| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1979397 = | 93 (0.970) | 10 (0.100) | 6/276 | 6.7 | 9.7% | intergenic (‑182/‑356) | insA‑5/uspC | IS1 protein InsA/universal stress protein C |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TGGCAGCATCACCCATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTT > NC_000913/1979258‑1979536 | ctcaattacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAAc < 1:583736‑M2/119‑1 (MQ=255) tcaattacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACt < 1:294441‑M2/120‑1 (MQ=255) tcaattacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGCTTTTCGCTACGCTAGCCATCAAAAATGAATCAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAaca < 2:1625701‑M2/120‑2 (MQ=255) caattacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTc < 2:1128324‑M2/121‑1 (MQ=255) caattacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTc < 1:746554‑M2/121‑1 (MQ=255) ttacttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCAcc < 1:177957‑M2/124‑1 (MQ=255) acttaacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGt < 1:623595‑M2/126‑1 (MQ=255) taacataAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatt > 2:1354914‑M2/4‑134 (MQ=255) aacataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAaat > 2:1060439‑M2/11‑140 (MQ=255) cataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAattaa > 1:1117576‑M2/9‑140 (MQ=255) cATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatttgc > 1:852533‑M2/1‑131 (MQ=255) aatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAatcat < 2:1387768‑M2/136‑1 (MQ=255) aatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAatcat < 2:1169759‑M2/136‑1 (MQ=255) aatgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAatcat < 1:121098‑M2/136‑1 (MQ=255) atgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAatcatc > 2:286881‑M2/4‑140 (MQ=255) atgTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAatcatc > 1:207363‑M2/4‑140 (MQ=255) aTGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatttgccccta < 1:54205‑M2/140‑15 (MQ=255) gTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTg < 2:276999‑M2/139‑1 (MQ=255) tataAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGc < 2:1341116/140‑1 (MQ=255) gTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatttgcccctatatttcca > 2:1434219‑M2/1‑118 (MQ=255) gTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataa > 1:1393233/1‑140 (MQ=255) cATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatttgcccctatatttccaga > 1:1521390‑M2/1‑116 (MQ=255) aTACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTTCGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaata > 1:1272435/1‑140 (MQ=255) aTACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaata > 1:1451188/1‑140 (MQ=255) aTACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaata > 2:950179/1‑140 (MQ=255) aTACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaata > 2:509693/1‑140 (MQ=255) aTACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaata > 1:670165/1‑140 (MQ=255) tACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaataa > 2:1304933/1‑140 (MQ=255) aCTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAaataat > 2:1491109/1‑140 (MQ=255) aCTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAaataat > 1:542582/1‑140 (MQ=255) ttgttttgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACt > 1:1429676/1‑140 (MQ=255) tgttttgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgtt > 2:1397037‑M2/1‑108 (MQ=255) tgttttgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACtt < 2:743517/140‑1 (MQ=255) tgttttgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACtt < 2:3438/140‑1 (MQ=255) gttttgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACttt > 1:693531/1‑140 (MQ=255) tttgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCa < 2:670165/140‑1 (MQ=255) tgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAATTAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATg < 2:1117576/140‑1 (MQ=255) tgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATg < 2:439737/140‑1 (MQ=255) tgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATg < 1:884156/140‑1 (MQ=255) tgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATg < 2:653121/140‑1 (MQ=255) tgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATg < 1:48563/140‑1 (MQ=255) tgGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATg < 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tttttCGCTACGCTAGCAATCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCTCAGTCAAAATAACTCTCCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCGCTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAAc < 2:576982/140‑1 (MQ=255) tttCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAg > 2:1197648/1‑140 (MQ=255) tCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGac < 2:486070/140‑1 (MQ=255) cgctaGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTAc > 1:148060/1‑140 (MQ=255) agcaagcaAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCg < 1:932094/140‑1 (MQ=255) gcaagcaaAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGcac < 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1:673810‑M2/1‑31 (MQ=255) ggATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttagcccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccat > 2:1178694‑M2/1‑29 (MQ=255) ggATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGcaacaa < 1:1393087/140‑1 (MQ=255) gATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACttt > 1:383528/1‑61 (MQ=255) gATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTAGCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAAt < 1:498969/140‑1 (MQ=255) gATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAAt > 1:1544722/1‑140 (MQ=255) gATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAAt > 1:1615057/1‑140 (MQ=255) gATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAAt < 1:303149/140‑1 (MQ=255) aTGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattc > 2:402402‑M2/1‑27 (MQ=255) t‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACt > 2:1233829/1‑140 (MQ=255) t‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACt > 1:1236206/1‑140 (MQ=255) t‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACt < 1:1212222/140‑1 (MQ=255) gcgcACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACtt > 2:1305946/1‑140 (MQ=255) cgcACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACtta > 2:840558/1‑140 (MQ=255) cacaGTCAAAATAACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataat < 2:1408327‑M2/140‑122 (MQ=255) cacaGTCAAAATAACTCACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataat < 2:1146314‑M2/140‑122 (MQ=255) acaGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCAACTGCTATAAATATTCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACttaatg > 1:126783/1‑140 (MQ=255) aGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACttaatgtt > 2:960255/1‑140 (MQ=255) tCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACttaatgttaa > 2:1269054/1‑140 (MQ=255) aaTAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGaa < 1:726960/140‑1 (MQ=255) aaTAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGaa < 2:1125175/140‑1 (MQ=255) aaTAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGaa < 2:1429676/140‑1 (MQ=255) aCTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGt > 2:482460/1‑140 (MQ=255) aCTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGt < 2:693531/140‑1 (MQ=255) cTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGtt < 2:531875/140‑1 (MQ=255) cTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGtt < 2:736956/140‑1 (MQ=255) | TGGCAGCATCACCCATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTT‑‑GCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAATAATCACTTTCATGCAATACCAGATAAGCTATTTTTAAACAGACACTTACCGCACAACAAACTAATTAAATACAAAGAAAGGCAACAATCAACTTAATGTTAATGAAATGTT > NC_000913/1979258‑1979536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |