New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1722616 = | 46 (0.720) | 3 (0.050) | 3/256 | 6.3 | 6.6% | coding (496/2013 nt) | ydhK | putative transporter YdhK |
? | NC_000913 | = 1722612 | 43 (0.730) | coding (492/2013 nt) | ydhK | putative transporter YdhK | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATG > NC_000913/1722477‑1722751 | gTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatga > 2:839982/1‑140 (MQ=255) gTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatga < 2:361642/140‑1 (MQ=255) gTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCatga > 1:941595/1‑140 (MQ=255) aaCTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATc < 2:499995/140‑1 (MQ=255) gggCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGCAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGa > 2:720712/1‑140 (MQ=255) ggCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAg < 1:1049569/140‑1 (MQ=255) ggCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAg < 1:714513/140‑1 (MQ=255) ccATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACt < 2:100925/140‑1 (MQ=255) tcatcGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACt < 2:779159/140‑1 (MQ=255) tcatcGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACt < 2:175643/140‑1 (MQ=255) tcatcGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACt < 1:539284/140‑1 (MQ=255) tcatcGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACt < 1:597697/140‑1 (MQ=255) atcGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCACTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGCATTTTGTACGGCGGAATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGGTCCGATGCTACTGc > 2:904180/1‑140 (MQ=255) cGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGccc > 1:639712/1‑140 (MQ=255) tttCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCtttt < 1:705364/140‑1 (MQ=255) aCTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCa < 1:12319/140‑1 (MQ=255) cTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACAta > 2:316617/1‑139 (MQ=255) cTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATg > 2:384930/1‑140 (MQ=255) tGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGc > 1:884068/1‑140 (MQ=255) aGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACTGCATTGAAAAACATGCAc > 2:291052/1‑140 (MQ=255) aGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCAc > 1:382824/1‑140 (MQ=255) gccagccaGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGc > 1:559332/1‑140 (MQ=255) gccagccaGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGc > 2:483369/1‑140 (MQ=255) gccagccaGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGc > 1:570112/1‑140 (MQ=255) gccagccaGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGc > 1:477943/1‑140 (MQ=255) gccagccaGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCC‑TTTAACCGCCTTTAAAAACATGGACGcc > 1:325294/1‑140 (MQ=255) gccagccaGCTGGGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGAAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGc > 2:445434/1‑140 (MQ=255) cagccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGccc < 2:12737/140‑1 (MQ=255) agccagcTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCg > 2:773579/1‑140 (MQ=255) tatCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATg < 1:430307/140‑1 (MQ=255) tatCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATg < 2:79139/140‑1 (MQ=255) tatCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATg < 2:907008/140‑1 (MQ=255) tCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGcc > 2:708187/1‑140 (MQ=255) gCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAg < 1:839982/140‑1 (MQ=255) tttGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGAATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAg < 1:186462/140‑1 (MQ=255) tGCGAGGTAATAGTCGATATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGcc > 2:230130/1‑140 (MQ=255) ggTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGaaa < 2:382824/140‑1 (MQ=255) gTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAaac < 2:646649/140‑1 (MQ=255) cGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATg < 1:440127/140‑1 (MQ=255) ggTATTTTGTGCGGCGGC‑‑‑ATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCAt > 2:879549/1‑140 (MQ=255) gTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGcc > 1:302432/1‑140 (MQ=255) tATTTTGTGCGGCGGCATGATGACGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCa > 1:654364/1‑140 (MQ=255) gtgCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTTCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTg < 1:922727/140‑1 (MQ=255) gtgCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTg < 2:763756/140‑1 (MQ=255) gtgCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTg < 1:720712/140‑1 (MQ=255) gtgCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTg > 1:225840/1‑140 (MQ=255) cggcATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGcac > 2:808354/1‑140 (MQ=255) cATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATg < 1:230130/140‑1 (MQ=255) cATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATg < 1:483369/140‑1 (MQ=255) | GTATGCATTTCAACTGGCGGGCTACACGGCTGCCATCATCGCCTTTCCGATGGTTAATATTACTGAGGCCAGCCAGCTGTGGGATATCGCTCAGGCGCGCGTTTGCGAGGTAATAGTCGGTATTTTGTGCGGCGGCATGATGATGATGATCCTGCCGAGCAGTTCCGATGCTACTGCCCTTTTAACCGCATTGAAAAACATGCACGCCCGATTACTGGAACATGCCAGTTTACTCTGGCAGCCTGAAACAACCGATGCCATTCGTGCAGCACATG > NC_000913/1722477‑1722751 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |