| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,745,397 | 0 | A | C | 25.4% | 95.0 / 12.2 | 55 | L198F (TTA→TTC) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/17); new base C (0/14); total (24/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.91e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGCT > NC_000913/3745258‑3745535 | cTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTTCCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTa > 2:537004/1‑140 (MQ=255) ttCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGGGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTAc > 1:444876/1‑140 (MQ=255) ttCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTAc > 1:1370488/1‑140 (MQ=255) tCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCGTTGCCCCTTGCATGATGATGGGCGCAAAGCTGATGCTTTCCTGGTGGGGGGAGGCCACTCGCCTTAATTTAcc > 2:372051/1‑140 (MQ=255) ttCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGc < 2:6427/140‑1 (MQ=255) ttCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGAAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGc < 2:1420689/140‑1 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCCGCa > 2:529638/1‑140 (MQ=255) tttATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTTCCTGGTGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTTATTTACCCCGCCAGCa > 2:1354129/1‑140 (MQ=255) tattatCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGGCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATG‑TTAACTGGGGGGGGGCGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCAGCaaaa > 2:648175/1‑140 (MQ=255) gttCGGCGTTGCCAGCCAATTACCCCTCCGAAAACCGTTTCTGGGGCGCCTTGCCCCCGGCAAGAGTATGGCCGCCCCTCGCATGCTTCCCTGGTGGTGCCCGGCCGCCCGCCTAAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCaa < 2:610766/139‑1 (MQ=255) cTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTAGGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGACGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCaa < 2:255902/140‑1 (MQ=255) ttCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAAc < 2:1336268/140‑1 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCGTTGTCCCTGGCATGATGATGGGGGCAACGCTTATTGTTTTCTGGGGGGGGTTGGCGAGGCGCCTTAATTTACCCCCCCCCCCAAAAGCGACg > 2:1278138/1‑140 (MQ=255) tCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTTCCCCCGGGATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCCGGGGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCCCCCGCAAAAAGCAAca > 2:1406316/1‑139 (MQ=255) cGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGc < 1:246014/140‑1 (MQ=255) cGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGc > 1:1123306/1‑140 (MQ=255) ttCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAgg < 2:788369/140‑1 (MQ=255) ttCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAgg < 2:1199378/140‑1 (MQ=255) ttATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCa < 2:1370488/140‑1 (MQ=255) ttATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCGGGCATGATGAGGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCAAGTCTCCTTATTTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCa < 2:399068/140‑1 (MQ=255) tATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCAc > 1:132693/1‑140 (MQ=255) aGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGGGGCAGGCCCGTCGCCTTAATTTACCCCCCCCGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAAACTGGCACTCtttttt > 2:824033/1‑138 (MQ=255) gTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTCCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGtc < 1:703360/140‑1 (MQ=255) tAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGTCCCCGGCCTGATGATTGGCGCAACCCTGGTGGCTACCTCGTGGGGGCAGGCCCGACGCCTTTAATTATCCCCCCAGCCAAAAACAACAATGCCGGGAAACTGGGCCTCTTTTTtct > 2:1328509/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGGAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTcc > 1:4334/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGGGGCAGGCCCGTCGCCTTAATTTACCCCGCCCGCAAAAAGCAACGATGCAGGGAATCTGGGCCTCTTTTGTCTcc > 2:1186595/1‑140 (MQ=255) aGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCCGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGGGGGGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCCCCAAAAAACAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTTTCTcc > 2:1292603/1‑140 (MQ=255) ttttATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTa < 1:1406316/139‑1 (MQ=255) tttATGGCGGGCATTTCCCCTGGGATGATGATGGGCGCCACGCTGATGCTTACCTGGGGGTGGGAGGGCAGGCGCCTTAATTTACCCCCCCAGCAAAAAGCAAAGATGCAGGAAAACTTGCACTCTTTTTTTTCCGGTAt > 2:604888/1‑140 (MQ=255) tttATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTAt > 1:533837/1‑140 (MQ=255) gCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgc < 2:1432430/140‑1 (MQ=255) ggggCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGgcg < 1:1292603/139‑1 (MQ=255) cccTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTttcttc < 1:448422/140‑1 (MQ=255) cccTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTttcttc < 2:444876/140‑1 (MQ=255) cTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCa < 1:1354129/140‑1 (MQ=255) cTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCa < 2:1123306/140‑1 (MQ=255) cTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCa < 1:651402/140‑1 (MQ=255) tGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAg > 2:996779/1‑140 (MQ=255) tGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAg > 1:353158/1‑140 (MQ=255) ggCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGt > 2:1041338/1‑140 (MQ=255) gCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGtc < 1:604888/140‑1 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTcatcat > 1:27905/1‑140 (MQ=255) atgatgGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGC‑ACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCatt > 2:73005/1‑140 (MQ=255) gggCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTg > 2:976459/1‑140 (MQ=255) gggCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTg > 2:109780/1‑140 (MQ=255) gggCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTg > 1:93520/1‑140 (MQ=255) gcAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCgg > 1:1297446/1‑140 (MQ=255) cAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCggg > 2:1342782/1‑140 (MQ=255) gATGCTTCCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCt < 1:1278138/140‑1 (MQ=255) gATGCTTCCCGGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCt < 2:93520/140‑1 (MQ=255) gATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCt < 2:416305/140‑1 (MQ=255) aTGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGgtttcccc > 2:743531/1‑135 (MQ=255) aTGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGccc > 1:40580/1‑138 (MQ=255) cTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTATCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 1:365663/140‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 2:132693/140‑1 (MQ=255) cTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCgg < 1:201013/140‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAGGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGc < 1:1331197/140‑1 (MQ=255) tACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGcc > 1:501760/1‑140 (MQ=255) tACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGCTTTCCTCCGGcc > 2:1178603/1‑140 (MQ=255) aCCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTTGCTCCCGccc > 2:332844/1‑139 (MQ=255) ggtggtggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTCCCGCCCGCCttgtt > 1:144747/1‑136 (MQ=255) gtggtggCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGGTTTGCTCCGGCCTGtttt > 2:471341/1‑139 (MQ=255) gggCCAGTCGCCTTAATTTCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCACTCCGGCCTGTTTACCCCTAcc < 2:4334/139‑1 (MQ=255) ccAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGaa > 1:1216540/1‑140 (MQ=255) agcccctttAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCCCTCTTTTGCCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGc < 2:1273625/133‑1 (MQ=255) aGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGCCCTGTTTACCCCCCCCGacac > 1:277896/1‑137 (MQ=255) gTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGcc < 1:537004/140‑1 (MQ=255) tAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCg < 1:481219/140‑1 (MQ=255) tttCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTtg < 1:1328509/140‑1 (MQ=255) tttCCCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTtg < 1:824033/140‑1 (MQ=255) tttACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTtg < 2:1216540/140‑1 (MQ=255) ttACCCCGCCAGCAAAAAGC‑ACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTtgct < 1:73005/140‑1 (MQ=255) | CTTCCATTCCGTTTATTATCTTCGGCGTTTCCAGCGGATTATCCATCAGTAAGCTGTTTATGGCGGGCATTGCCCCTGGCATGATGATGGGCGCAACGCTGATGCTTACCTGGTGGTGGCAGGCCAGTCGCCTTAATTTACCCCGCCAGCAAAAAGCAACGATGCAGGAAATCTGGCACTCTTTTGTCTCCGGTATCTGGGCGCTGTTTCTTCCAGTCATCATTATTGGCGGGTTTCGCTCCGGCCTGTTTACCCCTACCGAAGCCGGGGCCGTTGCT > NC_000913/3745258‑3745535 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |