| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,641,401 | IS1 (+) +9 bp | coding (460‑468/687 nt) | yjtD → | putative rRNA methyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 88 (1.290) | 54/278 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4641409 | 0 (0.000) | coding (468/687 nt) | yjtD | putative rRNA methyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 62 (0.910) | 37/278 | 0.6 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4641401 = | 0 (0.000) | coding (460/687 nt) | yjtD | putative rRNA methyltransferase | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GGTGTTTGGTCGCGAAGATTCCGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACATAAAACTGGTCGACTGGTTACAACAAC > NC_000913/4641271‑4641548 | gaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacgctatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCaa < 2:201138‑M2/10‑1 (MQ=255) tctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACAt < 2:44454‑M2/13‑1 (MQ=255) tGGTCGCGAAGATTCCGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatg < 2:729176‑M2/140‑8 (MQ=255) aggcagcacctggcatggctgggacggaagacgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAAt > 2:389621‑M2/124‑140 (MQ=255) gcgAAGATTCCGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgcc < 1:851856‑M2/140‑13 (MQ=255) gAAGATTCCGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaa > 2:851856‑M2/1‑126 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAAc > 2:838876‑M2/118‑128 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATacaaca > 1:319377‑M2/118‑140 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATacaaca > 2:268750‑M2/118‑140 (MQ=255) cacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATacaaca > 1:1137227‑M2/118‑140 (MQ=255) tCCGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttact < 1:1144230‑M2/140‑21 (MQ=255) tCCGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttact < 2:1031356‑M2/140‑21 (MQ=255) cGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactga < 1:508534‑M2/140‑23 (MQ=255) ggTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatt > 2:583434‑M2/1‑116 (MQ=255) ggTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatt > 1:250896‑M2/1‑116 (MQ=255) ggTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatt > 1:451267‑M2/1‑116 (MQ=255) ggTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatt > 1:1093509‑M2/1‑116 (MQ=255) ctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAg > 1:1019415‑M2/106‑140 (MQ=255) ctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCAGCGAAAAg > 1:1002705‑M2/106‑140 (MQ=255) tgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGt < 2:1137227‑M2/36‑1 (MQ=255) aaCGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat < 1:19201‑M2/140‑33 (MQ=255) gaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCaa < 2:1019415‑M2/43‑1 (MQ=255) cGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:902632‑M2/140‑35 (MQ=255) cGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctaccaacttactgatttagtgtatga > 1:878773‑M2/1‑106 (MQ=255) aaGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 1:902632‑M2/1‑104 (MQ=255) gtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACgg < 1:103707‑M2/46‑1 (MQ=255) gtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACgg < 1:655039‑M2/46‑1 (MQ=255) agagTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg > 2:696895‑M2/1‑103 (MQ=255) tcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGc < 1:268750‑M2/47‑1 (MQ=255) agTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtg < 2:1012242‑M2/140‑40 (MQ=255) ctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGa < 2:319377‑M2/50‑1 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAcc < 1:389621‑M2/52‑1 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAcc < 1:172451‑M2/52‑1 (MQ=255) cgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCaa > 1:832000‑M2/87‑140 (MQ=255) cgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCaa > 1:129440‑M2/87‑140 (MQ=255) cGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggggatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg < 1:770228‑M2/140‑46 (MQ=255) gTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:1144230‑M2/1‑94 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACa > 2:534085‑M2/85‑140 (MQ=255) ggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAg < 1:517905‑M2/67‑1 (MQ=255) aCTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt > 2:353058‑M2/1‑78 (MQ=255) gctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTAc < 2:832000‑M2/73‑1 (MQ=255) ggTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg > 1:1012242‑M2/1‑75 (MQ=255) ggTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggggtttttgaggtgctccagtggcttctg < 1:1109211‑M2/140‑66 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGa > 1:1084656‑M2/64‑140 (MQ=255) tgCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccagcttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc < 2:344595‑M2/140‑70 (MQ=255) tgCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc < 2:621880‑M2/140‑70 (MQ=255) atgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGaa < 2:595885‑M2/78‑1 (MQ=255) gCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct < 2:746750‑M2/140‑71 (MQ=255) 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2:19201‑M2/1‑56 (MQ=255) aTTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc > 1:974306‑M2/1‑56 (MQ=255) ttATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 1:746750‑M2/1‑55 (MQ=255) ttATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 1:448432‑M2/1‑55 (MQ=255) tCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt < 2:870690‑M2/140‑89 (MQ=255) cGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagc > 2:410082‑M2/1‑47 (MQ=255) 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2:108290‑M2/106‑1 (MQ=255) aaTCTGGGGCAGGCGGTGACGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 1:1069903‑M2/140‑99 (MQ=255) tCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac > 1:421729‑M2/1‑40 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCtggcag > 1:475394‑M2/32‑140 (MQ=255) cTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg > 1:729176‑M2/1‑39 (MQ=255) ggggCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg > 2:146304‑M2/1‑37 (MQ=255) 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(MQ=255) ataagttggagtcattaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACa < 1:207371‑M2/121‑1 (MQ=255) gTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgta > 1:382975‑M2/1‑27 (MQ=255) aTGGTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacg < 2:92537‑M2/140‑117 (MQ=255) ggTCTATTGCTATCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggc > 2:1069903‑M2/1‑22 (MQ=255) attaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGTAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACATAAAACTGGTCGa < 1:429704‑M2/134‑1 (MQ=255) attaccCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACATAAAACTGGTCGa 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tCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctattagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgcc < 2:104594‑M2/140‑131 (MQ=255) tCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgcc < 1:734962‑M2/140‑131 (MQ=255) tCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcac > 2:134059‑M2/1‑10 (MQ=255) tCAATTAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcac < 1:134059‑M2/136‑127 (MQ=255) cAATTAGCAggtgatgctgctaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccg > 2:755028‑M2/1‑9 (MQ=255) aTTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACATAAAACTGGTCGACTGGTTac > 2:749782/1‑140 (MQ=255) ttAGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggac < 2:956855‑M2/140‑135 (MQ=255) tAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACATAAAACTGGTCGACTGGTTacaa > 1:628228/1‑140 (MQ=255) aGCAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacat > 1:621880‑M2/1‑4 (MQ=255) aGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAGCTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACATAAAACTGGTCGACTGGTTacaac < 2:718349/140‑1 (MQ=255) cAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatca < 2:692696‑M2/140‑139 (MQ=255) cAggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatca < 2:417741‑M2/140‑139 (MQ=255) aggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcag < 2:228641‑M2/140‑140 (MQ=255) | GGTGTTTGGTCGCGAAGATTCCGGGTTGACTAACGAAGAGTTAGCGTTGGCTGACGTTCTTACTGGTGTGCCGATGGTGGCGGATTATCCTTCGCTCAATCTGGGGCAGGCGGTGATGGTCTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGACCAACATCAACTGCAAGCTTTACGCGAACGAGCCATGACATTGCTGACGACTCTGGCAGTGGCAGATGACATAAAACTGGTCGACTGGTTACAACAAC > NC_000913/4641271‑4641548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |