| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 175,694 | 0 | T | G | 21.1% | 151.8 / 10.4 | 71 | G196G (GGT→GGG) | clcA | chloride:H(+) antiporter ClcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/44); new base G (15/0); total (27/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTA > NC_000913/175555‑175833 | cAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGt < 2:796319/140‑1 (MQ=255) ccGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTAtt < 2:439475/140‑1 (MQ=255) ccGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTAtt < 1:282833/140‑1 (MQ=255) ccGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTAtt < 1:1085467/140‑1 (MQ=255) gCAGATAGGCGGTAACATT‑GCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGtt > 1:795702/1‑140 (MQ=255) cAGATCGGCGGTAACATTTGGCGTATGGTGCTTGATATTTTTCGCCTGAAAGGGGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGGCTTTAAAGCGCCGCTGGGGGGGGTtttttt > 2:1405390/1‑140 (MQ=255) cAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGtt < 1:110695/140‑1 (MQ=255) cAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGGGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCCGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGGTtttttt > 2:873810/1‑140 (MQ=255) cggcggTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGGCGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATttttttttttt > 1:749461/1‑139 (MQ=255) cATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAgaga < 2:1431032/140‑1 (MQ=255) aTTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGAt < 1:654795/140‑1 (MQ=255) aTTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGAt < 2:48681/140‑1 (MQ=255) tGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGc > 1:1382107/1‑140 (MQ=255) ggCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGGTTTTTTTTTTTATCGAAGAGAAGCg > 2:415756/1‑140 (MQ=255) ggCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTTTTTTTTTTTGAAGAGATGCg > 2:954310/1‑140 (MQ=255) ggCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTTTTTTTTTTTGAAAAGATGCg > 2:309334/1‑140 (MQ=255) cGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTcc > 1:1148665/1‑140 (MQ=255) gTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCg < 1:469705/140‑1 (MQ=255) gTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCg < 1:837369/140‑1 (MQ=255) gTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCg < 1:1088645/140‑1 (MQ=255) tGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGttt < 2:1292563/140‑1 (MQ=255) tGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGttt < 1:869954/140‑1 (MQ=255) tGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCACCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGttt < 2:787335/140‑1 (MQ=255) gCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCg > 1:34489/1‑133 (MQ=255) gCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCg < 2:34489/133‑1 (MQ=255) gCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTc > 2:1425335/1‑140 (MQ=255) gCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATTGAAGAGATGCGTCCGCAGtttt > 2:159052/1‑139 (MQ=255) gCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTc > 1:570301/1‑140 (MQ=255) cTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCg > 1:1039996/1‑140 (MQ=255) gATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACTAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCta < 1:1160321/140‑1 (MQ=255) gATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCta < 1:419257/140‑1 (MQ=255) gATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGCAGTTTGTTTATTATCGGAGAGATGCGTCCGCCGGTTCGCta > 2:504482/1‑140 (MQ=255) tttCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAg < 1:1269940/127‑1 (MQ=255) tttCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAg > 2:1269940/1‑127 (MQ=255) tttCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGt > 1:1194094/1‑140 (MQ=255) cTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTc < 2:1139700/140‑1 (MQ=255) tGACGAAGCTCGCCATGCGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAg < 1:1319502/140‑1 (MQ=255) tGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAg < 2:15275/140‑1 (MQ=255) tGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAg < 2:700799/140‑1 (MQ=255) gACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGc < 2:1194094/140‑1 (MQ=255) aCGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCg < 1:1425335/140‑1 (MQ=255) cGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtatttat < 1:105037/140‑1 (MQ=255) cGCCATACGCTGCTGACAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtatttat < 1:220350/140‑1 (MQ=255) agCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGtatttat < 1:399884/139‑1 (MQ=255) ccATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTg < 1:415756/140‑1 (MQ=255) ccATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTg < 2:507916/140‑1 (MQ=255) cATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTgg < 2:126316/140‑1 (MQ=255) gctgctGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTTTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTTGATTTAAGCGGGATTTTTTTGTGTCa > 2:1191712/1‑140 (MQ=255) tgctgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCAtt < 1:1404562/140‑1 (MQ=255) ctgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTTGATTAAAGCGGGATTTTTTTGGGTCATTAt > 2:1404562/1‑140 (MQ=255) tgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATTGAAGAGATGCGTCCGCCGTTTCGCTATACGTTAATTTTGATTAAAGCGGTATTTTTTTGTGTCATTact > 2:399884/1‑138 (MQ=255) tgGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATg > 1:927279/1‑140 (MQ=255) gggaaCCTGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCCGCCTTTAACGCGTCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGt < 1:1077698/137‑1 (MQ=255) gCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGGGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTc < 2:970365/140‑1 (MQ=255) gCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTc < 1:954310/140‑1 (MQ=255) gCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTc > 2:249149/1‑140 (MQ=255) gCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTc < 2:1148665/140‑1 (MQ=255) aaCCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGa < 1:873810/140‑1 (MQ=255) aaCCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGa < 1:249149/140‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGGATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCAtt > 2:880362/1‑140 (MQ=255) tgcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTAcc < 2:19113/140‑1 (MQ=255) gcGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTTTCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGGATTTATTGGTGGCATTATTTCGACCATTTTTTACCg > 2:644566/1‑140 (MQ=255) cGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCgg > 2:1016362/1‑140 (MQ=255) gggCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGAt > 2:926703/1‑140 (MQ=255) ggctgCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTa > 2:1250014/1‑140 (MQ=255) gCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCa < 1:644566/140‑1 (MQ=255) ggCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATg < 1:1016362/140‑1 (MQ=255) ggCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATg < 1:66000/140‑1 (MQ=255) gccgcTGGCGGGGATTTTGTTTATTATTGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGttga > 1:1001436/1‑140 (MQ=255) gccgcTGGCGGGGATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGttga > 2:1427299/1‑140 (MQ=255) ccgcTGGCGGGTATTTTGTTTTTTATTGAATAGATGCGTCCGCAGGTTCGCTATACGGTAATTTCGTTTAAAGCGGTCTTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGttgat > 1:984066/1‑140 (MQ=255) ccgcTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGttgat < 1:880362/140‑1 (MQ=255) cgcTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGttgatt < 2:749461/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGATTTTGGTTATTATCTAACGGAGGCGTGCGCCGCTTTGCGATACTTTAATTTTGATTTAAGCCGGATTTATTGGTGTCACTATGTCGACCATTATTTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGttggttga > 2:636674/1‑140 (MQ=255) tGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGAc < 2:1039996/140‑1 (MQ=255) gTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGt < 2:651949/140‑1 (MQ=255) tATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTa < 2:1382107/140‑1 (MQ=255) | CAACCGTGCAGATCGGCGGTAACATTGGCCGTATGGTGCTTGATATTTTCCGCCTGAAAGGTGACGAAGCTCGCCATACGCTGCTGGCAACCGGTGCTGCTGCGGGGCTGGCTGCGGCCTTTAACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATACGTTAATTTCGATTAAAGCGGTATTTATTGGTGTCATTATGTCGACCATTATGTACCGGATTTTTAATCATGAAGTTGCGTTGATTGACGTCGGTA > NC_000913/175555‑175833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |