| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,168,430 | +ATGTTGTACAGAACATTTCCTACATAAGTAGGAA | intergenic (‑124/‑282) | yegR ← / → yegS | uncharacterized protein YegR/lipid kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2168408 = | 4 (0.090) | 43 (1.090) +CTGTACAACAT |
33/256 | 0.2 | 91.2% | intergenic (‑102/‑304) | yegR/yegS | uncharacterized protein YegR/lipid kinase |
| ? | NC_000913 | = 2168430 | 5 (0.120) | intergenic (‑124/‑282) | yegR/yegS | uncharacterized protein YegR/lipid kinase | |||||
GCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTT > NC_000913/2168293‑2168554 | gCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAat < 2:417400‑M2/140‑3 (MQ=255) tATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgt < 2:150957‑M2/140‑5 (MQ=255) aTCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgtt < 2:593555‑M2/140‑6 (MQ=255) acgacactctctagtgtttaaatataataatggcatgattattataattgaataggattataataaatgttctgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACgg < 2:693784‑M1/29‑1 (MQ=255) 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2:329656‑M1/67‑140 (MQ=255) attgaataggattataataaatgttctgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAAtatatta < 1:525254‑M1/75‑1 (MQ=255) attgaataggattataataaatgttctgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAAtatatta < 2:184613‑M1/75‑1 (MQ=255) tgtTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggccctt < 2:521797‑M2/140‑55 (MQ=255) tgtTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggccctt > 2:603002‑M2/1‑86 (MQ=255) tgtTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggccctt < 2:94000‑M2/140‑55 (MQ=255) 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2:562376‑M1/89‑1 (MQ=255) ggCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatggg > 1:101401‑M2/1‑69 (MQ=255) ggCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatggg > 1:2734‑M2/1‑69 (MQ=255) aatgttctgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGtt > 2:601258‑M1/47‑140 (MQ=255) aatgttctgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGtt > 1:371476‑M1/47‑140 (MQ=255) gCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggg < 1:103844‑M2/140‑73 (MQ=255) 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1:551650‑M2/1‑64 (MQ=255) ctgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTg < 2:502890‑M1/100‑1 (MQ=255) ctgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTGCAGGGTAACTCCATGGAGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTg < 1:404651‑M1/100‑1 (MQ=255) ttattaTAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggcttta > 2:103844‑M2/1‑62 (MQ=255) tgtacaacatttcctacataagtaggaaatgttgtacagAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGa < 1:520109‑M1/101‑1 (MQ=255) tataATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggctttaatat < 2:422179‑M2/140‑83 (MQ=255) 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1:58297‑M1/12‑140 (MQ=255) ttCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggctttaatatattatattgaagatgccactgtttagt > 1:593555‑M2/1‑31 (MQ=255) ttCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggctttaatatattatattgaagatgccactgtttagt < 1:228645‑M2/140‑110 (MQ=255) tCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggctttaatatattatattgaagatgccactgtttagtt > 2:240684‑M2/1‑30 (MQ=255) cTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggctttaatatattatattgaagatgccactgtttagttg < 2:502890‑M2/140‑112 (MQ=255) cTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggccctgcagggtaactccatggaggctttaatatattatattgaagatgccactgtttagttg < 1:404651‑M2/140‑112 (MQ=255) 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1:339911‑M2/140‑120 (MQ=255) caTTTCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggctttaatatattatattgaagatgccactgtttagttgaatattag < 1:685394‑M2/140‑120 (MQ=255) ttCCTACATAAGTAGGAAatgttgtacagaacatttcctacataagtaggaattacggacattgaggcccttcagggtaactccatgggggctttaatatattatattgaagatgccactgtttagttgaatattaggta < 2:73785‑M2/140‑123 (MQ=255) ttCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCg > 2:102257/1‑140 (MQ=255) ccTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGtt < 1:502890/140‑1 (MQ=255) ccTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGtt < 1:196611/140‑1 (MQ=255) | GCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTT > NC_000913/2168293‑2168554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |