New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2487015 = | 101 (1.090) | 3 (0.030) | 3/260 | 7.9 | 3.1% | coding (2642/3594 nt) | evgS | sensory histidine kinase EvgS |
? | NC_000913 | = 2487011 | 91 (1.050) | coding (2638/3594 nt) | evgS | sensory histidine kinase EvgS | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATA > NC_000913/2486877‑2487151 | aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 1:921403/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 1:313780/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 1:1179691/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 2:1436762/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 2:732545/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 1:1477103/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 2:227563/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 2:647053/1‑140 (MQ=255) aTTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaa > 2:22877/1‑140 (MQ=255) cTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaaca < 1:1012466/140‑1 (MQ=255) tGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaacaa < 1:933746/140‑1 (MQ=255) tGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaacaa > 1:232612/1‑133 (MQ=255) tGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGaacaacaacaa < 2:232612/133‑1 (MQ=255) tcAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGt < 2:1546156/132‑1 (MQ=255) tcAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGt > 1:1546156/1‑132 (MQ=255) tcAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGc > 1:844255/1‑140 (MQ=255) aaaTTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTa > 1:586682/1‑140 (MQ=255) ttACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGc < 1:186956/140‑1 (MQ=255) tACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGcc > 1:879958/1‑140 (MQ=255) accaccGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCa > 1:1282038/1‑140 (MQ=255) ccaccGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCaa < 2:879958/140‑1 (MQ=255) caccGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCaaa > 2:724026/1‑140 (MQ=255) caccGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCaaa > 2:190352/1‑140 (MQ=255) accGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAAc < 1:1182675/140‑1 (MQ=255) ccGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACa > 2:1217181/1‑140 (MQ=255) gCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAgg > 1:1143570/1‑140 (MQ=255) gCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAgg > 1:1048539/1‑140 (MQ=255) cAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgt < 2:767482/140‑1 (MQ=255) aGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgtc > 1:204240/1‑140 (MQ=255) aGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAG‑‑‑AACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgtcgtc > 2:1032504/1‑140 (MQ=255) gTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgtcg < 1:152801/140‑1 (MQ=255) gTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgtcg > 1:145677/1‑140 (MQ=255) gTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgtcg > 1:633100/1‑140 (MQ=255) gTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgtcg > 1:584577/1‑140 (MQ=255) tAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGgtcgt < 1:190352/140‑1 (MQ=255) ttACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCaa < 2:921403/140‑1 (MQ=255) tACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCaaa < 1:1186033/140‑1 (MQ=255) cGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACa < 2:406503/140‑1 (MQ=255) gACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAg > 2:1112012/1‑140 (MQ=255) gACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAg > 2:1416851/1‑140 (MQ=255) gACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAg > 2:337984/1‑140 (MQ=255) cTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACATCTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGGCAGCAAACAGGtt < 2:1179691/140‑1 (MQ=255) tCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTc > 1:1355031/1‑140 (MQ=255) cTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTgg > 2:1429535/1‑140 (MQ=255) cTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAG‑‑‑AACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 1:1032504/140‑1 (MQ=255) gggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGtt < 1:1436762/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACATCAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 2:227975/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 1:732545/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 2:145677/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 2:584577/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 2:204240/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 1:22877/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 1:197911/140‑1 (MQ=255) ggTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGttt < 1:950389/140‑1 (MQ=255) gTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTa < 2:844255/140‑1 (MQ=255) caTTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCt > 1:1386410/1‑140 (MQ=255) aTTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAATAACAACTGATTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGGCGTCAGCAAACAGGTTCTGGGTTAGGCtt > 2:1348603/1‑140 (MQ=255) aTTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCtt > 1:536824/1‑140 (MQ=255) aTTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCtt > 1:1256040/1‑140 (MQ=255) aTTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCtt > 1:715054/1‑140 (MQ=255) ttGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTa < 1:700749/140‑1 (MQ=255) tgatgaCAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTaa < 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< 1:1275468/140‑1 (MQ=255) cACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCaa > 2:475319/1‑140 (MQ=255) cGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAg > 1:1320289/1‑140 (MQ=255) cTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGaa < 1:337984/140‑1 (MQ=255) aTCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGaattaat < 1:324407/140‑1 (MQ=255) aTCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGaattaat < 1:1416851/140‑1 (MQ=255) aTCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGaattaat < 2:586682/140‑1 (MQ=255) aTCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGaattaat < 1:728657/140‑1 (MQ=255) aaaTGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAGGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTaaa > 2:1199896/1‑140 (MQ=255) gACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAG‑‑‑AACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGc > 2:384484/1‑140 (MQ=255) gACGATTATGGATTCCGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAata > 1:411173/1‑140 (MQ=255) cGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATg < 1:724026/140‑1 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1:647053/140‑1 (MQ=255) tGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGt > 1:773436/1‑140 (MQ=255) aGTGGATTATCGCAGGAGGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCAtt < 1:1199896/140‑1 (MQ=255) gTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTa < 1:487138/140‑1 (MQ=255) gTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTAAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTa < 2:536824/140‑1 (MQ=255) ttATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAg < 1:977591/140‑1 (MQ=255) ttATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAg > 1:626171/1‑140 (MQ=255) cGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCAt < 2:626171/140‑1 (MQ=255) gCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATc < 1:1217181/140‑1 (MQ=255) cAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGTAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATcc > 1:860753/1‑140 (MQ=255) cAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATcc > 1:1410677/1‑140 (MQ=255) aGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCa < 1:93465/140‑1 (MQ=255) ggAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACA‑GTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAgg > 2:85570/1‑140 (MQ=255) aagaaCAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGc < 2:794187/140‑1 (MQ=255) agaaCAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCa < 1:1112012/140‑1 (MQ=255) aacaacaacaacTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATa > 1:284650/1‑140 (MQ=255) | ATTTACTGAGTAATGCTCTCAAATTTACCACCGAGGGGGCAGTAAAAATTACGACCTCCCTGGGTCACATTGATGACAACCACGCTGTTATCAAAATGACGATTATGGATTCTGGAAGTGGATTATCGCAGGAAGAACAACAACAACTGTTTAAACGCTACAGCCAAACAAGTGCAGGTCGTCAGCAAACAGGTTCTGGTTTAGGCTTAATGATCTGCAAAGAATTAATTAAAAATATGCAGGGCGATTTGTCATTAGAAAGTCATCCAGGCATA > NC_000913/2486877‑2487151 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |