| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3844901 = | 161 (1.440) | coding (938/1767 nt) | adeD | adenine deaminase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
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1:925479/1‑140 (MQ=255) ccgccTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATg < 2:370120/140‑1 (MQ=255) cgccTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATgc > 1:1208913/1‑140 (MQ=255) tGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGt < 2:1181200/140‑1 (MQ=255) gAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGt < 1:938823/140‑1 (MQ=255) acaacaCAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCa < 1:385524/140‑1 (MQ=255) acaacaCAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAACAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCa < 2:79956/140‑1 (MQ=255) acaATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTg < 2:599013/140‑1 (MQ=255) acaATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTg > 2:1760464/1‑140 (MQ=255) caATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTgc > 1:1110719/1‑140 (MQ=255) aaTGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTgca < 2:1847830/140‑1 (MQ=255) tgtgCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTgcagc < 1:263701/140‑1 (MQ=255) tgtgCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTgcagc > 2:260073/1‑140 (MQ=255) gCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAgg < 1:366341/140‑1 (MQ=255) gCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAgg < 1:561854/140‑1 (MQ=255) gCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAgg > 1:749665/1‑140 (MQ=255) gCCGCTGCATGTAGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGGATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAgg > 2:1006807/1‑140 (MQ=255) cGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTa < 2:673954/140‑1 (MQ=255) cGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTa > 2:1878375/1‑140 (MQ=255) cGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTa > 2:1420660/1‑140 (MQ=255) gCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTAc > 1:1286183/1‑140 (MQ=255) gCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTAc > 2:106669/1‑140 (MQ=255) | CTGGCACCGTTGATCAACGAATTTAACAGCCCGCAATGCATGCTCTGTACCGATGACCGTAACCCGTGGGAGATCGCCCATGAAGGACACATCGATGCCTTAATTCGCCGCCTGATCGAACAACACAATGTGCCGCTGCATGTGGCATATCGCGTCGCCAGCTGGTCGACGGCGCGCCACTTTGGTCTGAATCACCTCGGCTTACTGGCACCCGGCAAGCAGGCCGATATCGTCCTGTTGAGCGATGCGCGTAAGGTCACGGTGCAGCAGGTAC > NC_000913/3844762‑3845035 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |