New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1279830 | 92 (1.090) | 3 (0.040) | 3/278 | 7.4 | 3.2% | intergenic (+482/‑34) | narK/narG | nitrate:nitrite antiporter NarK/nitrate reductase A subunit alpha |
? | NC_000913 | 1279834 = | 92 (1.090) | intergenic (+486/‑30) | narK/narG | nitrate:nitrite antiporter NarK/nitrate reductase A subunit alpha | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTGGGAGGATGGA > NC_000913/1279695‑1279968 | gtggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCagag < 2:1132404/140‑1 (MQ=255) gtggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCagag < 2:515646/140‑1 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTTCCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg > 1:6472/1‑140 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg > 2:1227176/1‑140 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg > 1:58503/1‑140 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg < 1:308475/140‑1 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg > 1:755753/1‑140 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg > 1:90134/1‑140 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg > 1:1095221/1‑140 (MQ=255) tggCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAgg < 1:948268/140‑1 (MQ=255) gCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATcgggccga > 1:1177154/1‑133 (MQ=255) gCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGc > 2:952898/1‑140 (MQ=255) gCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGc > 2:1121258/1‑140 (MQ=255) gCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGc > 1:135649/1‑140 (MQ=255) gCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGc > 2:730717/1‑140 (MQ=255) gCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGc > 1:600735/1‑140 (MQ=255) gTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGa < 2:594592/140‑1 (MQ=255) gTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGa < 1:1039568/140‑1 (MQ=255) gTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGa < 1:1022842/140‑1 (MQ=255) ttAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGAc > 1:1050858/1‑140 (MQ=255) ttAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGAc < 1:561802/140‑1 (MQ=255) aaTTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCCCTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAg < 1:1413664/140‑1 (MQ=255) aaTTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAg < 1:1227176/140‑1 (MQ=255) tCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTcc < 1:730717/140‑1 (MQ=255) tAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCcac > 1:469365/1‑140 (MQ=255) tAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCcac > 1:1394659/1‑140 (MQ=255) tAAAGGGGAATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GACGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCcac > 1:576608/1‑140 (MQ=255) aaGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAg > 2:1395806/1‑140 (MQ=255) aaGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCACCAGCCTccaccgg > 2:1002583/1‑135 (MQ=255) ggggTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGga < 1:952898/140‑1 (MQ=255) tATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGaaa > 1:486708/1‑140 (MQ=255) tATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGaaa > 2:1143347/1‑140 (MQ=255) aTCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGaaaa > 1:765028/1‑140 (MQ=255) gAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGa > 1:618932/1‑140 (MQ=255) aTTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGt > 2:495893/1‑140 (MQ=255) tttACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTa < 1:1300638/140‑1 (MQ=255) aCTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAAt > 2:893603/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCATCCACATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAGACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTg > 2:1257375/1‑140 (MQ=255) tttttCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATC‑‑‑GGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGAcc < 2:1177154/140‑1 (MQ=255) tttCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGAc < 1:1395806/140‑1 (MQ=255) tttCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGAc < 2:135649/140‑1 (MQ=255) tttCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATC‑‑‑GGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCgg < 2:1270200/140‑1 (MQ=255) aTCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGt < 2:773609/140‑1 (MQ=255) ccATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTTCCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCg < 2:6472/140‑1 (MQ=255) ccATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCg > 2:859552/1‑140 (MQ=255) aTCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCt < 1:494264/140‑1 (MQ=255) tctTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTc < 2:156061/140‑1 (MQ=255) tctTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTc < 1:859552/140‑1 (MQ=255) ctTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCa < 1:495893/140‑1 (MQ=255) tGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCaaa < 1:979713/140‑1 (MQ=255) tGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCaaa > 1:548780/1‑140 (MQ=255) gATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAAc > 2:625186/1‑140 (MQ=255) tCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAg < 1:1108819/140‑1 (MQ=255) cGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGa < 1:1257375/140‑1 (MQ=255) ttATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAg > 1:176411/1‑140 (MQ=255) tATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTAGTTCAAACAGAAgg > 1:865050/1‑140 (MQ=255) tATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAgg > 1:1146311/1‑140 (MQ=255) tATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAgg > 2:357965/1‑140 (MQ=255) tATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAgg > 1:363230/1‑140 (MQ=255) aCGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCttt > 2:802880/1‑140 (MQ=255) gTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGa < 2:90134/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGa < 2:618932/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGa < 2:600735/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGa < 2:765028/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGa < 2:755753/140‑1 (MQ=255) cAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTAAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATggg < 2:58503/140‑1 (MQ=255) 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1:357965/140‑1 (MQ=255) aCCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAg < 2:1302861/140‑1 (MQ=255) cccTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGACAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTtctc < 2:931387/140‑1 (MQ=255) cccTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTtctc < 1:1121258/140‑1 (MQ=255) aaaCATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATAc < 1:956733/140‑1 (MQ=255) aaaCATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATAc < 2:176411/140‑1 (MQ=255) aTTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAAc < 2:1095221/140‑1 (MQ=255) tAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCg > 1:1017479/1‑140 (MQ=255) t‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTg < 2:486708/140‑1 (MQ=255) t‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTg > 1:1243789/1‑140 (MQ=255) gTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTgg > 2:789298/1‑140 (MQ=255) gTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTgg > 2:1419600/1‑140 (MQ=255) gTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTgg > 1:521067/1‑140 (MQ=255) tttATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTGggagga < 1:893603/140‑1 (MQ=255) tttATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTGggagga < 1:1203337/140‑1 (MQ=255) tATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTGGGAggatg > 2:447038/1‑140 (MQ=255) tCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAGCCGATGAGTAAATTCGTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGACACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAGCCGTGACTGGGAggatggc < 2:576608/140‑2 (MQ=255) tCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTGGGAggatgga < 2:1394659/140‑1 (MQ=255) | GTGGCTGTTAATTATCCTAAAGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTCCCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAAT‑GTCGATTTATCAGAGGGCCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCGATGAGTAAATTCCTGGACCGGTTTCGCTACTTCAAACAGAAGGGTGAAACCTTTGCCGATGGGCATGGCCAGCTTCTCAATACCAACCGTGACTGGGAGGATGGA > NC_000913/1279695‑1279968 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |