| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 29,496 | 0 | T | A | 39.6% | 72.6 / 34.9 | 53 | intergenic (+301/‑155) | dapB/carA | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase/carbamoyl phosphate synthetase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/1); new base A (0/21); total (31/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.92e-14 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAAT > NC_000913/29358‑29633 | tttGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAAtata > 2:17243/1‑140 (MQ=255) tGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaa > 2:525142/1‑140 (MQ=255) aCCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATaaaaa > 1:195288/1‑140 (MQ=255) tttGGCCCATTTTTTTCTGCTTTTTTTTATTTCATGCAATTTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATTTTTTTGTCGCTAAATGCCTAAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑cc < 2:1096750/140‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTa > 2:1367519/1‑140 (MQ=255) cTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACtttt > 1:882611/1‑140 (MQ=255) gTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgc > 2:113246/1‑140 (MQ=255) ttttttttTCATCCATTTTTCTTGCTGCGCAAGCTTTTTCAAAAACGGGTTAGATTTTTTTTTTGTCGTTTAATGCCTAAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAgcg < 2:1253460/140‑1 (MQ=255) tGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTcc > 2:1079258/1‑140 (MQ=255) gcgcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGttt > 1:1242252/1‑140 (MQ=255) gcgcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGttt > 2:1273485/1‑140 (MQ=255) cgcAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTg > 1:410955/1‑140 (MQ=255) ttCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtc > 2:1062384/1‑140 (MQ=255) cAGAAGAGTTTAAATGATCTTTTTGACAGTTAACCCTTAAAAAACATGCATGAGCAAAAAAATAAAAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtc < 2:1429049/140‑1 (MQ=255) aGAACAGTTTAGATTTTTTTTTTGTCGTTTAATGCTTAAAAAACATGCATGACCAAAAAAAAAATAAAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATtcgtcg < 2:742984/140‑1 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 1:1332221/1‑140 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 1:644984/1‑140 (MQ=255) gTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCa > 2:1446403/1‑140 (MQ=255) tAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGa > 2:890634/1‑140 (MQ=255) aaGATGTTTTTTTTGCCGTTTAATGCCTAAAAAACATGCAGGACCCAAAAAATAATAAAAAAACT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGa < 2:253305/139‑1 (MQ=255) aGATGATTTTTTTGTCGCTTAATGCCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAt < 1:907397/140‑1 (MQ=255) atgatCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGAttt > 2:677853/1‑140 (MQ=255) gttCTTTTTGTCCTTAAATGCCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGc < 1:475854/138‑1 (MQ=255) ttttttttGTCGTTTAATGCCTGAAAAATGTACAAGAGCCACAAAATAATATAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCa < 2:478705/137‑1 (MQ=255) ttttttttGTCGCTTAATGCCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCa < 1:1366699/137‑1 (MQ=255) ttttttttGTCCTTTAATGCTTGAAAAACAGGCATGACCCACAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCa < 1:1081052/137‑1 (MQ=255) cTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt > 2:989535/1‑140 (MQ=255) cTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCAtt > 1:667192/1‑140 (MQ=255) gCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGt > 2:859832/1‑140 (MQ=255) tttAATGCCTGAAAAACATACATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc < 1:179392/139‑1 (MQ=255) cTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtc > 2:458328/1‑140 (MQ=255) ttATTGCCTAAAAAACAGGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtca < 2:791753/140‑1 (MQ=255) tAATGCCTGAAAAACATGCATGACCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcat < 1:40382/140‑1 (MQ=255) aTGCCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAAAAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGtcatca < 1:278758/140‑1 (MQ=255) gCCTGAAAAACATGCATGAGCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCAtt < 1:177186/140‑1 (MQ=255) taaaaaaCATGCATGAGCCACAAAATAATAAAAAAATG‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGTGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATtgtg < 2:64063/137‑1 (MQ=255) gTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGa > 2:1084097/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 2:224848/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 2:549534/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 1:1400759/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 1:1205222/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 1:1561272/1‑140 (MQ=255) tAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGaa > 1:1459950/1‑140 (MQ=255) aCATGAATGAGCAAAAAAATAATAAAAAAACC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTaa < 2:1511864/140‑1 (MQ=255) atgcatgAGCCAAAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 1:236762/140‑1 (MQ=255) atgcatgACCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 1:851253/140‑1 (MQ=255) atgaatgaCCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAata < 2:644984/140‑1 (MQ=255) acgaatgACCCAAAAAAAAAAAAAAAAACC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCTAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAgta < 2:1332221/136‑1 (MQ=255) gcatgACCCAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg < 1:983515/140‑1 (MQ=255) gcatgACCAAAAAAATAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg < 2:23235/140‑1 (MQ=255) gcaggAGCAAAAAAATAATAAAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg < 1:1367519/140‑1 (MQ=255) gaatgACCCAAAAAAAAATAAAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATg < 2:195288/138‑1 (MQ=255) gccccAAAAAATAAAATAAAAACT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCaaa < 1:113246/137‑1 (MQ=255) acaAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag > 1:499259/1‑140 (MQ=255) acaAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCACCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag > 2:1058201/1‑140 (MQ=255) aaaaaaTAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAag < 2:727029/138‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaaaaaTCCCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagt < 2:882611/140‑1 (MQ=255) aaaaTAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg > 1:1242738/1‑140 (MQ=255) aaaaTAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg > 1:98626/1‑140 (MQ=255) aaaaTAATAAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg < 1:553890/140‑1 (MQ=255) aaaaTAATAAAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg < 2:412711/140‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAAAAAAACC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg < 2:1400759/140‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAAAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtg < 2:688058/140‑1 (MQ=255) aataatAAAAAAACT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 2:326240/140‑1 (MQ=255) aataaaAAAAAAAAC‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAagtgag < 2:410955/140‑1 (MQ=255) taataTAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATATagtgagtg > 1:825547/1‑140 (MQ=255) aataAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAgtgagtga < 1:552020/140‑1 (MQ=255) aataAAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAgtgagtga < 2:359191/140‑1 (MQ=255) atatAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGaa > 1:129954/1‑140 (MQ=255) tataAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat > 1:901227/1‑140 (MQ=255) tataAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAat < 1:1079258/140‑1 (MQ=255) | TTTGACCATTTGGTCCACTTTTTTCTGCTCGTTTTTATTTCATGCAATCTTCTTGCTGCGCAAGCGTTTTCCAGAACAGGTTAGATGATCTTTTTGTCGCTTAATGCCTGTAAAACATGCATGAGCCACAAAATAATATAAAAAAT‑CCCGCCATTAAGTTGACTTTTAGCGCCCATATCTCCAGAATGCCGCCGTTTGCCAGAAATTCGTCGGTAAGCAGATTTGCATTGATTTACGTCATCATTGTGAATTAATATGCAAATAAAGTGAGTGAAT > NC_000913/29358‑29633 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |