New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 290634 = | NA (NA) | 8 (0.060) | 8/278 | 7.3 | 7.5% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 1979410 = | 98 (0.740) | intergenic (‑195/‑343) | insA‑5/uspC | IS1 protein InsA/universal stress protein C | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GGTCGAGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTA > NC_000913/290497‑290769 | ggTCGAGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGt > 1:988609/1‑140 (MQ=32) gTCGAGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTa < 1:872123/140‑1 (MQ=33) gTCGAGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTa > 1:2156472/1‑140 (MQ=33) cGAGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAAt < 2:987447/140‑1 (MQ=34) aGTCAGAAATGAGAATGATTGGTCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGa > 1:2015869/1‑140 (MQ=37) aGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGa > 2:619434/1‑140 (MQ=37) aGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGa > 2:228235/1‑140 (MQ=37) aGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTACTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGa > 2:1455582/1‑140 (MQ=37) tCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACt < 2:957548/140‑1 (MQ=38) tCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACt < 1:1408567/140‑1 (MQ=38) tCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACt < 1:1443155/140‑1 (MQ=38) tCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACt < 2:552166/140‑1 (MQ=38) tCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACt < 2:1314184/140‑1 (MQ=38) tCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACt < 1:1297744/140‑1 (MQ=38) tCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTACTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACt < 1:2034287/140‑1 (MQ=38) cAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTc > 1:2145308/1‑140 (MQ=39) aGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTcc < 1:1690466/140‑1 (MQ=40) aGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTcc < 1:406654/140‑1 (MQ=40) aGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTcc < 2:303961/140‑1 (MQ=40) aGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTcc < 2:774393/140‑1 (MQ=40) aGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTcc < 2:1570911/140‑1 (MQ=40) aTGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACt < 1:1611569/140‑1 (MQ=255) agaATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGGTTGCTGCCTTACTTCTTTACTTCAGCGGCGACGGAGGGGGTATATCTGTTACCGCGCAATGCCTCTAACTTAt > 2:1453243/1‑140 (MQ=11) agaATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTAt < 2:607422/140‑1 (MQ=255) agaATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTAt > 2:1203921/1‑140 (MQ=255) agaATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTAt < 1:2023729/140‑1 (MQ=255) agaATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTAt < 1:959988/140‑1 (MQ=255) aaTGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTg < 2:2156472/140‑1 (MQ=255) aTGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGa < 2:1072024/140‑1 (MQ=255) tGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGAt < 2:1757309/140‑1 (MQ=255) gATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATa < 2:1477248/140‑1 (MQ=255) cttcttTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 1:240106/140‑1 (MQ=255) cttcttTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 2:1913887/140‑1 (MQ=255) cttcttTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 2:2145308/140‑1 (MQ=255) cttTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg > 1:1846449/1‑140 (MQ=255) ttATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:1541504/140‑1 (MQ=255) ttATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 2:194900/140‑1 (MQ=255) ttATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:473868/140‑1 (MQ=255) ttAAGGACTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 1:2196540/1‑140 (MQ=255) tAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATg > 2:270245/1‑140 (MQ=255) gATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 2:1164586/140‑1 (MQ=255) aTGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa < 2:457362/140‑1 (MQ=255) aTGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa > 1:1050560/1‑140 (MQ=255) aTGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa < 1:1203921/140‑1 (MQ=255) aTGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa > 1:1608720/1‑140 (MQ=255) cTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt > 2:496394/1‑140 (MQ=255) aaaaTGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa > 1:322375/1‑140 (MQ=255) aaaaTGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa < 1:1455582/140‑1 (MQ=255) aaaTGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:54210/140‑1 (MQ=255) aaTGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAtg < 2:2020156/140‑1 (MQ=255) tGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAtgct > 2:801595/1‑140 (MQ=255) ggCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAtgctg > 1:922420/1‑140 (MQ=255) gCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAtgctgc < 1:956168/140‑1 (MQ=255) ggAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTc < 1:801595/140‑1 (MQ=255) ggAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTc > 2:1621350/1‑140 (MQ=255) aaCATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCAcc < 1:340915/140‑1 (MQ=255) tGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGAtt > 1:1661831/1‑140 (MQ=255) ggCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGAttt > 1:6366/1‑140 (MQ=255) ggCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGAttt > 2:356740/1‑140 (MQ=255) cGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTg < 1:816445/140‑1 (MQ=255) ggCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTgaga > 2:1348348/1‑140 (MQ=255) ggCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTgaga > 1:233251/1‑140 (MQ=255) ggCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTgaga > 2:337113/1‑140 (MQ=255) ggCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTgaga < 1:496394/140‑1 (MQ=255) ggCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTgaga > 2:81463/1‑140 (MQ=255) gCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGaa < 2:922420/140‑1 (MQ=255) cTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAAc > 2:1966762/1‑140 (MQ=255) gctgcCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTTGGTTAAGTTAAGCCCCGATGCCTTTGTCATGCTGCTCACCCGATTTTGGGaaggcc > 1:586081/1‑136 (MQ=21) ctgcCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa > 2:639300/1‑140 (MQ=255) gcCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 2:1984461/140‑1 (MQ=255) ttacttcattacttcaGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc > 2:1027558/1‑140 (MQ=255) tacttcattacttcaGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACt > 1:1341598/1‑140 (MQ=255) cattacttcaGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGAAAGCGACTTCCGt > 1:1930949/1‑140 (MQ=255) ttacttcaGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTcc > 2:1606992/1‑140 (MQ=255) tcaGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGcc < 2:322375/140‑1 (MQ=255) tcaGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGcc > 1:1706068/1‑140 (MQ=255) tcaGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGcc < 1:1027558/140‑1 (MQ=255) caGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGTTAATGACTCCAACTTCTTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGCCCCAGCCg > 2:1100054/1‑140 (MQ=255) caGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGcc > 1:836136/1‑139 (MQ=255) gCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTg > 1:138308/1‑140 (MQ=255) gCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTg > 2:1837047/1‑140 (MQ=255) gATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAgg > 2:837742/1‑140 (MQ=255) aTGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGt > 1:1662205/1‑140 (MQ=255) gaagCGATTAATCTTTTACCGGGTAATGGCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGtgct < 2:1930949/137‑1 (MQ=11) gAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGtgct < 1:1825906/140‑1 (MQ=255) gAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGtgct < 2:481289/140‑1 (MQ=255) cGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCt < 1:270245/140‑1 (MQ=255) cGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCt < 2:275248/140‑1 (MQ=255) cGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCt < 1:619434/140‑1 (MQ=255) atatatCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCa < 1:2111339/140‑1 (MQ=255) tatCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAt < 2:1661831/140‑1 (MQ=40) tatCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAt < 1:1837047/140‑1 (MQ=40) tatCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAt < 2:2196540/140‑1 (MQ=40) atCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGAtt < 2:964092/140‑1 (MQ=39) ttACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGt > 2:1914734/1‑140 (MQ=34) aCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCGAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTa > 2:1043293/1‑140 (MQ=18) aCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTa > 1:2186807/1‑140 (MQ=33) aCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTa > 1:252122/1‑140 (MQ=33) aCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTa > 2:1155228/1‑140 (MQ=33) aCCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTa > 1:1171436/1‑140 (MQ=33) | GGTCGAGTCAGAAATGAGAATGATTGGCCTTCTTTATGATTTTAAGGATTATGCTTCTAAAATGGCGGAGAACATGGCGAGGCTTGCTGCCTTACTTCATTACTTCAGCGGTGATGGAGGCGATATATCTGTTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCTGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTA > NC_000913/290497‑290769 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |