:15209/1‑140 (MQ=255) tCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTTCA‑‑‑ACTTAGCAAACAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAg > 1:279966/1‑140 (MQ=255) tatataGGTTTTTAAATGGTTTTTATTTTTAAATTTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTc < 2:34710/140‑1 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACAACTACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGt > 1:527678/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 2:1231330/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 1:1185390/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 1:239940/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttt > 1:753400/1‑140 (MQ=255) gTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCCCTTTTAAAGTCGCGtttt > 1:1222982/1‑140 (MQ=255) tttttAATGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTc < 1:127723/137‑1 (MQ=255) cTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGtttttt > 1:773893/1‑139 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:1403587/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:404775/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:594991/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 1:1415529/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCa > 2:1264967/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGGCGCGtttttta > 1:637013/1‑138 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACCCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGGTTTTCa > 1:1094527/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAAAGCTTGATATCGCTTTTAAAATCGCGTTTTTCa > 2:826095/1‑140 (MQ=255) tttAATGTTTTTTTTTTTTAAATTTTTTTTTGTTTAGGAAAAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:958887/139‑1 (MQ=255) tttAATGTATTTTTTTTTTAAATTTTTTTGTGTTTAGGAAAAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:1125705/139‑1 (MQ=255) tttAATGTATTTTATTTTTACAATTTTTTGTTTTAAGCCATATAAAAAACAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:81721/139‑1 (MQ=255) tttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTTTTTAGGAATAAAAAAACCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 1:745847/139‑1 (MQ=255) tttAAGGGTTTTTATTTTTCCAATTTTTTGTTTTTAGGCATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:203457/139‑1 (MQ=255) ttaaaTGGTTTTTTTTTTTACATTTTTTTGTGTTTAGGAATAAAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCat < 2:289179/137‑1 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 1:355450/1‑140 (MQ=255) ttAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCata > 2:1118097/1‑140 (MQ=255) 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1:126691/140‑1 (MQ=255) tgtgTTTAGGCATAAAAAAAACAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 2:95758/140‑1 (MQ=255) tgtgTTTAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGc < 2:92986/140‑1 (MQ=255) gtttttAGGAATAAAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCa < 1:681643/137‑1 (MQ=255) ggaataaAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCa < 1:1448692/137‑1 (MQ=255) ataaAAAAATCACCCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATAc < 1:1152146/140‑1 (MQ=255) taAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGGTAAAATATTTTCA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAAAGCTTGATATCGCTTTTTAAGTCGCGGTTTTCATATCCCGTATACAGCTGAAGCGGACCGGCAATCTTCATAccct > 2:1086708/1‑138 (MQ=255) | TTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTTAAATATCTATATAGGTCTGTTAATGGATTTTATTTTTACAATTTTTTGTGTTTAGGCATATAAAAATCAACCCGCCATATGAACGGCGGGTTAAAATATTTACA‑‑‑ACTTAGCAATCAACCATTAACGCTTGATATCGCTTTTAAAGTCGCGTTTTTCATATCCTGTATACAGCTGACGCGGACGGGCAATCTTCATACCGT > NC_000913/752989‑753264 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |