| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,429,984 | 0 | T | G | 21.7% | 162.2 / 14.4 | 70 | L41V (TTG→GTG) | cycA | serine/alanine/glycine/cycloserine:H(+)symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/41); new base G (15/0); total (28/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCTT > NC_000913/4429845‑4430122 | ggTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGTGGT‑GCCATTGGTACGGGgt < 1:1523372/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgt < 2:903510/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgt < 1:276690/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgt < 2:6416/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgt < 1:1632329/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgt < 2:1579374/140‑1 (MQ=255)ggTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgt < 1:1403953/140‑1 (MQ=255) gTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgtt < 2:762051/140‑1 (MQ=255) gTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgtt < 1:698600/140‑1 (MQ=255) gTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGgtt > 1:898356/1‑140 (MQ=255) cAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGggtgtt > 1:946392/1‑140 (MQ=255) gaagaaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTAt > 1:446578/1‑140 (MQ=255) gaagaaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTAt < 2:1636260/140‑1 (MQ=255) gaagaaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTAt > 1:1159565/1‑140 (MQ=255) aagaaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATg < 2:1050823/140‑1 (MQ=255) agaaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGTACGGGGGTGTTTAttg > 2:461090/1‑138 (MQ=255) agaaAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGGTGTTTATgg > 1:1270645/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGTACGGGGCTGTTTATgtgg > 2:627959/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGTACGGGG‑GGTTTATggggg > 2:748689/1‑139 (MQ=255) aaaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATgggg > 1:1429649/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGTGGCCTTTGGTAGGGGGTTTTTTTTgggg > 2:341032/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGt < 2:321709/140‑1 (MQ=255) aaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGt < 2:1390414/140‑1 (MQ=255) aaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGt > 1:465533/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGGACGGGGGTGGTTTTggggg > 2:316101/1‑139 (MQ=255) aCATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGc > 1:1132085/1‑140 (MQ=255) aTGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCaa < 1:627959/140‑1 (MQ=255) aTGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCaa < 1:1302035/140‑1 (MQ=255) aTGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCaa < 1:1369334/140‑1 (MQ=255) ggTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCaaaa > 1:1285560/1‑140 (MQ=255) gATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGAt < 2:446578/140‑1 (MQ=255) cAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAg < 2:465533/140‑1 (MQ=255) gTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCt > 1:892632/1‑140 (MQ=255) aaaGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGc < 2:1132085/140‑1 (MQ=255) tCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCggg < 1:723516/140‑1 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GGCATTGGTGCGGGGGTGTTTTTTGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTTCCGGGGCg > 2:423644/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GGCATTGGTACGGGGGTGTTTTTGGGGGCTTGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGGCg > 2:250057/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GGCATTGGGACGGGGGTGTTTTTGGGGGCTGGGAAAACGATTAGCCCTTCCGGGGCg > 2:372622/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCg > 1:1572624/1‑140 (MQ=255) ttGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCg > 1:1133128/1‑140 (MQ=255) tGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGTACGGGGGTGTTTATTGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCgg > 2:646798/1‑139 (MQ=255) gatgatCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGGTGTTTTTGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTTCCGGGCCGGCGAt > 2:524823/1‑140 (MQ=255) tCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAttt < 2:946392/140‑1 (MQ=255) tCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCAttt < 2:1285560/140‑1 (MQ=255) aGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGG‑TGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCg < 1:748689/140‑1 (MQ=255) gCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGt < 2:99149/140‑1 (MQ=255) gCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGt < 2:898356/140‑1 (MQ=255) cTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCTGTCGATCATTTTCGtt < 1:1333767/140‑1 (MQ=255) cTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGtt < 1:925433/140‑1 (MQ=255) tCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGttt < 1:1242779/140‑1 (MQ=255) ggCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTTTGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtatt > 1:173096/1‑139 (MQ=255) ggCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTtata < 2:129548/140‑1 (MQ=255) gCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGGACGGGGGTGTTTTTGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGGCCTCGCTCATTTTTGGTTatat > 2:597360/1‑140 (MQ=255) cTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATg < 1:646798/140‑1 (MQ=255) cTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATg < 2:1159565/140‑1 (MQ=255) aaCAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATc > 1:1430368/1‑140 (MQ=255) cAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTACTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCAt < 1:448506/140‑1 (MQ=255) cGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTAt < 1:423644/140‑1 (MQ=255) cGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTAt < 1:250057/140‑1 (MQ=255) cGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTAt < 1:316101/140‑1 (MQ=255) gcAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGGCTGGCCAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGctc > 1:212827/1‑140 (MQ=255) cAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGctct < 2:686363/140‑1 (MQ=255) caAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGTACGGGGGTGTTTTTGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGCTCATTTTTGTTTATATGATCATTGGTTTTTTGCTCTTTTTtgtg > 1:534123/1‑140 (MQ=255) caAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTg < 1:461090/140‑1 (MQ=255) aCCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATg < 2:1190067/140‑1 (MQ=255) cGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCg < 2:1572624/140‑1 (MQ=255) cGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCg > 1:1392876/1‑140 (MQ=255) gACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCgg < 2:894925/140‑1 (MQ=255) aCATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGGACGGGGGTGTTTTTTGGGGCTGGCAAAACGATTTGCCTTGCCCGGCCGGCGATCATTTTTGTTTATATGATCATTGGGTTTTTGCTCTTTTTTGTGATGCggg > 2:1558378/1‑140 (MQ=255) atatTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GGCATTGGTACGGGGGTGTTTTTGGGGTCTGGCAAAAAGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCa > 2:687468/1‑140 (MQ=255) tCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGGACGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCCTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATTATCATTTGTTTTTTGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATgg > 2:1083351/1‑140 (MQ=255) cTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGGACGGGGTTGGTTTTGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGGCGTCGATCATTTTTGTTTATATGATCATTGGTTTTTTTCTCTTTTTCGTGATGCGGGCCATgggggg > 2:762717/1‑139 (MQ=255) tATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAAt < 1:138811/140‑1 (MQ=255) tATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAAt < 1:762717/140‑1 (MQ=255) tATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGGACGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGGCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTTTGCTCTTTTTTGTGATGCGGGCAATGGGGGGAt > 1:499363/1‑140 (MQ=255) aTTGCCATTGGCGGT‑GCCCTTGGTACGGGGGTGTTTATGGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTTCCGGGCCGTCGGTCCTTTTTGTTTTTATTATCATTGGTTTTTTGCTCTTTTTTGTGATGCGGGCAATGGGGGGAtt > 2:768085/1‑140 (MQ=255) aTTGCCATTGGCGGT‑GCCATTTGGAAGGGGGTGTTTTTTGGGGCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGGCGGCGGTCATTTTTGTTTTTATTATCATTGGTTTTTTGCTCTTTTTTGTGATGCGGGGAATGGGGGGAtt > 2:284440/1‑140 (MQ=255) ttGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATtg < 1:372622/140‑1 (MQ=255) ttGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATtg > 1:624807/1‑140 (MQ=255) gCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATtgct < 1:597360/140‑1 (MQ=255) tGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCttt < 2:624807/140‑1 (MQ=255) ggCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTc < 2:1429649/140‑1 (MQ=255) cGGT‑GGCATTGGTGCGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGGTTATTTTCGGTTTTATTATTATTGGTTTTTTTCTCTTTTTTGTGGTGGGGGGCATGGGGGGAATTCTTCTTTTGa > 2:576846/1‑140 (MQ=255) cGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGa < 2:1270645/140‑1 (MQ=255) t‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATc < 1:852440/140‑1 (MQ=255) ccATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTg < 1:341032/140‑1 (MQ=255) ccATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTg < 1:1523460/140‑1 (MQ=255) cATTGGGACGGGGGTGTTTATGGGGTCCGGCAAAAAGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCAATGGGTTTTTGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAAAGGGGGGATTTCTGCTTTTGAATCTgg > 2:642083/1‑140 (MQ=255) tttgTACGGGGGTGTTTATTGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGaa > 2:873797/4‑140 (MQ=255) gTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATAc < 2:270469/140‑1 (MQ=255) gTACGGGGGTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTGATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGCGGGAATTCCTGTTTTCCGATCTGGAATAc < 2:1498819/140‑1 (MQ=255) aCGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACaa < 2:1048976/140‑1 (MQ=255) gggTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATc > 1:150349/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCt > 1:777958/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCt > 2:874360/1‑140 (MQ=255) gttgttTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCtt > 1:81275/1‑140 (MQ=255) gttgttTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCtt < 1:1083351/140‑1 (MQ=255) | GGTACAGGAAGAAAAAAACATGGTAGATCAGGTAAAAGTCGTTGCCGATGATCAGGCTCCGGCTGAACAGTCGCTACGGCGCAATCTCACAAACCGACATATTCAGCTTATTGCCATTGGCGGT‑GCCATTGGTACGGGGTTGTTTATGGGGTCTGGCAAAACGATTAGCCTTGCCGGGCCGTCGATCATTTTCGTTTATATGATCATTGGTTTTATGCTCTTTTTCGTGATGCGGGCAATGGGGGAATTGCTGCTTTCGAATCTGGAATACAAATCTT > NC_000913/4429845‑4430122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |