New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4545168 = | 91 (0.940) | 3 (0.030) | 3/270 | 7.6 | 2.5% | coding (73/2637 nt) | fimD | type I fimbriae usher protein |
? | NC_000913 | = 4546624 | 141 (1.500) | coding (1529/2637 nt) | fimD | type I fimbriae usher protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAATGGGC > NC_000913/4545029‑4545306 | aCGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTg > 1:1413577/1‑140 (MQ=255) cGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTgg > 2:643752/1‑140 (MQ=255) ggggAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGttttt > 1:950354/1‑140 (MQ=255) ggAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGttttttt > 2:1189650/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTc > 2:447935/1‑140 (MQ=255) ttttCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCg < 1:434065/140‑1 (MQ=255) tttCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACAC‑CAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGAc < 2:566859/140‑1 (MQ=255) ttCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGAc < 1:1014243/140‑1 (MQ=255) ttCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGAc < 2:1089228/140‑1 (MQ=255) ttCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGAc < 1:1203749/140‑1 (MQ=255) gAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGt < 2:1413577/140‑1 (MQ=255) gAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGt > 2:300744/1‑140 (MQ=255) aaTAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTc > 2:676638/1‑140 (MQ=255) tAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGc > 1:157128/1‑140 (MQ=255) aaaGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCtg < 1:1032733/140‑1 (MQ=255) gAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGc < 2:862452/140‑1 (MQ=255) gAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGc < 1:319755/140‑1 (MQ=255) aTTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCtt > 1:744163/1‑140 (MQ=255) ttGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCttt > 2:71041/1‑140 (MQ=255) gACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTg < 1:1182415/140‑1 (MQ=255) aCTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGc > 1:1346754/1‑140 (MQ=255) gCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGc < 2:796776/140‑1 (MQ=255) gCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGc < 2:916672/140‑1 (MQ=255) cGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGGTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac < 2:1168474/140‑1 (MQ=255) cGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac > 2:859779/1‑140 (MQ=255) cGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac > 1:106589/1‑140 (MQ=255) cGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac < 1:447935/140‑1 (MQ=255) cGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGcac < 1:252914/140‑1 (MQ=255) gTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAgg < 2:950354/140‑1 (MQ=255) gTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAgg < 1:1189650/140‑1 (MQ=255) tGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGc < 1:257630/140‑1 (MQ=255) gATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCa < 2:494468/140‑1 (MQ=255) taatGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGAc < 2:1346754/140‑1 (MQ=255) atGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACct < 2:370449/140‑1 (MQ=255) atGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACct < 2:157128/140‑1 (MQ=255) atGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACct < 2:1563350/140‑1 (MQ=255) atGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACct < 1:1630192/140‑1 (MQ=255) gTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACctct < 1:801397/140‑1 (MQ=255) tCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTa > 1:435426/1‑140 (MQ=255) tCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTa > 2:1464857/1‑140 (MQ=255) atatCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTAtt > 2:1620234/1‑140 (MQ=255) tatCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTAttt > 1:1050687/1‑140 (MQ=255) tatCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTAttt > 1:200691/1‑140 (MQ=255) aTTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCcg < 1:865172/140‑1 (MQ=255) gACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCttt > 1:940960/1‑140 (MQ=255) tttACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTa < 2:1559725/140‑1 (MQ=255) tttACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTa < 2:619545/140‑1 (MQ=255) tACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGc > 1:1103015/1‑140 (MQ=255) tACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGc > 2:1384628/1‑140 (MQ=255) tACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGc < 1:726338/140‑1 (MQ=255) aGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgat < 2:744163/140‑1 (MQ=255) aGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgat < 2:1269990/140‑1 (MQ=255) aGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgat < 1:1110386/140‑1 (MQ=255) aGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgat < 1:1270062/140‑1 (MQ=255) cGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgatga < 1:1092596/140‑1 (MQ=255) cGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGgatga > 1:641642/1‑140 (MQ=255) acacacAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATccc > 2:1398050/1‑140 (MQ=255) cacaATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAg > 2:765031/1‑140 (MQ=255) caATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGc < 1:1620234/140‑1 (MQ=255) aaTGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCt > 1:1128448/1‑140 (MQ=255) tGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCtgt > 1:1226663/1‑140 (MQ=255) cTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTgg > 1:904570/1‑140 (MQ=255) ttGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGc > 1:1437116/1‑140 (MQ=255) gCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCg > 2:1573981/1‑140 (MQ=255) gCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCg > 1:18239/1‑140 (MQ=255) gCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCg < 2:646446/140‑1 (MQ=255) cATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGa > 1:978811/1‑140 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1:929529/1‑140 (MQ=255) tCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTAt > 2:1404427/1‑140 (MQ=255) cGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATc > 2:798469/1‑140 (MQ=255) gTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCTCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGTCTGTGGCCGATTTATcg > 2:87609/1‑140 (MQ=255) gTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATcg < 1:71041/140‑1 (MQ=255) gTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATcg < 2:641642/140‑1 (MQ=255) tAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATcgc > 2:565205/1‑140 (MQ=255) aaGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATcgcg > 1:45165/1‑140 (MQ=255) aGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGt > 2:307547/1‑140 (MQ=255) aGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGt > 1:55962/1‑140 (MQ=255) cGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGa > 2:163467/1‑140 (MQ=255) tttGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGaaa > 2:104683/1‑140 (MQ=255) tttGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGaaa < 1:1464857/140‑1 (MQ=255) ttGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGaaaa < 2:200691/140‑1 (MQ=255) catcaggTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAAt < 2:620923/135‑1 (MQ=255) cTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAATggg > 1:116854/1‑140 (MQ=255) cTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAATggg > 2:1121450/1‑140 (MQ=255) cTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAATggg > 2:639163/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAATGGGc > 1:251840/1‑140 (MQ=255) tGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAATGGGc > 2:604446/1‑140 (MQ=255) | ACGCAGGGGGAATTTTTCGCCTGAATAAAAAGAATTGACTGCCGGGTGATTTTAAGCCGGAGGAATAATGTCATATCTGAATTTAAGACTTTACCAGCGAAACACACAATGCTTGCATATTCGTAAGCATCGTTTGGCTGGTTTTTTTGTCCGACTCGTTGTCGCCTGTGCTTTTGCCGCACAGGCACCTTTGTCATCTGCCGACCTCTATTTTAATCCGCGCTTTTTAGCGGATGATCCCCAGGCTGTGGCCGATTTATCGCGTTTTGAAAATGGGC > NC_000913/4545029‑4545306 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |