New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 3899536 | 121 (0.970) | 3 (0.030) | 3/260 | 9.5 | 2.7% | coding (1042/1170 nt) | yieL | putative hydrolase YieL |
? | NC_000913 | = 3900485 | 107 (0.920) | coding (93/1170 nt) | yieL | putative hydrolase YieL | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAACACCACTGAAT > NC_000913/3899399‑3899675 | ttattttattTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATc > 1:1030426/1‑140 (MQ=255) tattttatttAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATcc > 1:1579500/1‑140 (MQ=255) tattttatttAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATcc > 1:682005/1‑140 (MQ=255) tattttatttAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTT‑ATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCt > 1:1188480/1‑140 (MQ=255) attttatttAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCt > 2:1470382/1‑140 (MQ=255) tttatttaAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTTATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTg < 2:52565/140‑1 (MQ=255) ttatttaAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGc < 2:1912491/140‑1 (MQ=255) tttaAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCgg > 2:1014604/1‑140 (MQ=255) tttaAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCgg > 2:1248264/1‑140 (MQ=255) ttaAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGt < 1:663750/140‑1 (MQ=255) aaaTAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTa < 2:1551363/140‑1 (MQ=255) aaaTAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTa < 2:354093/140‑1 (MQ=255) aataatTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTAc < 2:733332/140‑1 (MQ=255) ataatTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACg > 1:122872/1‑140 (MQ=255) ataatTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACg < 2:682005/140‑1 (MQ=255) taatTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGa < 2:1579500/140‑1 (MQ=255) taatTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGa < 1:1607258/140‑1 (MQ=255) aatTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGAc < 2:424952/140‑1 (MQ=255) gTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTa < 1:1917468/140‑1 (MQ=255) tACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTAt < 1:792547/140‑1 (MQ=255) tACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTAt > 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gCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAAc > 2:1053118/1‑140 (MQ=255) gCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAAc > 1:696468/1‑140 (MQ=255) gCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAAc > 1:1341452/1‑140 (MQ=255) ggCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAg < 2:1030426/140‑1 (MQ=255) cTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAAc < 2:365589/133‑1 (MQ=255) cTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAAc > 1:365589/1‑133 (MQ=255) cTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTa < 1:1470382/140‑1 (MQ=255) cTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTa > 1:884578/1‑140 (MQ=255) cTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTa > 2:290799/1‑140 (MQ=255) gTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACcac < 1:1054569/133‑1 (MQ=255) tCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAAt > 2:1971268/1‑140 (MQ=255) tCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAA‑TTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAAtt > 2:1551412/1‑140 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gCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGACCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACg > 2:1048386/1‑140 (MQ=255) cTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACgg > 2:989764/1‑140 (MQ=255) cTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACgg > 2:1219241/1‑140 (MQ=255) cAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGtt < 2:122872/140‑1 (MQ=255) aaGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTg > 1:717606/1‑140 (MQ=255) aGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGt < 1:1908402/140‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGt < 2:1344520/140‑1 (MQ=255) gCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTc < 1:1248264/140‑1 (MQ=255) tCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCGCAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGt < 2:594652/140‑1 (MQ=255) gTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGt < 2:474167/140‑1 (MQ=255) tttCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTaa < 1:1053118/140‑1 (MQ=255) tttCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTaa < 1:1436522/140‑1 (MQ=255) ttCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGAGCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAac > 1:1934136/1‑140 (MQ=255) cAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAacac > 1:1123094/1‑140 (MQ=255) aacccGGCGAGATCCTTGCCGGTTACGACATCGTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTGCGGTTGTCGTGGTAAcacc > 2:967795/3‑140 (MQ=255) gCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAAcacca < 2:556213/140‑1 (MQ=255) cccGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAAcaccac < 1:465712/140‑1 (MQ=255) cccGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAAcaccac < 1:1971268/140‑1 (MQ=255) ccGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGACCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAACACCACt > 1:164491/1‑140 (MQ=255) ggCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAACACCACTGa > 1:432228/1‑140 (MQ=255) ggCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAACACCACTGa > 2:253756/1‑140 (MQ=255) ggCGATATCCTTGCCGGTTACAACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAACACCACTGa > 2:1384924/1‑140 (MQ=255) cGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAACACCACTGAAt > 1:758778/1‑140 (MQ=255) | TGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATT‑CCTGGTAATCAAAGTTAATTTTTTTCTGCTCAAGCTCAGTTTTCAGCCCGGCGATATCCTTGCCGGTTACGACATCTTTATCCCCCACAACCACAGTAAAATTACGTAGTTGCTGGTTGATAGCTGCCGGATCGTTCAGTCGGGCCGCGACACCTTCATCCGGTACGGTTGTCGTGGTAACACCACTGAAT > NC_000913/3899399‑3899675 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |