Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,628,625 | 0 | A | C | 23.4% | 142.4 / 10.3 | 64 | V105G (GTC→GGC) | pdeF | cyclic di‑GMP phosphodiesterase PdeF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/4); new base C (0/15); total (45/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.43e-11 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCT > NC_000913/2628486‑2628758 | gCTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGa < 2:1691928/140‑1 (MQ=255) cTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAc > 2:528238/1‑140 (MQ=255) cTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAc < 2:2235998/140‑1 (MQ=255) cTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAc > 1:702693/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGAccc < 1:569336/140‑1 (MQ=255) cAGTAATCCTAAAAATGCAGAAAACTGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATCCGCGGGGAAATA‑AAACGGGTATCCCCATGTG‑AACGTTTTTACGCGGGGGAGTAAAGCCCCTGTa < 2:98656/140‑1 (MQ=255) tAATCCAAAAAATGCAGCAAACGGGAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATCCGCGGGGAAATT‑AACCGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGTAAc < 2:190794/140‑1 (MQ=255) aaaTCCTACAAATGCAGCAAACGGAAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCAAGAATATACGCTGGAAAATA‑AAACGGGTATCACCATGTAAAACGTTGTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAAc < 2:1330452/139‑1 (MQ=255) caaCAAATGCAAAAAACTGAAAAAATATCAAAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTCCCAGAATAGCCGCGGGGAAATT‑AAAGGGTTACCACCATGTGAAACTTTTTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGAAACCGccc < 2:1329293/138‑1 (MQ=255) cTAAAAATGCAGAAAACTGAAAAAGTATAAGAAACAGCGTTGAAGAAAACACAATCGGCCAGAATATACGCGGGAAAATA‑AACCGGGTATCACCATGTAAAACGTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGAAACCGccc < 2:1755592/140‑1 (MQ=255) aaaaTGCAGCAACCGGGAAAAATATCAAAAACAGCTTTGGAGGAAACACAATACGCGAGAATATGCCCGGATAAATT‑AAACGGTTATCCCCATGTGAAACTTTTTTACGGGGGGGAGAAAAGACCCTGTAACCGCCCCaa < 2:1855199/139‑1 (MQ=255) aaaTGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAAc > 1:1769675/1‑140 (MQ=255) ggcagaaAACTGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAGAATATCCGCTGGAAAATT‑AAACGGGTACCCCCATGTGAAACGTTGTTCCGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACaga < 2:983503/139‑1 (MQ=255) gcagaaAACGGAAAAAGTATCAAAAACAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCAAAAATATCCGCTGGAAAATA‑AAACGGGTATCACCATGTAAAACGTTGTTCCGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACagag < 2:1910008/140‑1 (MQ=255) cagcaAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAgaga > 2:1879079/1‑140 (MQ=255) aaaCGGCGTTGCAGAAAACAAATTCGGACAAAATATCCGC‑GGAAAATTAAAACGGGTATCACAATGTAAACCGTTTTTCCGGGGGGAAGAAAACCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:2038287/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCTTTGAAGGAAAAAAAATCCGCCAAAAAAAACGGGGGAAAATA‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:1409139/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 1:69775/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTTGCAGAAAACACAATCTGCCAAAATATACGCGGGAAAATA‑AAACGGGTACCACCATGTAAAACTTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:2012973/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTTGCAGAAAACAAAATCTGCAAAAATATACGCTGGGAAATA‑AAACGGGTACCACCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:1918249/140‑1 (MQ=255) aaaCAGCGTGGCAGAAAACACAATCTCCCAAAATATCCGCGGGAAAATA‑AACCGGTTATCCCCATGTAAAATGTTGTTCCGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 2:1946560/140‑1 (MQ=255) cAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATA‑AAAGGGGTATCACCATGTAAACGGTTGTTACGCC‑GGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGt < 2:442979/140‑1 (MQ=255) gCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGT‑ACCGCCCCAACAGGGAATGATAATGATAATAAAATTAACCGTTa > 2:1769888/1‑140 (MQ=255) cGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTa > 1:2165253/1‑140 (MQ=255) gCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGa > 1:1366508/1‑140 (MQ=255) gCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGa > 1:997440/1‑140 (MQ=255) gAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGc > 2:726082/1‑140 (MQ=255) aaCACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGt > 1:1662516/1‑140 (MQ=255) acaATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTc > 1:1699321/1‑140 (MQ=255) caATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCg > 1:2177097/1‑140 (MQ=255) tCTGCAAAAATATCCGCGGGAAAATA‑AACCGGGTATCCCCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATTATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaa < 2:82197/140‑1 (MQ=255) tGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaaaa > 1:2208880/1‑140 (MQ=255) aaTACACGCTGGGAAATA‑AAGCGGGTACCACCATGTAAAACGTTTTTCCGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 1:1879079/140‑1 (MQ=255) tatcCGCGGGAAAATA‑AAACGGGTACCCCCATGTAAAACGTTGTTACGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGct < 2:1769675/140‑1 (MQ=255) tataCGCGGGAAAATA‑AAACGGGTATCCCCATGTAAAAGTTTTTTCCGCGGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGct < 2:2025997/140‑1 (MQ=255) aCGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTg > 1:2025997/1‑140 (MQ=255) cGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGc > 1:1435262/1‑140 (MQ=255) gggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 1:1165263/1‑140 (MQ=255) gggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 2:784925/1‑140 (MQ=255) gggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 2:2138544/1‑140 (MQ=255) gggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 1:1960131/1‑140 (MQ=255) gggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 2:69021/1‑140 (MQ=255) ggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:2085987/1‑140 (MQ=255) ggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 1:128770/1‑140 (MQ=255) ggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 2:156230/1‑140 (MQ=255) ggAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTACGTAAAAACCCAGCTCTGCATAtt > 2:1888769/1‑140 (MQ=255) gAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAttt > 1:2202222/1‑140 (MQ=255) gAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAttt > 2:2104406/1‑140 (MQ=255) aaTT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGc > 2:1265157/1‑140 (MQ=255) aaCGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACa > 2:2134692/1‑140 (MQ=255) ggggTATCACCATGTAAAACTTTGTTACGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 2:1960131/139‑1 (MQ=255) cGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa < 1:726082/140‑1 (MQ=255) cGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaa > 2:1054441/1‑140 (MQ=255) aTCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATcc > 1:87562/1‑140 (MQ=255) ccccttgtaAAAGGTTGTTACGCGGGGGAAAAAAGCCCCTATAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt < 2:2177097/135‑1 (MQ=255) cATGTGAAGCGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGCCCCTG‑AACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 1:1769888/140‑1 (MQ=255) aTGTAAAACGTTTTTCCGCCGGGGAGAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 2:702693/140‑1 (MQ=255) tgtgAAACTTTGTTACGCGGGGGAGTAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGc < 2:2208880/140‑1 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCTGACAAAAATCCCTAAGGc > 2:2193893/1‑140 (MQ=255) tgtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGc > 2:1685534/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAGGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 1:758269/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 1:1523382/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 2:718744/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 2:1409384/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 2:297479/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCg > 1:1469673/1‑140 (MQ=255) gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGAC‑AAAATCCCTAAGGCGa > 1:1298487/1‑140 (MQ=255) tgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTGACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGa > 1:1340924/1‑140 (MQ=255) tgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGa > 1:1877743/1‑140 (MQ=255) acgctgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATccc > 2:747536/5‑140 (MQ=255) gttgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTATTGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTg > 2:1120884/1‑140 (MQ=255) gttgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTg > 2:1598905/1‑140 (MQ=255) ttgtgACGCGGGGGAGAAAGGCCCTTGAAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTgg < 1:528238/140‑1 (MQ=255) ccGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATgccg < 1:1265157/140‑1 (MQ=255) gggggAAAAAAGCCCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATgccgc < 2:87562/139‑1 (MQ=255) gggAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGccc < 2:1699321/140‑1 (MQ=255) gggAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGccc > 2:1444115/1‑140 (MQ=255) gagaAAGGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCTGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAg < 1:2193893/140‑1 (MQ=255) gagaAAAGCCCCTGAAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCACCCAg < 1:1764935/140‑1 (MQ=255) gaaaaGCCCTTTTAGCCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCt < 2:1469673/138‑1 (MQ=255) | GCTCGCCAGTAATCCTACAAATGCAGCAAACTGGAAAAGTATCAGAAACAGCGTTGCAGGAAACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATT‑AAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCCCTGGCAATGCCGCCCAGCT > NC_000913/2628486‑2628758 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |