New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 226685 | 52 (0.380) | 8 (0.060) | 7/264 | 8.3 | 14.0% | noncoding (927/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
? | NC_000913 | 2728336 = | NA (NA) | noncoding (849/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/226542‑226685 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccggag‑aTGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC > NC_000913/2728336‑2728474 GGCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCG < 2:1570369/140‑1 GGCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCG < 1:1930561/140‑1 GCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGG < 1:1014425/140‑1 GCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGG > 2:1138415/1‑140 GCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGG < 2:1171862/140‑1 GCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGG < 1:602460/140‑1 GCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGG < 1:1191583/140‑1 CCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCAGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGA < 2:1342541/140‑1 CAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG < 1:38528/140‑1 CAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG > 2:234500/1‑140 AATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑A > 2:1382362/1‑140 TCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTG > 2:2162445/1‑140 CGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCC > 2:1077977/1‑140 GGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCT > 2:441745/1‑140 ACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAA > 2:598724/1‑140 ACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAA > 1:1687728/1‑140 ACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAA < 1:1077977/140‑1 ACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATT > 2:1313977/1‑140 CGAATACCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAG < 1:1313977/140‑1 gCGGAG‑ATGAACTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 2:2079446/2‑140 CCGGAG‑ATGTATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 1:2282244/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 1:26992/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 1:2288686/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 2:1733767/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 2:1801964/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 1:84627/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 2:20741/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 1:1022523/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 1:1515392/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 2:360821/1‑140 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG < 2:1045310/140‑1 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGT > 1:65270/1‑135 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGT < 2:65270/135‑1 CCGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTAGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTG > 2:1790297/1‑140 CGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGT < 1:1845287/140‑1 CGGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGT > 2:85581/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:678617/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:709345/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT < 1:880168/140‑1 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:2137582/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:1052253/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 2:1552588/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:219785/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:1082037/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:1859415/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 2:1877851/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 2:2025772/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:1586839/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 2:2172405/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 2:374335/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTT > 1:1359769/1‑140 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGT < 1:1022025/133‑1 GGAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGT > 2:1022025/1‑133 GAG‑ATGAATTCATGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTA > 2:324036/1‑140 GAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTA > 2:378319/1‑140 GAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTA > 2:315211/1‑140 GAG‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTA > 1:1724830/1‑140 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGCGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC > 2:245218/1‑140 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 1:32031/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 1:1635939/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 1:1654570/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 2:641415/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC > 1:1803700/1‑140 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 2:2233168/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 2:2240541/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 1:1510003/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 1:2229669/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC > 2:1575464/1‑140 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC > 1:477626/1‑140 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 1:11431/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 2:87764/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC < 1:51062/140‑1 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACC > 1:1442787/1‑140 G‑ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCA‑CCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:1415525/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCGCCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1876409/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCGCCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1796648/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCTACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1007771/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:470518/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:1306726/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:115157/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:1146475/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:711149/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:903296/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:97407/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC > 1:1535166/1‑140 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:2217552/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:2213175/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1089094/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:1535832/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1902016/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:1964783/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:388059/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1442787/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1411954/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:913462/140‑1 ATGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 2:1082037/140‑1 GGCCAATCAAACCGGGAGATAGCTGGTTCTCCCCGAAAGCTATTTAGGTAGCGCCTCGTGAACTCATCTCCGGGGGTAGAGCACTGTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAG‑A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/226542‑226685 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccggag‑aTGAATTCACGAGGCGCTACCTAAATAGCTTTCGGGGAGAACCAGCTATCTCCCGGTTTGATTGGCCTTTCACCCCCAGCCACAAGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC > NC_000913/2728336‑2728474 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |